33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1742 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1750  integrase catalytic subunit  86.89 
 
 		 1389 bp  1257    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1742    100 
 
 		 1556 bp  3085    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.812145 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4274    92.52 
 
 		 1540 bp  2064    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0339  integrase catalytic subunit  84.56 
 
 		 1548 bp  402  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5143  integrase catalytic subunit  84.56 
 
 		 1539 bp  402  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.1652 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2708  transposase IS3/IS911  79.67 
 
 		 867 bp  311  3e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.710793  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7482  integrase catalytic region  82.67 
 
 		 576 bp  274  7e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3050  integrase catalytic subunit  81.7 
 
 		 1539 bp  256  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.985644 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6811    81.02 
 
 		 2852 bp  252  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0806  putative transposase IS3/IS911  77.75 
 
 		 1647 bp  186  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.665244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3440  integrase catalytic region  79.63 
 
 		 1602 bp  180  8e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.623196  normal  0.257291 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1714  putative transposase  77.68 
 
 		 1542 bp  170  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1110  integrase catalytic region  86.88 
 
 		 1539 bp  151  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4555    83.73 
 
 		 237 bp  145  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0946294 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4442  integrase catalytic region  85.62 
 
 		 1539 bp  135  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4798  integrase catalytic region  78.79 
 
 		 1539 bp  129  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.285753  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5758  integrase catalytic region  84.38 
 
 		 1539 bp  119  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5652  integrase catalytic region  84.38 
 
 		 1539 bp  119  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7463    78.21 
 
 		 1539 bp  111  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5960    79.91 
 
 		 389 bp  91.7  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4554    86.73 
 
 		 480 bp  91.7  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0536907 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6921    79.9 
 
 		 327 bp  81.8  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4553    86.02 
 
 		 666 bp  81.8  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0531588 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1532  integrase catalytic subunit  86.75 
 
 		 1518 bp  77.8  0.000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1529  integrase catalytic subunit  86.75 
 
 		 1518 bp  77.8  0.000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.544255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1167    85.71 
 
 		 225 bp  71.9  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.980994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2672  integrase catalytic region  85.54 
 
 		 1539 bp  69.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.226674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2991  integrase catalytic subunit  85.54 
 
 		 1539 bp  69.9  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0181  Integrase catalytic region  84.62 
 
 		 1158 bp  60  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4829    89.13 
 
 		 489 bp  52  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.271386  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0997  transposase  96.55 
 
 		 1569 bp  50.1  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0170218  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1807  transposase  96.55 
 
 		 1284 bp  50.1  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.411969  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0303    93.75 
 
 		 369 bp  48.1  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.260436 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>