160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2752 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2752  C-20 methyltransferase BchU  100 
 
 		 339 aa  695    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2758  C-20 methyltransferase BchU  84.07 
 
 		 339 aa  591  1e-168  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.160488  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0115  CrtF-related protein  79.53 
 
 		 338 aa  568  1e-161  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2496  C-20 methyltransferase BchU  81.68 
 
 		 339 aa  566  1e-160  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.409107  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2103  CrtF-related protein  77.11 
 
 		 339 aa  545  1e-154  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2714  O-methyltransferase family protein  76.28 
 
 		 339 aa  535  1e-151  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0330772  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2253  C-20 methyltransferase BchU  70.03 
 
 		 339 aa  513  1e-144  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2512  C-20 methyltransferase BchU  70.92 
 
 		 339 aa  509  1e-143  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.669224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1211  C-20 methyltransferase BchU  46.71 
 
 		 354 aa  328  6e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.40685  normal  0.147915 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2087  hypothetical protein  30.1 
 
 		 373 aa  98.6  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2098  hypothetical protein  29.59 
 
 		 373 aa  97.4  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4672  O-methyltransferase family 2  27.78 
 
 		 344 aa  91.7  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2082  methyltransferase type 12  25.78 
 
 		 339 aa  87  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1906  hypothetical protein  29.44 
 
 		 630 aa  85.9  9e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0181  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  27.11 
 
 		 378 aa  85.5  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1917  hypothetical protein  29.23 
 
 		 630 aa  84.3  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0264  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  25.73 
 
 		 379 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1908  O-methyltransferase family protein  25.73 
 
 		 379 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0280821  normal  0.388188 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4597  O-methyltransferase family protein  24.62 
 
 		 353 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47611  normal  0.177854 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2071  O-methyltransferase family 2  25.23 
 
 		 335 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10577  methyltransferase  25.61 
 
 		 339 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.989872 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1815  O-methyltransferase family protein  22.63 
 
 		 367 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0388  O-methyltransferase  22.63 
 
 		 367 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0826087  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1178  O-methyltransferase family protein  26.67 
 
 		 344 aa  75.9  0.0000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1486  O-methyltransferase family protein  22.63 
 
 		 338 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2119  O-methyltransferase family protein  22.63 
 
 		 338 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.930505  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0486  O-methyltransferase  22.63 
 
 		 473 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.300285  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0802  O-methyltransferase  22.63 
 
 		 367 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3177  O-methyltransferase family 2  25.44 
 
 		 348 aa  74.7  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392119  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2661  O-methyltransferase family protein  26.77 
 
 		 331 aa  74.3  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0437  O-methyltransferase family 2  26.69 
 
 		 353 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0771305  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0855  O-methyltransferase family protein  24.16 
 
 		 337 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2307  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 392 aa  72.8  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.980955  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2149  O-methyltransferase family 2  24.7 
 
 		 335 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3121  O-methyltransferase family protein  31.45 
 
 		 368 aa  71.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0204  O-methyltransferase family protein  27.72 
 
 		 338 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0232  O-methyltransferase family protein  27.72 
 
 		 338 aa  71.2  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1147  O-methyltransferase family 2  31.36 
 
 		 361 aa  70.5  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0708  O-methyltransferase family protein  25.26 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551218  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2305  O-methyltransferase family protein  25.26 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2981  O-methyltransferase family protein  25.26 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1618  O-methyltransferase  25.26 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2124  O-methyltransferase family protein  25 
 
 		 371 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2850  O-methyltransferase family 2  25.43 
 
 		 381 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.387298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5718  O-methyltransferase family 2  24.19 
 
 		 338 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1210  O-methyltransferase family protein  25.26 
 
 		 359 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0920  O-methyltransferase family protein  26.09 
 
 		 343 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1051  O-methyltransferase  25.26 
 
 		 337 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1056  O-methyltransferase  25.26 
 
 		 337 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251175  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6439  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  24.56 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2038  O-methyltransferase family protein  24.21 
 
 		 379 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.309417  normal  0.146139 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2333  O-methyltransferase family protein  23.43 
 
 		 328 aa  67.8  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2815  O-methyltransferase family protein  25.68 
 
 		 341 aa  67.8  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.330603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1830  O-methyltransferase family 2  31.25 
 
 		 336 aa  67  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4546  O-methyltransferase family 2  25.09 
 
 		 352 aa  66.6  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1612  O-methyltransferase family protein  27.38 
 
 		 381 aa  66.2  0.0000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1816  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  24.62 
 
 		 334 aa  66.2  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0616  O-methyltransferase family protein  23.37 
 
 		 346 aa  65.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1647  putative methyltransferase  25.78 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.9269  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0182  O-methyltransferase  25.78 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4165  O-methyltransferase family protein  26.83 
 
 		 337 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.019449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4414  methyltransferase type 12  25.73 
 
 		 356 aa  64.3  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5557  O-methyltransferase family protein  24.1 
 
 		 352 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0273  O-methyltransferase  23.43 
 
 		 341 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4167  O-methyltransferase family protein  26.38 
 
 		 344 aa  63.5  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3758  O-methyltransferase family protein  22.67 
 
 		 380 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542752 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2402  methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 350 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1214  tetracenomycin polyketide synthesis 8-o-methyltransferase, putative  23.36 
 
 		 333 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00996217  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3993  methyltransferase type 12  26.42 
 
 		 358 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207791  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0207  hypothetical protein  23.21 
 
 		 341 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1149  O-methyltransferase family 2  24.15 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2106  Methyltransferase type 12  25.84 
 
 		 352 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1318  O-methyltransferase family protein  26.78 
 
 		 363 aa  61.2  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4888  methyltransferase type 12  26.24 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.687449 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1733  O-methyltransferase family protein  30.4 
 
 		 334 aa  59.7  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.561962  normal  0.248691 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2384  O-methyltransferase family protein  26.35 
 
 		 355 aa  59.7  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00401072 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2361  Methyltransferase type 12  27.06 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0030  methyltransferase type 12  24.21 
 
 		 368 aa  58.9  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0692  O-methyltransferase family 2  22.96 
 
 		 337 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.638552 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0499  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  22.67 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.380967 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2028  O-methyltransferase family protein  25.83 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108247  normal  0.0687911 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6986  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  25.19 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397091  normal  0.158884 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4382  O-methyltransferase family 2  24.46 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1145  O-methyltransferase family 2  24.86 
 
 		 338 aa  57.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1725  O-methyltransferase family 2  22.3 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2982  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  24.59 
 
 		 396 aa  56.6  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.37502  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1698  O-methyltransferase family 2  25.33 
 
 		 357 aa  56.6  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000510936 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2188  hypothetical protein  24.22 
 
 		 411 aa  56.6  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2686  O-methyltransferase family protein  25.33 
 
 		 357 aa  56.6  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0445752  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2765  O-methyltransferase family protein  25.33 
 
 		 363 aa  56.6  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.974745  hitchhiker  0.00708299 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0784  O-methyltransferase family 2  26.96 
 
 		 554 aa  56.2  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2312  O-methyltransferase family 2  25.6 
 
 		 353 aa  56.2  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0381447 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0771  hypothetical protein  25 
 
 		 353 aa  56.2  0.0000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2371  O-methyltransferase family protein  25.68 
 
 		 359 aa  55.8  0.0000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1315  O-methyltransferase family protein  22.74 
 
 		 341 aa  55.8  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.575705  normal  0.038188 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1708  O-methyltransferase family 2  28.66 
 
 		 373 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2966  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  22.65 
 
 		 345 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.678001  normal  0.0331478 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2905  O-methyltransferase, putative  22.97 
 
 		 357 aa  54.7  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6962  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  21.79 
 
 		 336 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.797096  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6286  O-methyltransferase family 2  25.49 
 
 		 361 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>