18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0858 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0858  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  244  4e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3164  hypothetical protein  99.15 
 
 		 118 aa  243  9e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3265  hypothetical protein  97.46 
 
 		 118 aa  239  1e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0993  hypothetical protein  86.49 
 
 		 133 aa  202  9e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3697  steroid delta-isomerase domain-containing protein  85.59 
 
 		 112 aa  201  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1026  hypothetical protein  84.68 
 
 		 149 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3346  hypothetical protein  86.67 
 
 		 127 aa  190  6e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1014  hypothetical protein  84.96 
 
 		 131 aa  184  4e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3515  hypothetical protein  56.64 
 
 		 154 aa  147  6e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0214  steroid delta-isomerase domain-containing protein  53.4 
 
 		 112 aa  112  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0907855  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0169  steroid delta-isomerase domain-containing protein  49.53 
 
 		 112 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000661955  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2083  steroid delta-isomerase domain-containing protein  50 
 
 		 111 aa  108  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2801  amidohydrolase  33.33 
 
 		 585 aa  71.2  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4181  hypothetical protein  37.74 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.458252 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4603  hypothetical protein  34.91 
 
 		 112 aa  63.5  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2832  hypothetical protein  41.05 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151982  normal  0.205278 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2093  amidohydrolase  31.53 
 
 		 568 aa  55.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.351411  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3906  GGDEF  33.64 
 
 		 120 aa  48.1  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>