293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0698 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0698  ribosomal protein L30  100 
 
 		 58 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.298561  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0304  ribosomal protein L30  64.15 
 
 		 59 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00111257  normal  0.144172 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5177  50S ribosomal protein L30  57.89 
 
 		 60 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138401  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0123  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 60 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000032367  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0128  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 60 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603924  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0128  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 60 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000211905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0124  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 60 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000437518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0122  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 60 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000462232  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0128  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 60 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0149  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 60 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00257055  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0159  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 60 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00008814  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0140  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 60 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.71148e-62 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0515  50S ribosomal protein L30  60 
 
 		 61 aa  69.7  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0181031  unclonable  0.0000000000137591 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0345  50S ribosomal protein L30  60 
 
 		 61 aa  69.7  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0122  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 60 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000141296  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1364  ribosomal protein L30  57.89 
 
 		 58 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000295854  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0644  50S ribosomal protein L30  59.65 
 
 		 59 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000104871  hitchhiker  0.000000231079 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2839  50S ribosomal protein L30  57.89 
 
 		 59 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0233  50S ribosomal protein L30  58.49 
 
 		 59 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000351817  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3320  50S ribosomal protein L30  56.86 
 
 		 60 aa  65.1  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00901204  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0129  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 62 aa  63.9  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.64876  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2315  ribosomal protein L30  43.86 
 
 		 60 aa  63.5  0.0000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0059609  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0125  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 62 aa  62.8  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1813  50S ribosomal protein L30  56.6 
 
 		 60 aa  63.5  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0971  50S ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 61 aa  63.2  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2307  50S ribosomal protein L30  56.36 
 
 		 60 aa  63.2  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.227659  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0391  50S ribosomal protein L30  54.55 
 
 		 60 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000847959  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0860  ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 66 aa  62  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2300  50S ribosomal protein L30  52.83 
 
 		 59 aa  61.6  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.818228  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3465  50S ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 60 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0155512  normal  0.071059 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5052  50S ribosomal protein L30  54.55 
 
 		 61 aa  61.2  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0761193  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0294  50S ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 60 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000487608  normal  0.0630356 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2741  50S ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 60 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0301719  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0285  50S ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 60 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.104363  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0345  50S ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 60 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123094  normal  0.0645299 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0366  50S ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 60 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139804  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0267  50S ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 63 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.16996  hitchhiker  0.00743529 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2259  50S ribosomal protein L30  52.83 
 
 		 59 aa  61.6  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00380843  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3728  50S ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 60 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00881974  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1942  50S ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 60 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.428807  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2614  50S ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 60 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177274  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3786  50S ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 60 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3758  50S ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 60 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0279178  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3050  50S ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 60 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0897802  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3496  50S ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 60 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.943573  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2821  50S ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 60 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238696  normal  0.243188 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3151  50S ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 60 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0153482  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0399  50S ribosomal protein L30  54.55 
 
 		 60 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.894889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3626  50S ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 60 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000585179  hitchhiker  0.0000000000133791 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0332  50S ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 60 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00936849  decreased coverage  0.00323406 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0619  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 60 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.268532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0719  ribosomal protein L30  56.36 
 
 		 59 aa  60.5  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.545555  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3299  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  60.8  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2932  50S ribosomal protein L30  48.15 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000405636 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3161  50S ribosomal protein L30  48.15 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00158521  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3931  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1120  50S ribosomal protein L30  46.3 
 
 		 61 aa  60.1  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.481118  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1889  50S ribosomal protein L30  52.83 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3279  50S ribosomal protein L30  48.15 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0271147  hitchhiker  0.00015076 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1376  50S ribosomal protein L30  53.7 
 
 		 67 aa  59.3  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0327114  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0297  50S ribosomal protein L30P  54.72 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000000859668  hitchhiker  0.00000207421 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4297  50S ribosomal protein L30  48.15 
 
 		 60 aa  58.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1310  50S ribosomal protein L30  53.7 
 
 		 67 aa  59.3  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988415  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3310  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 59 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000129618 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3001  50S ribosomal protein L30  49.06 
 
 		 60 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0537795  normal  0.0504923 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0076  50S ribosomal protein L30  52.83 
 
 		 59 aa  58.5  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.663543  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0951  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 59 aa  58.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0200139  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3905  50S ribosomal protein L30  48.15 
 
 		 60 aa  58.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0899974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0324  50S ribosomal protein L30P  49.06 
 
 		 60 aa  58.5  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151243 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1040  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 60 aa  58.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0337  50S ribosomal protein L30  49.06 
 
 		 60 aa  57.8  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000664675  unclonable  0.000000038279 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4225  ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  57.8  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00829354  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0645  ribosomal protein L30  49.06 
 
 		 60 aa  57.8  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2442  50S ribosomal protein L30P  49.12 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0619  ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 61 aa  57.4  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.191878  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2693  ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 62 aa  57  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1084  50S ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 59 aa  57  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.055199  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1854  ribosomal protein L30  56.86 
 
 		 59 aa  57  0.00000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000293494  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0313  ribosomal protein L30  54.9 
 
 		 65 aa  57  0.00000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00845621  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0785  ribosomal protein L30  50.98 
 
 		 62 aa  57  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000912341  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0580  50S ribosomal protein L30  45.28 
 
 		 65 aa  57  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.868195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2306  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 62 aa  56.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173673  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3425  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.187681 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0068  50S ribosomal protein L30  47.17 
 
 		 62 aa  56.2  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.02253  hitchhiker  0.000000000000613726 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0071  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 62 aa  56.6  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.230621  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0440  50S ribosomal protein L30  49.06 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0733  ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 62 aa  56.6  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0476  50S ribosomal protein L30P  47.17 
 
 		 62 aa  56.6  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3006  50S ribosomal protein L30  46 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.319275  hitchhiker  0.00803225 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4489  ribosomal protein L30  45.28 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0423  50S ribosomal protein L30  52.94 
 
 		 61 aa  55.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.60192  normal  0.209018 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0855  50S ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 58 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.342105  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0600  50S ribosomal protein L30  47.17 
 
 		 61 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0840  50S ribosomal protein L30  47.17 
 
 		 62 aa  55.5  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0423  50S ribosomal protein L30  43.86 
 
 		 59 aa  55.5  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0858998  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06430  50S ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 58 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.340792  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09030  50S ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 58 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0258453  normal  0.264293 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3506  ribosomal protein L30  46.3 
 
 		 58 aa  55.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000460865  hitchhiker  0.000000075211 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0341  50S ribosomal protein L30  42.11 
 
 		 59 aa  55.1  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00191247  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1167  50S ribosomal protein L30  43.4 
 
 		 78 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00970814  normal  0.0899698 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>