259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1103 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1103  ISCc1, transposase OrfB  100 
 
 
84 aa  174  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8144  transposase IS4 family protein  54.67 
 
 
135 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5939  hypothetical protein  52.5 
 
 
266 aa  83.6  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.754111  normal  0.0437323 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0225  transposase, IS4  54.17 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0677  transposase, IS4  54.17 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.321651 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1053  transposase, IS4  54.17 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.133687  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1352  transposase, IS4  54.17 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.238339  normal  0.0658866 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3066  transposase, IS4  54.17 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.298578  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2631  transposase, IS4 family protein  52 
 
 
113 aa  78.6  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0670539  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2617  transposase, IS4 family protein  52 
 
 
113 aa  78.6  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.699065  normal  0.338204 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4715  transposase, IS4 family protein  52 
 
 
113 aa  78.2  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.54309 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4302  transposase, IS4 family protein  52 
 
 
113 aa  78.6  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.657565  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4381  transposase, IS4 family protein  50.67 
 
 
113 aa  76.6  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.537387  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  46.67 
 
 
255 aa  67  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3519  putative transposase  42.67 
 
 
251 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.343195  normal  0.0901515 
 
 
-
 
NC_003296  RS03021  putative insertion sequence  43.42 
 
 
94 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.161487 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3104  putative transposase  56.36 
 
 
96 aa  63.5  0.0000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.660761  normal  0.0351076 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5015  IS4 family transposase  36.25 
 
 
123 aa  63.5  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0619203 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0047  transposase IS4  44 
 
 
177 aa  63.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.683119  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0621  transposase IS4  44 
 
 
177 aa  63.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0830  transposase IS4  44 
 
 
177 aa  63.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.172478  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2019  transposase IS4  44 
 
 
177 aa  63.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2650  transposase IS4  44 
 
 
177 aa  63.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3116  transposase, IS4  44 
 
 
157 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206046  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9114  transposase protein  40 
 
 
122 aa  60.1  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0180  transposase, IS4  44 
 
 
176 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.501437  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0973  transposase, IS4  44 
 
 
122 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.922887  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1015  transposase, IS4  44 
 
 
176 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.186494 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1282  transposase, IS4  44 
 
 
122 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.080194  normal  0.261741 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1592  transposase, IS4  44 
 
 
122 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.596907 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2473  transposase, IS4  44 
 
 
122 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2498  transposase, IS4  44 
 
 
122 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.316567 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2824  transposase, IS4  44 
 
 
122 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2861  transposase, IS4  44 
 
 
122 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2923  transposase, IS4  44 
 
 
122 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3013  transposase, IS4  44 
 
 
122 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3037  transposase, IS4  44 
 
 
122 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0006  transposase, IS4  42.67 
 
 
122 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.345636  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0435  transposase, IS4  42.67 
 
 
176 aa  58.2  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264496  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1934  transposase, IS4  42.67 
 
 
176 aa  58.2  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6240  transposase IS5 family protein  40 
 
 
253 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.879301 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4667  IS4 family transposase  49.18 
 
 
61 aa  58.2  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.286341  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6331  hypothetical protein  40 
 
 
253 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1798  hypothetical protein  40 
 
 
253 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0976503  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1612  hypothetical protein  40 
 
 
253 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687153  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1002  hypothetical protein  40 
 
 
253 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0160346  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6135  transposase IS4 family protein  41.67 
 
 
126 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.766196 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0548  hypothetical protein  38.75 
 
 
128 aa  55.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6290  IS4 family transposase  40.28 
 
 
126 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.464291  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2121  hypothetical protein  41.1 
 
 
113 aa  55.5  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4937  transposase, IS4 family protein  40.51 
 
 
235 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00831349  normal  0.350186 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0596  hypothetical protein  40.58 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429127  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3451  hypothetical protein  40.58 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.1001 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0537  transposase, IS4 family protein  37.33 
 
 
193 aa  52.8  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.246162 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0593  transposase, IS4 family protein  37.33 
 
 
121 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4820  hypothetical protein  39.13 
 
 
103 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0563  hypothetical protein  38.67 
 
 
159 aa  51.2  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  48.08 
 
 
260 aa  50.4  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  48.08 
 
 
260 aa  50.8  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  48.08 
 
 
260 aa  50.8  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  48.08 
 
 
260 aa  50.8  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0355  IS4 family transposase  38.89 
 
 
126 aa  50.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0436  IS4 family transposase  38.89 
 
 
126 aa  50.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0573  IS4 family transposase  38.89 
 
 
126 aa  50.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764861  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0738  IS4 family transposase  38.89 
 
 
126 aa  50.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.728772  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0936  IS4 family transposase  38.89 
 
 
126 aa  50.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.156092  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0988  IS4 family transposase  38.89 
 
 
126 aa  50.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1519  IS4 family transposase  38.89 
 
 
126 aa  50.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.21907  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2110  IS4 family transposase  38.89 
 
 
126 aa  50.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.305302  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2278  IS4 family transposase  38.89 
 
 
126 aa  50.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0266  IS4 family transposase  38.89 
 
 
126 aa  50.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0921  IS4 family transposase  38.89 
 
 
126 aa  50.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3272  IS4 family transposase  38.89 
 
 
126 aa  50.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01210  ISXoo11 transposase  38.03 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01516  ISXoo11 transposase  38.03 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.40489  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6808  transposase IS4 family protein  40 
 
 
126 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00306  ISXoo11 transposase  38.03 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744198  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00556  ISXoo11 transposase  38.03 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01149  ISXoo11 transposase  38.03 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.067728  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00615  ISXoo11 transposase  38.03 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.716993  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00485  ISXoo11 transposase  38.03 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.722368  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03343  ISXoo11 transposase  38.03 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02754  ISXoo11 transposase  38.03 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02580  ISXoo11 transposase  38.03 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03129  ISXoo11 transposase  38.03 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00091  ISXoo11 transposase  38.03 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.522819  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03683  ISXoo11 transposase  38.03 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03876  ISXoo11 transposase  38.03 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03781  ISXoo11 transposase  38.03 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04099  ISXoo11 transposase  38.03 
 
 
115 aa  50.1  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04159  ISXoo11 transposase  38.03 
 
 
115 aa  50.1  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928838  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04144  ISXoo11 transposase  38.03 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.869497  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04493  ISXoo11 transposase  38.03 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2772  hypothetical protein  34.72 
 
 
106 aa  49.7  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.407884  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01869  ISXoo11 transposase  38.03 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.682708  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02577  ISXoo11 transposase  38.03 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1377  hypothetical protein  40.35 
 
 
97 aa  49.7  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0375554  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2783  hypothetical protein  40.35 
 
 
97 aa  49.7  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0525082  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00786  ISXoo11 transposase  38.03 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0152649  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01506  ISXoo11 transposase  38.03 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.79431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>