21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1782 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1782  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  293  7e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.92731  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2143  hypothetical protein  40.58 
 
 		 344 aa  89.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0705369  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1834  hypothetical protein  39.39 
 
 		 339 aa  88.6  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.434531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2157  TPR repeat-containing protein  37.23 
 
 		 359 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2059  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.96 
 
 		 360 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  29.41 
 
 		 1138 aa  50.4  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.33 
 
 		 296 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 		 713 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41490  hypothetical protein  28.95 
 
 		 520 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.510625  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2282  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 433 aa  44.3  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.883499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  27.56 
 
 		 562 aa  44.3  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1212  TPR domain-containing protein  34.12 
 
 		 337 aa  43.9  0.0007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.835664 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4981  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.79 
 
 		 384 aa  41.6  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1011  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 		 800 aa  41.2  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.926102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  28.72 
 
 		 1979 aa  41.6  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  27.68 
 
 		 556 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4101  response regulator receiver:tetratricopeptide TPR_4  39.34 
 
 		 572 aa  40.8  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 		 645 aa  40.4  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000607684  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1107  TPR domain protein  26.79 
 
 		 575 aa  40.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  28.09 
 
 		 466 aa  40  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2370  TPR repeat-containing protein  30.99 
 
 		 1272 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0364694 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>