21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_1026 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1026  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  310  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0993  hypothetical protein  94.74 
 
 
133 aa  266  1e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3346  hypothetical protein  96.06 
 
 
127 aa  254  3e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1014  hypothetical protein  86.89 
 
 
131 aa  203  8e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3697  steroid delta-isomerase domain-containing protein  83.78 
 
 
112 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0858  hypothetical protein  84.68 
 
 
118 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3265  hypothetical protein  83.78 
 
 
118 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3164  hypothetical protein  83.78 
 
 
118 aa  197  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3515  hypothetical protein  58.56 
 
 
154 aa  149  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0214  steroid delta-isomerase domain-containing protein  58.42 
 
 
112 aa  121  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0907855  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0169  steroid delta-isomerase domain-containing protein  53.4 
 
 
112 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000661955  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2083  steroid delta-isomerase domain-containing protein  50.93 
 
 
111 aa  110  8.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2801  amidohydrolase  36.54 
 
 
585 aa  77  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4181  hypothetical protein  38.32 
 
 
108 aa  72  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.458252 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2832  hypothetical protein  41.05 
 
 
110 aa  66.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151982  normal  0.205278 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4603  hypothetical protein  34.62 
 
 
112 aa  60.8  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2093  amidohydrolase  33.64 
 
 
568 aa  58.9  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.351411  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3906  GGDEF  33.91 
 
 
120 aa  53.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0111  steroid delta-isomerase domain-containing protein  32.71 
 
 
116 aa  45.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.586204  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1043  hypothetical protein  38.81 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0340  hypothetical protein  28.91 
 
 
154 aa  40.4  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0049422  normal  0.432504 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>