16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4553 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4553    100 
 
 		 666 bp  1320    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0531588 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0806  putative transposase IS3/IS911  79.22 
 
 		 1647 bp  208  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.665244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1714  putative transposase  78.66 
 
 		 1542 bp  153  8e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6811    83.82 
 
 		 2852 bp  143  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5143  integrase catalytic subunit  89.19 
 
 		 1539 bp  83.8  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.1652 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1742    86.02 
 
 		 1556 bp  81.8  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.812145 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4274    83.96 
 
 		 1540 bp  67.9  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3050  integrase catalytic subunit  87.14 
 
 		 1539 bp  67.9  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.985644 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1110  integrase catalytic region  83.64 
 
 		 1539 bp  67.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1750  integrase catalytic subunit  82.8 
 
 		 1389 bp  58  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5652  integrase catalytic region  87.27 
 
 		 1539 bp  54  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5758  integrase catalytic region  87.27 
 
 		 1539 bp  54  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4442  integrase catalytic region  87.27 
 
 		 1539 bp  54  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7405    80.67 
 
 		 180 bp  54  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0114557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7482  integrase catalytic region  90.48 
 
 		 576 bp  52  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4507    86.54 
 
 		 108 bp  48.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>