33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0290 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_0290  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  369  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0430  hypothetical protein  71.05 
 
 
183 aa  243  9e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0688488  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5284  protein of unknown function DUF583  63.64 
 
 
171 aa  207  5e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4081  hypothetical protein  63.47 
 
 
186 aa  185  4e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3896  hypothetical protein  61.31 
 
 
184 aa  184  5e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1347  hypothetical protein  63.12 
 
 
221 aa  182  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0600  hypothetical protein  60.71 
 
 
184 aa  180  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal  0.296784 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0579  protein of unknown function DUF583  60.71 
 
 
184 aa  180  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1801  hypothetical protein  54.17 
 
 
185 aa  150  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.316822 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0798  hypothetical protein  45.29 
 
 
185 aa  144  6e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.188487  normal  0.0126197 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2700  hypothetical protein  63.46 
 
 
224 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.503004  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1225  protein of unknown function DUF583  64.65 
 
 
189 aa  140  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.933167  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0746  hypothetical protein  51.55 
 
 
223 aa  102  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0151  hypothetical protein  44.03 
 
 
247 aa  96.3  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1308  protein of unknown function DUF583  40.83 
 
 
162 aa  80.9  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.677275  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2023  hypothetical protein  49.04 
 
 
156 aa  75.9  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3818  hypothetical protein  29.7 
 
 
119 aa  52.4  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3530  hypothetical protein  30.3 
 
 
119 aa  51.2  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3835  hypothetical protein  30.3 
 
 
119 aa  51.2  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1928  hypothetical protein  26.21 
 
 
220 aa  47.4  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.238689  normal  0.284182 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2201  hypothetical protein  34.18 
 
 
109 aa  47.4  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0024  hypothetical protein  27.78 
 
 
131 aa  47  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0202286 
 
 
-
 
NC_002620  TC0548  hypothetical protein  34.62 
 
 
195 aa  45.1  0.0005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3692  hypothetical protein  28.43 
 
 
122 aa  44.7  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0882809  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1303  hypothetical protein  29.47 
 
 
184 aa  43.9  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.802702 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3571  hypothetical protein  27.45 
 
 
137 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.885538  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0935  protein of unknown function DUF583  36.36 
 
 
203 aa  43.9  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2578  hypothetical protein  26.32 
 
 
158 aa  43.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3637  protein of unknown function DUF583  27.45 
 
 
122 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.914383  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3711  protein of unknown function DUF583  27.45 
 
 
122 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0308  protein of unknown function DUF583  32.81 
 
 
152 aa  43.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000311103  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2189  hypothetical protein  40.43 
 
 
115 aa  41.6  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.841648  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0062  hypothetical protein  24.07 
 
 
116 aa  41.6  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>