21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1317 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1317  zinc finger SWIM domain-containing protein  100 
 
 
432 aa  877    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0899  hypothetical protein  55.35 
 
 
641 aa  443  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1893  hypothetical protein  50.18 
 
 
507 aa  271  2e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00616409  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0735  hypothetical protein  28.96 
 
 
639 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0250  zinc finger SWIM domain protein  38.64 
 
 
580 aa  59.3  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2013  zinc finger SWIM domain-containing protein  23.13 
 
 
608 aa  56.6  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.450022 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0118  zinc finger SWIM domain protein  46.51 
 
 
848 aa  55.5  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.428898  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0165  zinc finger SWIM domain protein  40.74 
 
 
266 aa  53.9  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1131  zinc finger SWIM domain protein  40.74 
 
 
266 aa  53.1  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1485  zinc finger SWIM domain protein  32.04 
 
 
656 aa  52  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3437  zinc finger SWIM domain-containing protein  38.55 
 
 
142 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0547  hypothetical protein  35.96 
 
 
640 aa  52.4  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2883  zinc finger SWIM domain protein  42.17 
 
 
273 aa  51.2  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1036  SNF2 helicase associated domain-containing protein  39.47 
 
 
832 aa  50.8  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0990  zinc finger SWIM domain-containing protein  42.05 
 
 
611 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1179  hypothetical protein  30.77 
 
 
570 aa  49.3  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0899  zinc finger SWIM domain protein  40.17 
 
 
603 aa  46.2  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.727484  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2647  zinc finger SWIM domain protein  36.26 
 
 
222 aa  45.8  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.714804 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1928  SWIM Zn-finger  30.77 
 
 
613 aa  43.9  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.366569  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  35.29 
 
 
1084 aa  43.5  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  36.67 
 
 
1100 aa  43.5  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>