56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0894 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0894  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 		 65 aa  133  8e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0249295  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  49.23 
 
 		 65 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.279126  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2397  thiamine biosynthesis protein ThiS  52.31 
 
 		 67 aa  71.6  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1785  thiamine biosynthesis protein ThiS  49.23 
 
 		 65 aa  70.5  0.000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.226514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1937  thiamine biosynthesis protein ThiS  49.23 
 
 		 65 aa  70.5  0.000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.841225  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3292  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.69 
 
 		 65 aa  69.7  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212717 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0314  sulfur carrier protein ThiS  46.15 
 
 		 65 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.388373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0329  sulfur carrier protein ThiS  44.62 
 
 		 65 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3069  thiamine biosynthesis protein ThiS  49.23 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0208668  normal  0.582479 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0411  sulfur carrier protein ThiS  44.62 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0390  sulfur carrier protein ThiS  44.62 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3509  sulfur carrier protein ThiS  44.62 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.20038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2696  sulfur carrier protein ThiS  44.62 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0338  sulfur carrier protein ThiS  44.62 
 
 		 65 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.518448  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2773  sulfur carrier protein ThiS  43.08 
 
 		 65 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2779  sulfur carrier protein ThiS  40 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2729  sulfur carrier protein ThiS  40 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3738  sulfur carrier protein ThiS  40 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3680  sulfur carrier protein ThiS  40 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3709  sulfur carrier protein ThiS  40 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1774  sulfur carrier protein ThiS  40 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3225  sulfur carrier protein ThiS  40 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0384  sulfur carrier protein ThiS  41.54 
 
 		 91 aa  62  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3574  sulfur carrier protein ThiS  41.54 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000430861 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3007  sulfur carrier protein ThiS  40 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0111  sulfur carrier protein ThiS  32.88 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0761015  normal  0.947366 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3320  sulfur carrier protein ThiS  34.78 
 
 		 71 aa  52.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0433  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3644  sulfur carrier protein ThiS  34.78 
 
 		 71 aa  52.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4168  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5155  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404683  normal  0.862246 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5331  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 		 71 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.883696  normal  0.241111 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0360  sulfur carrier protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4741  sulfur carrier protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.243463 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  34.85 
 
 		 92 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.76 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433282  normal  0.219669 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4313  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.15 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.383978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  28.79 
 
 		 66 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3504  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.29 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169395  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0207  sulfur carrier protein ThiS  33.85 
 
 		 65 aa  43.9  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.672002  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  28.79 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0164  sulfur carrier protein ThiS  41.54 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2782  putative thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2563  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.23 
 
 		 65 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.183271  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2892  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.31 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.502448  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0021  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.5 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.71048  normal  0.598538 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0010  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.34 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.209764 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4172  sulfur carrier protein ThiS  31.82 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.455905 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0792  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0642  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2098  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.85 
 
 		 76 aa  40.8  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.219145  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1455  hypothetical protein  31.82 
 
 		 75 aa  40.8  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.282408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2465  ThiS, thiamine-biosynthesis  34.33 
 
 		 65 aa  40.4  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.928732 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6223  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 65 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392752  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>