21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_3346 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_3346  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  263  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0993  hypothetical protein  96.06 
 
 		 133 aa  255  1e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1026  hypothetical protein  96.06 
 
 		 149 aa  254  3e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1014  hypothetical protein  94.34 
 
 		 131 aa  191  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0858  hypothetical protein  86.67 
 
 		 118 aa  190  5e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3265  hypothetical protein  85.71 
 
 		 118 aa  190  7e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3697  steroid delta-isomerase domain-containing protein  84.76 
 
 		 112 aa  188  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3164  hypothetical protein  85.71 
 
 		 118 aa  189  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3515  hypothetical protein  57.14 
 
 		 154 aa  136  7.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0214  steroid delta-isomerase domain-containing protein  57.73 
 
 		 112 aa  115  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0907855  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0169  steroid delta-isomerase domain-containing protein  52.53 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000661955  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2083  steroid delta-isomerase domain-containing protein  50.49 
 
 		 111 aa  103  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2801  amidohydrolase  34.31 
 
 		 585 aa  75.1  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4181  hypothetical protein  39.6 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.458252 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2832  hypothetical protein  39.36 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151982  normal  0.205278 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4603  hypothetical protein  36.73 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2093  amidohydrolase  37.21 
 
 		 568 aa  55.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.351411  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3906  GGDEF  33.63 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1043  hypothetical protein  38.81 
 
 		 125 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0111  steroid delta-isomerase domain-containing protein  31.78 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.586204  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0937  hypothetical protein  33.77 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.753125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>