27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0937 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0937  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  301  2.0000000000000002e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.753125  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3519  hypothetical protein  37.5 
 
 
165 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1644  hypothetical protein  28.45 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.25271  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2636  protein of unknown function DUF1486  27.68 
 
 
128 aa  53.9  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000287228  hitchhiker  0.00453298 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4013  hypothetical protein  27.59 
 
 
131 aa  53.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.772114  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3504  hypothetical protein  27.56 
 
 
129 aa  51.6  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501161  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4862  hypothetical protein  27.43 
 
 
128 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711922  normal  0.253154 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4728  hypothetical protein  27.68 
 
 
134 aa  50.4  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.467083  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3154  hypothetical protein  25.89 
 
 
120 aa  47.8  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.34037  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0376  Limonene-12-epoxide hydrolase  26.79 
 
 
137 aa  47.4  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.378531  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1830  hypothetical protein  24.79 
 
 
128 aa  47  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.126678  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2095  hypothetical protein  29.13 
 
 
150 aa  47  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.598281  normal  0.183758 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3369  hypothetical protein  36.36 
 
 
131 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.915691  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3420  hypothetical protein  36.36 
 
 
131 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326133  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3358  hypothetical protein  36.36 
 
 
131 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.8978  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4515  hypothetical protein  24.3 
 
 
134 aa  44.7  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.275606 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1992  hypothetical protein  22.43 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.209953  normal  0.907507 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1443  hypothetical protein  33.33 
 
 
125 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4124  hypothetical protein  36.51 
 
 
124 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6225  hypothetical protein  21.31 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0684  putative taurine dehydrogenase, small subunit  24.3 
 
 
136 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3697  steroid delta-isomerase domain-containing protein  33.33 
 
 
112 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0993  hypothetical protein  30.53 
 
 
133 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4362  protein of unknown function DUF1486  23.36 
 
 
136 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.364126 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4499  hypothetical protein  27.03 
 
 
116 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3346  hypothetical protein  33.77 
 
 
127 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1031  hypothetical protein  27.73 
 
 
149 aa  40.4  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.95008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>