19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4183 on replicon NC_008757
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008757  Pnap_4183    100 
 
 		 138 bp  274  6e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.34276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2661    84.03 
 
 		 1656 bp  85.7  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.308299 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1259  hypothetical protein  88.31 
 
 		 2106 bp  81.8  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0627534 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0320  hypothetical protein  88.31 
 
 		 1986 bp  81.8  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35930  hypothetical protein  86.36 
 
 		 1986 bp  79.8  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3726  hypothetical protein  86.36 
 
 		 1974 bp  79.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2625  hypothetical protein  90.32 
 
 		 1983 bp  75.8  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.324937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2075    87.01 
 
 		 627 bp  73.8  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1293  hypothetical protein  87.32 
 
 		 1974 bp  69.9  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1268  hypothetical protein  85 
 
 		 1974 bp  63.9  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2928    84.09 
 
 		 2346 bp  63.9  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.292593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2716  hypothetical protein  95 
 
 		 2382 bp  63.9  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.322654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1489  hypothetical protein  95 
 
 		 2103 bp  63.9  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685249  normal  0.0298557 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3520  hypothetical protein  91.49 
 
 		 1968 bp  61.9  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1997  hypothetical protein  88.68 
 
 		 252 bp  58  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2335  hypothetical protein  96.77 
 
 		 1998 bp  54  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2851  hypothetical protein  89.36 
 
 		 1965 bp  54  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1989  hypothetical protein  81.82 
 
 		 2004 bp  48.1  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.156539  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0453  hypothetical protein  90 
 
 		 2037 bp  48.1  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>