19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3906 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3906  GGDEF  100 
 
 		 120 aa  248  2e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2083  steroid delta-isomerase domain-containing protein  35.45 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2832  hypothetical protein  36.45 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151982  normal  0.205278 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4181  hypothetical protein  34.62 
 
 		 108 aa  57  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.458252 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3697  steroid delta-isomerase domain-containing protein  35.78 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3515  hypothetical protein  33.64 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0111  steroid delta-isomerase domain-containing protein  34.23 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.586204  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1026  hypothetical protein  33.91 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2801  amidohydrolase  30.19 
 
 		 585 aa  52.4  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2093  amidohydrolase  35.24 
 
 		 568 aa  52.4  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.351411  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3346  hypothetical protein  33.63 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0169  steroid delta-isomerase domain-containing protein  33.96 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000661955  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0993  hypothetical protein  32.74 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1014  hypothetical protein  36.08 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0858  hypothetical protein  33.64 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0214  steroid delta-isomerase domain-containing protein  31.19 
 
 		 112 aa  47.4  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0907855  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3265  hypothetical protein  32.73 
 
 		 118 aa  47  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3164  hypothetical protein  32.73 
 
 		 118 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4603  hypothetical protein  33.33 
 
 		 112 aa  45.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.156395 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>