128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0230 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0230  SmpA/OmlA domain-containing protein  100 
 
 		 249 aa  515  1.0000000000000001e-145  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0252  SmpA/OmlA domain protein  72.77 
 
 		 228 aa  347  8e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2836  SmpA/OmlA  45.77 
 
 		 207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1069  SmpA/OmlA domain-containing protein  40.21 
 
 		 199 aa  128  8.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4609  SmpA/OmlA  51.67 
 
 		 170 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2575  SmpA/OmlA domain protein  45.64 
 
 		 218 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2985  SmpA/OmlA domain protein  51.24 
 
 		 218 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2746  putative lipoprotein transmembrane  48.33 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0754  SmpA/OmlA  47.55 
 
 		 170 aa  122  6e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3384  SmpA/OmlA domain protein  47.58 
 
 		 276 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148479 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0572  putative outer membrane lipoprotein  45.86 
 
 		 288 aa  119  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3736  outer membrane lipoprotein, SmpA/OmlA  52.17 
 
 		 272 aa  118  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.214192 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1654  SmpA/OmlA  41.67 
 
 		 185 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3790  SmpA/OmlA domain-containing protein  50.89 
 
 		 204 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1207  outer membrane lipoprotein, putatitve  47.93 
 
 		 267 aa  116  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.87413  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0167  SmpA/OmlA  50.88 
 
 		 268 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0650  SmpA/OmlA domain-containing protein  50.88 
 
 		 268 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0617  SmpA/OmlA domain-containing protein  50.88 
 
 		 268 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.381857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3456  outer membrane lipoprotein, putatitve  45.24 
 
 		 251 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6008  SmpA/OmlA domain-containing protein  48.76 
 
 		 193 aa  116  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.792796 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2975  SmpA/OmlA  49.02 
 
 		 258 aa  115  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.977187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2592  SmpA/OmlA domain-containing protein  47.11 
 
 		 297 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000116933 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0407  SmpA/OmlA domain protein  40.61 
 
 		 186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4554  SmpA/OmlA domain-containing protein  55 
 
 		 185 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0374  SmpA/OmlA family lipoprotein  46.28 
 
 		 242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2457  outer membrane lipoprotein, putatitve  46.67 
 
 		 276 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3419  SmpA/OmlA family lipoprotein  46.67 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.458143  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3454  SmpA/OmlA family lipoprotein  46.67 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146935  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2644  SmpA/OmlA family lipoprotein  46.67 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0475  SmpA/OmlA domain-containing protein  43.75 
 
 		 182 aa  113  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1233  SmpA/OmlA family lipoprotein  46.67 
 
 		 279 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0571  SmpA/OmlA domain-containing protein  48.7 
 
 		 265 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.253801 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0545  SmpA/OmlA domain-containing protein  48.7 
 
 		 265 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0731757  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2736  SmpA/OmlA domain-containing protein  48.25 
 
 		 273 aa  112  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.724762 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3271  SmpA/OmlA domain protein  45.8 
 
 		 183 aa  110  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0222  small protein A (tmRNA-binding)-like protein  42.74 
 
 		 183 aa  109  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3923  SmpA/OmlA domain-containing protein  45.8 
 
 		 183 aa  108  6e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0476  SmpA/OmlA  39.13 
 
 		 233 aa  89.7  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0776  SmpA/OmlA  31.06 
 
 		 281 aa  86.3  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.880566  hitchhiker  0.000137115 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0986  SmpA/OmlA domain protein  43.22 
 
 		 190 aa  82  0.000000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0759  SmpA/OmlA  36.52 
 
 		 175 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.321771 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1728  SmpA/OmlA domain protein  43.9 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1124  hypothetical protein  43.21 
 
 		 342 aa  81.3  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0701  SmpA/OmlA domain-containing protein  35.65 
 
 		 178 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410018  hitchhiker  0.0000863527 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43020  outer membrane lipoprotein OmlA  35.96 
 
 		 171 aa  79.3  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2737  small protein A (tmRNA-binding)-like  45 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000974363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5485  outer membrane lipoprotein OmlA  40.96 
 
 		 187 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63030  outer membrane lipoprotein OmlA precursor  40.96 
 
 		 176 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4509  outer membrane lipoprotein OmlA  35.78 
 
 		 173 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.292937  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4199  SmpA/OmlA  33.33 
 
 		 173 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0935  SmpA/OmlA  31.76 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.970773 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3628  SmpA/OmlA domain-containing protein  32.87 
 
 		 172 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2622  small protein A  35.9 
 
 		 161 aa  73.9  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627483  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4731  SmpA/OmlA domain protein  37.35 
 
 		 178 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4597  SmpA/OmlA domain-containing protein  37.35 
 
 		 178 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0944638 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4732  SmpA/OmlA domain-containing protein  37.35 
 
 		 178 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.592236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1195  SmpA/OmlA  36.84 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1517  outer membrane protein  36.96 
 
 		 130 aa  70.1  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.718257  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1460  SmpA/OmlA domain-containing protein  36.96 
 
 		 130 aa  70.1  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.708366  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1593  SmpA/OmlA domain protein  38.54 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1285  SmpA/OmlA domain-containing protein  31.73 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.522478  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1482  SmpA/OmlA domain-containing protein  44 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01180  outer membrane protein  39.13 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0407548  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1097  SmpA/OmlA domain-containing protein  37.5 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1410  SmpA/OmlA domain-containing protein  36.25 
 
 		 171 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1523  SmpA/OmlA domain-containing protein  36.25 
 
 		 167 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.512522  hitchhiker  0.00464967 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3826  SmpA/OmlA family protein  32.5 
 
 		 144 aa  67  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.336392  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0966  outer membrane lipoprotein  37.25 
 
 		 117 aa  67  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3098  SmpA/OmlA  37.08 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1886  SmpA/OmlA domain-containing protein  32.52 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1906  SmpA/OmlA domain-containing protein  33.61 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1271  SmpA/OmlA domain-containing protein  37.5 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.175523  normal  0.212441 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1310  SmpA/OmlA domain-containing protein  35 
 
 		 192 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1301  SmpA/OmlA domain-containing protein  35 
 
 		 192 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.84513  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1337  SmpA/OmlA domain-containing protein  35 
 
 		 192 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2385  small protein A  31.73 
 
 		 163 aa  63.9  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.750326  normal  0.621044 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3049  SmpA/OmlA domain protein  35 
 
 		 177 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.331273  normal  0.468309 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0290  SmpA/OmlA  30.08 
 
 		 138 aa  63.5  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0676323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1232  SmpA/OmlA domain-containing protein  30.23 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0279  lipoprotein, SmpA/OmlA family  42.68 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0457  SmpA/OmlA domain protein  42.68 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1242  SmpA/OmlA  37.5 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.834375  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2773  SmpA/OmlA domain-containing protein  33.75 
 
 		 174 aa  62  0.000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.664934  normal  0.104565 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2851  SmpA/OmlA domain-containing protein  33.75 
 
 		 174 aa  62  0.000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2949  SmpA/OmlA domain-containing protein  33.75 
 
 		 174 aa  62  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1476  small protein A  33.75 
 
 		 163 aa  62  0.000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2051  SmpA/OmlA domain protein  39.13 
 
 		 120 aa  62  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0264  outer membrane lipoprotein OmlA  31.2 
 
 		 138 aa  61.6  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.28381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1605  Outer membrane lipoprotein OmlA  34.74 
 
 		 148 aa  61.2  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.730668  normal  0.548797 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3366  SmpA/OmlA domain-containing protein  32.93 
 
 		 110 aa  58.2  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0061494  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3006  hypothetical protein  34.67 
 
 		 113 aa  58.2  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00281492  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1713  SmpA/OmlA  31.87 
 
 		 118 aa  57.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3968  SmpA/OmlA domain-containing protein  37.33 
 
 		 105 aa  57.4  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.542266 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1391  outer membrane lipoprotein  35 
 
 		 114 aa  57.4  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000387468  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1058  SmpA/OmlA domain protein  34.67 
 
 		 113 aa  57  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.276511  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02469  hypothetical protein  34.67 
 
 		 113 aa  57  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.10509  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2775  hypothetical protein  34.67 
 
 		 113 aa  57  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494062  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2901  hypothetical protein  34.67 
 
 		 113 aa  57  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.301484  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3857  hypothetical protein  34.67 
 
 		 113 aa  57  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00570631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1067  hypothetical protein  34.67 
 
 		 113 aa  57  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261293  normal  0.540177 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>