222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4820 on replicon NC_008759
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008759  Pnap_4820  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  207  4e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0593  transposase, IS4 family protein  85.33 
 
 		 121 aa  135  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0537  transposase, IS4 family protein  85.33 
 
 		 193 aa  134  5e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.246162 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1753  ISCc1, transposase OrfB  78.67 
 
 		 115 aa  120  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.303366  normal  0.533232 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4937  transposase, IS4 family protein  77.63 
 
 		 235 aa  120  9e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00831349  normal  0.350186 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4249  transposase, IS4 family protein  89.47 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.609273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5015  IS4 family transposase  48.05 
 
 		 123 aa  72  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0619203 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2617  transposase, IS4 family protein  47.95 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.699065  normal  0.338204 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2631  transposase, IS4 family protein  47.95 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0670539  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4302  transposase, IS4 family protein  47.95 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.657565  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4715  transposase, IS4 family protein  47.95 
 
 		 113 aa  68.6  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.54309 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4381  transposase, IS4 family protein  46.58 
 
 		 113 aa  67.4  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.537387  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1377  hypothetical protein  54.24 
 
 		 97 aa  67.4  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0375554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2783  hypothetical protein  54.24 
 
 		 97 aa  67.4  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0525082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3519  putative transposase  45.21 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.343195  normal  0.0901515 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2843  hypothetical protein  53.7 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3451  hypothetical protein  43.84 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.1001 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0596  hypothetical protein  43.84 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0225  transposase, IS4  42.86 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0677  transposase, IS4  42.86 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.321651 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1053  transposase, IS4  42.86 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.133687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1352  transposase, IS4  42.86 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.238339  normal  0.0658866 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3066  transposase, IS4  42.86 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.298578  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03021  putative insertion sequence  47.89 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.161487 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0101  transposase, IS4 family protein  40.54 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.570733  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0047  transposase IS4  43.84 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.683119  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0621  transposase IS4  43.84 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0830  transposase IS4  43.84 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.172478  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2019  transposase IS4  43.84 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2650  transposase IS4  43.84 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1221  transposase, IS4 family protein  40.54 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37626  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2703  transposase, IS4 family protein  40.54 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7001  transposase IS4 family protein  41.33 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3141  hypothetical protein  39.24 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  43.84 
 
 		 255 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3104  putative transposase  53.57 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.660761  normal  0.0351076 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4677  transposase, IS4 family protein  38.16 
 
 		 116 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.692976  normal  0.0315597 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1798  hypothetical protein  39.73 
 
 		 253 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0976503  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1002  hypothetical protein  39.73 
 
 		 253 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0160346  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1612  hypothetical protein  39.73 
 
 		 253 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8144  transposase IS4 family protein  39.19 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9114  transposase protein  37.33 
 
 		 122 aa  57  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0563  hypothetical protein  39.73 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0807  transposase  40.79 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.478213  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1594  transposase  40.79 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2135  transposase  40.79 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3262  transposase  40.79 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6240  transposase IS5 family protein  38.36 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.879301 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5037  IS4 family transposase  35.64 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.505561  normal  0.915342 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5032  IS4 family transposase  35.64 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.137379  normal  0.729645 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6331  hypothetical protein  38.36 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2121  hypothetical protein  36.99 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1761  hypothetical protein  42.86 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.997929 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5939  hypothetical protein  36.84 
 
 		 266 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.754111  normal  0.0437323 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4215  transposase, IS4  42.31 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1108  transposase IS4 family protein  38.67 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.479399  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4244  transposase IS4 family protein  38.67 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1124  transposase IS4 family protein  38.67 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.524829  hitchhiker  0.00145263 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4650  transposase IS4 family protein  35.64 
 
 		 129 aa  53.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4638  transposase IS4 family protein  35.64 
 
 		 129 aa  53.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1552  transposase, IS4 family protein  41.33 
 
 		 252 aa  53.5  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185337  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0548  hypothetical protein  36 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1103  ISCc1, transposase OrfB  39.13 
 
 		 84 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0419  transposase IS4  38.46 
 
 		 115 aa  51.6  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0597  transposase IS4  38.46 
 
 		 115 aa  51.6  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0838  transposase IS4  38.46 
 
 		 115 aa  51.6  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.463071  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1298  transposase IS4  38.46 
 
 		 115 aa  51.6  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.618797  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1319  transposase IS4  38.46 
 
 		 113 aa  51.6  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1525  transposase IS4  38.46 
 
 		 115 aa  51.6  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.742906  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1643  transposase IS4  38.46 
 
 		 115 aa  51.6  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1645  transposase IS4  38.46 
 
 		 115 aa  51.6  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1687  transposase IS4  38.46 
 
 		 115 aa  51.6  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2027  transposase IS4  38.46 
 
 		 115 aa  51.6  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2347  transposase IS4  38.46 
 
 		 115 aa  51.6  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00020548  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2458  transposase IS4  38.46 
 
 		 115 aa  51.6  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2606  transposase IS4  38.46 
 
 		 115 aa  51.6  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7671  transposase  41.1 
 
 		 131 aa  51.2  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.807085  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0535  IS5 family transposase orfB  40.79 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1158  transposase  41.1 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  43.84 
 
 		 254 aa  50.8  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  43.84 
 
 		 254 aa  50.8  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  43.84 
 
 		 254 aa  50.8  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0083  hypothetical protein  37.33 
 
 		 249 aa  50.8  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1375  transposase, ISSod6  40 
 
 		 249 aa  50.8  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  43.84 
 
 		 254 aa  50.8  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  43.84 
 
 		 254 aa  50.8  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  43.84 
 
 		 254 aa  50.8  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09600  Transposase, IS4  38.46 
 
 		 245 aa  50.4  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2046  hypothetical protein  37.33 
 
 		 249 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4667  IS4 family transposase  43.1 
 
 		 61 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.286341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1468  hypothetical protein  40.26 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  42.47 
 
 		 254 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1675  transposase, IS4 family protein  38.27 
 
 		 250 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000531811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  42.47 
 
 		 254 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  42.47 
 
 		 254 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4475  hypothetical protein  36.36 
 
 		 259 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0317  transposase, IS4 family protein  38.27 
 
 		 250 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0611775  hitchhiker  0.0000000841064 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0407  transposase, IS4  36.84 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.789806  normal  0.45974 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  42.47 
 
 		 254 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  42.47 
 
 		 254 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.525266 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>