21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3515 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3515  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  320  3e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1026  hypothetical protein  58.56 
 
 		 149 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0858  hypothetical protein  56.64 
 
 		 118 aa  147  6e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3265  hypothetical protein  55.75 
 
 		 118 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3697  steroid delta-isomerase domain-containing protein  58.18 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3164  hypothetical protein  55.75 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0993  hypothetical protein  54.95 
 
 		 133 aa  143  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3346  hypothetical protein  57.14 
 
 		 127 aa  136  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1014  hypothetical protein  51.15 
 
 		 131 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0214  steroid delta-isomerase domain-containing protein  46.23 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0907855  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0169  steroid delta-isomerase domain-containing protein  47.62 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000661955  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2083  steroid delta-isomerase domain-containing protein  44.95 
 
 		 111 aa  97.8  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2801  amidohydrolase  38.05 
 
 		 585 aa  84.3  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4181  hypothetical protein  35.19 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.458252 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2832  hypothetical protein  42 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151982  normal  0.205278 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2093  amidohydrolase  35.04 
 
 		 568 aa  56.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.351411  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4603  hypothetical protein  32.38 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3906  GGDEF  33.64 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0111  steroid delta-isomerase domain-containing protein  36.27 
 
 		 116 aa  48.9  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.586204  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0226  hypothetical protein  33.82 
 
 		 121 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0951  hypothetical protein  24.46 
 
 		 174 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>