22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2923 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2923  ribonuclease P  100 
 
 		 136 aa  278  2e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000863254  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2337  ribonuclease P  50.76 
 
 		 140 aa  123  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2563  ribonuclease P  45.61 
 
 		 118 aa  107  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2742  ribonuclease P  47.06 
 
 		 146 aa  102  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2131  ribonuclease P  48.39 
 
 		 122 aa  100  6e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532091  normal  0.558429 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2523  ribonuclease P  43.7 
 
 		 136 aa  95.9  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.525376  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2032  ribonuclease P  44.3 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0097  RNase P protein, subunit A  41.46 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637511 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3851  ribonuclease P protein component  35.29 
 
 		 152 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.747889 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0970  ribonuclease P protein component  41.77 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1040  ribonuclease P protein component  37.35 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000299838  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0718  ribonuclease P protein component  34.62 
 
 		 126 aa  47.4  0.00006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  35.87 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  35.87 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27050  predicted protein  28.06 
 
 		 164 aa  44.7  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.121605  hitchhiker  0.000860128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3922  hypothetical protein  34.02 
 
 		 126 aa  44.3  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.220909  normal  0.393919 
 
 
-
 
NC_002950  PG0201  ribonuclease P  31.82 
 
 		 137 aa  44.3  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1544  ribonuclease P protein component  40.74 
 
 		 139 aa  44.3  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.290862 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03125  possible ribonuclease P component  30.53 
 
 		 123 aa  43.9  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.168885  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3609  ribonuclease P protein component  31.76 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2602  ribonuclease P protein component  27.27 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.201057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3088  ribonuclease P protein  27.55 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>