23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3697 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3697  steroid delta-isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 112 aa  235  2e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3265  hypothetical protein  85.59 
 
 		 118 aa  201  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0858  hypothetical protein  85.59 
 
 		 118 aa  201  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3164  hypothetical protein  84.68 
 
 		 118 aa  199  8e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1026  hypothetical protein  83.78 
 
 		 149 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0993  hypothetical protein  82.88 
 
 		 133 aa  197  3e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3346  hypothetical protein  84.76 
 
 		 127 aa  188  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1014  hypothetical protein  81.98 
 
 		 131 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3515  hypothetical protein  58.18 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0214  steroid delta-isomerase domain-containing protein  54.46 
 
 		 112 aa  114  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0907855  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2083  steroid delta-isomerase domain-containing protein  49.54 
 
 		 111 aa  111  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0169  steroid delta-isomerase domain-containing protein  50.47 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000661955  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4181  hypothetical protein  38.1 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.458252 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2832  hypothetical protein  38.14 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151982  normal  0.205278 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2801  amidohydrolase  28.3 
 
 		 585 aa  67.8  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4603  hypothetical protein  35.85 
 
 		 112 aa  67  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2093  amidohydrolase  33.01 
 
 		 568 aa  57.8  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.351411  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3906  GGDEF  35.78 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0930  putative lipoprotein  32 
 
 		 179 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4545  hypothetical protein  29.2 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.346797  normal  0.0101893 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0741  hypothetical protein  32 
 
 		 182 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0937  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.753125  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0749  hypothetical protein  32 
 
 		 179 aa  40.8  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>