194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3141 on replicon NC_009467
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009467  Acry_3141  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  224  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0101  transposase, IS4 family protein  96.94 
 
 
128 aa  198  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.570733  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1221  transposase, IS4 family protein  83.67 
 
 
128 aa  174  4e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37626  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2703  transposase, IS4 family protein  83.67 
 
 
128 aa  174  4e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7001  transposase IS4 family protein  70.41 
 
 
128 aa  150  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1124  transposase IS4 family protein  69.39 
 
 
128 aa  142  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.524829  hitchhiker  0.00145263 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4244  transposase IS4 family protein  69.39 
 
 
128 aa  142  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1108  transposase IS4 family protein  69.39 
 
 
128 aa  142  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.479399  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5015  IS4 family transposase  49 
 
 
123 aa  102  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0619203 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0537  transposase, IS4 family protein  42.71 
 
 
193 aa  80.9  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.246162 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4937  transposase, IS4 family protein  42.11 
 
 
235 aa  79.3  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00831349  normal  0.350186 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2919  transposase, IS4  38.53 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0593  transposase, IS4 family protein  38.61 
 
 
121 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0310  transposase, IS4  37.61 
 
 
210 aa  72  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.664621  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1095  transposase, IS4  37.61 
 
 
210 aa  72  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.282833 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0047  transposase IS4  39.8 
 
 
177 aa  72.8  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.683119  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0621  transposase IS4  39.8 
 
 
177 aa  72.8  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0830  transposase IS4  39.8 
 
 
177 aa  72.8  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.172478  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2019  transposase IS4  39.8 
 
 
177 aa  72.8  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2650  transposase IS4  39.8 
 
 
177 aa  72.8  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0250  transposase IS4 family protein  36.7 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00554315  hitchhiker  0.00627953 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2677  transposase IS4 family protein  36.7 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183927  normal  0.153389 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7671  transposase  34.58 
 
 
131 aa  63.9  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.807085  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4820  hypothetical protein  39.24 
 
 
103 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1158  transposase  33.64 
 
 
138 aa  62  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1753  ISCc1, transposase OrfB  37.93 
 
 
115 aa  62  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.303366  normal  0.533232 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2822  transposase, IS4  35 
 
 
127 aa  62  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9114  transposase protein  36.78 
 
 
122 aa  61.6  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4249  transposase, IS4 family protein  44.78 
 
 
129 aa  62  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.609273  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0083  hypothetical protein  37.38 
 
 
249 aa  60.1  0.000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0548  hypothetical protein  34.69 
 
 
128 aa  60.1  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  35.85 
 
 
254 aa  59.3  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  35.85 
 
 
254 aa  59.3  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  35.85 
 
 
254 aa  59.3  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  33.03 
 
 
252 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0180  transposase, IS4  36.11 
 
 
176 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.501437  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0435  transposase, IS4  36.11 
 
 
176 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264496  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1015  transposase, IS4  36.11 
 
 
176 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.186494 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1934  transposase, IS4  36.11 
 
 
176 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3451  hypothetical protein  32.58 
 
 
116 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.1001 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  35.85 
 
 
254 aa  59.3  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0596  hypothetical protein  32.58 
 
 
116 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429127  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  35.85 
 
 
254 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  35.85 
 
 
254 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  35.85 
 
 
254 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  35.85 
 
 
254 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  35.85 
 
 
254 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  35.85 
 
 
254 aa  59.3  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  35.85 
 
 
254 aa  59.3  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6331  hypothetical protein  33.67 
 
 
253 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6240  transposase IS5 family protein  33.67 
 
 
253 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.879301 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1675  transposase, IS4 family protein  35.78 
 
 
250 aa  58.2  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000531811  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0317  transposase, IS4 family protein  35.78 
 
 
250 aa  58.2  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0611775  hitchhiker  0.0000000841064 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0225  transposase, IS4  36.46 
 
 
164 aa  57.8  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0677  transposase, IS4  36.46 
 
 
164 aa  57.8  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.321651 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1053  transposase, IS4  36.46 
 
 
164 aa  57.8  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.133687  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1352  transposase, IS4  36.46 
 
 
164 aa  57.8  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.238339  normal  0.0658866 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3066  transposase, IS4  36.46 
 
 
164 aa  57.8  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.298578  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1002  hypothetical protein  33.67 
 
 
253 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0160346  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1798  hypothetical protein  33.67 
 
 
253 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0976503  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1612  hypothetical protein  33.67 
 
 
253 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687153  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2046  hypothetical protein  35.51 
 
 
249 aa  57.4  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01953  ISSod6, transposase  35.4 
 
 
249 aa  56.6  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0375505  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2661  putative transposase  36.67 
 
 
121 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.225009  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0006  putative transposase  36.67 
 
 
121 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1589  hypothetical protein  36.67 
 
 
121 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171898  normal  0.419285 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4349  putative transposase  36.67 
 
 
121 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.715691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2809  putative transposase  36.67 
 
 
121 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0135  IS711, transposase orfB  36 
 
 
130 aa  54.3  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0527  IS711, transposase orfB  36 
 
 
130 aa  54.3  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.15582  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1673  IS711, transposase orfB  36 
 
 
130 aa  54.3  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.965912  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0847  IS711, transposase orfB  36 
 
 
130 aa  54.3  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.791193  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  29.63 
 
 
255 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0345  transposase OrfB  36 
 
 
130 aa  53.5  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.932854  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0781  transposase OrfB  36 
 
 
130 aa  53.5  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0470  transposase OrfB  36 
 
 
130 aa  53.5  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0327  transposase OrfB  36 
 
 
130 aa  53.5  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.409344  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0519  transposase OrfB  36 
 
 
130 aa  53.5  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0721  transposase OrfB  36 
 
 
130 aa  53.5  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0158  transposase OrfB  36 
 
 
130 aa  53.5  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00557351  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0419  transposase OrfB  36 
 
 
130 aa  53.5  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.549071  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0204  transposase OrfB  36 
 
 
130 aa  53.5  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0130  IS711, transposase orfB  36 
 
 
130 aa  53.5  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00263844  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0914  IS711, transposase orfB  36 
 
 
130 aa  53.5  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1037  transposase OrfB  36 
 
 
130 aa  53.5  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0972527  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0838  transposase OrfB  36 
 
 
130 aa  53.5  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.578121  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1142  transposase OrfB  36 
 
 
130 aa  53.5  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.319477  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1154  transposase OrfB  36 
 
 
130 aa  53.5  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0770986  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0725  transposase OrfB  36 
 
 
130 aa  53.5  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0531  IS711, transposase orfB  36 
 
 
130 aa  53.5  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1764  transposase OrfB  36 
 
 
130 aa  53.9  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.246396  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1381  transposase OrfB  36 
 
 
130 aa  53.5  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.879769  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1932  transposase OrfB  36 
 
 
130 aa  53.5  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1234  transposase OrfB  36 
 
 
130 aa  53.5  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.177063  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3969  Transposase and inactivated derivatives-like protein  34 
 
 
252 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4642  Transposase and inactivated derivatives-like protein  34 
 
 
252 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.555712 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0006  transposase, IS4  35.64 
 
 
122 aa  53.5  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.345636  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0973  transposase, IS4  35.64 
 
 
122 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.922887  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1282  transposase, IS4  35.64 
 
 
122 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.080194  normal  0.261741 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1592  transposase, IS4  35.64 
 
 
122 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.596907 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>