More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4553 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4553  cardiolipin synthetase  100 
 
 		 481 aa  969    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  64.86 
 
 		 481 aa  649    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5530  cardiolipin synthetase  65.27 
 
 		 479 aa  654    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  65.9 
 
 		 479 aa  653    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331005 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05460  cardiolipin synthetase  69.1 
 
 		 481 aa  637    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5079  cardiolipin synthetase  64.85 
 
 		 479 aa  651    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5143  cardiolipin synthetase  64.44 
 
 		 479 aa  654    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  66.95 
 
 		 479 aa  679    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6180  cardiolipin synthetase  68.15 
 
 		 491 aa  659    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  65.06 
 
 		 479 aa  659    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71220  cardiolipin synthetase  67.94 
 
 		 490 aa  659    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4171  cardiolipin synthetase  56.69 
 
 		 477 aa  560  1e-158  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.630985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4283  cardiolipin synthetase  56.69 
 
 		 477 aa  560  1e-158  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.551808 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1211  cardiolipin synthetase  56.69 
 
 		 489 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.298817  normal  0.262712 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  56.6 
 
 		 478 aa  531  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4057  cardiolipin synthetase  56.58 
 
 		 518 aa  524  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.960389  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  54.98 
 
 		 483 aa  520  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1666  cardiolipin synthetase  54.32 
 
 		 483 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0201312 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4724  cardiolipin synthetase  54.72 
 
 		 505 aa  518  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129159  normal  0.968492 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2053  cardiolipin synthetase  55.35 
 
 		 479 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5343  cardiolipin synthetase  55.35 
 
 		 479 aa  513  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268691 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1243  cardiolipin synthetase  55.44 
 
 		 479 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1935  cardiolipin synthetase  54.18 
 
 		 479 aa  502  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6043  cardiolipin synthetase  55.56 
 
 		 479 aa  502  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2453  cardiolipin synthetase  54.37 
 
 		 479 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081727  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2034  cardiolipin synthetase  55.56 
 
 		 479 aa  502  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3239  cardiolipin synthetase  54.09 
 
 		 479 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2509  cardiolipin synthetase  54.09 
 
 		 479 aa  500  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1570  cardiolipin synthetase  54.09 
 
 		 479 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.657413  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2598  cardiolipin synthetase  54.09 
 
 		 479 aa  500  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.815966  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2073  cardiolipin synthetase  54.09 
 
 		 479 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1345  cardiolipin synthetase  54.09 
 
 		 479 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.9049  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2012  cardiolipin synthetase  54.3 
 
 		 479 aa  491  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293755  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2066  cardiolipin synthetase  54.39 
 
 		 479 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.941706  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1835  cardiolipin synthetase  47.89 
 
 		 474 aa  423  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1928  phospholipase D/Transphosphatidylase  45.42 
 
 		 490 aa  420  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2511  cardiolipin synthetase  45.2 
 
 		 490 aa  417  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0505  cardiolipin synthetase  45.37 
 
 		 478 aa  393  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0682  cardiolipin synthetase  40.53 
 
 		 441 aa  354  2e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2033  cardiolipin synthetase  40.17 
 
 		 484 aa  338  9.999999999999999e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0028874  hitchhiker  0.0000142083 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  38.69 
 
 		 502 aa  298  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  36.21 
 
 		 514 aa  296  6e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  37.07 
 
 		 502 aa  292  8e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  34.76 
 
 		 514 aa  290  3e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  34.76 
 
 		 514 aa  290  3e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  34.76 
 
 		 514 aa  290  3e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  34.76 
 
 		 514 aa  290  3e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  34.76 
 
 		 514 aa  290  3e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  34.76 
 
 		 514 aa  290  4e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1592  cardiolipin synthetase 2  34.01 
 
 		 499 aa  290  4e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.273081  hitchhiker  0.0042538 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  34.76 
 
 		 514 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  34.76 
 
 		 514 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  34.56 
 
 		 514 aa  289  8e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1231  phospholipase D/transphosphatidylase  34.64 
 
 		 490 aa  289  9e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.332876  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.71 
 
 		 478 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1100  cardiolipin synthetase  34.15 
 
 		 514 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  34.24 
 
 		 485 aa  285  2.0000000000000002e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.46 
 
 		 541 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.44 
 
 		 482 aa  283  7.000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0048  cardiolipin synthetase 2  34.62 
 
 		 487 aa  280  5e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  32.65 
 
 		 509 aa  276  5e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  32.44 
 
 		 509 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.92 
 
 		 472 aa  275  2.0000000000000002e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  31.96 
 
 		 509 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  31.96 
 
 		 509 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  32.31 
 
 		 509 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0748  cardiolipin synthetase  32.61 
 
 		 483 aa  273  5.000000000000001e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.83977  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  33.4 
 
 		 509 aa  273  6e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  32.31 
 
 		 509 aa  273  7e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  32.31 
 
 		 509 aa  273  7e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0579  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  37.53 
 
 		 484 aa  272  9e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0885  cardiolipin synthetase  34.14 
 
 		 490 aa  271  1e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0361948  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0662  cardiolipin synthetase  32.55 
 
 		 509 aa  272  1e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4675  cardiolipin synthetase  32.22 
 
 		 509 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.632299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0735  cardiolipin synthetase  32.62 
 
 		 483 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00981982  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0446  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.17 
 
 		 477 aa  268  1e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2441  phospholipase D/transphosphatidylase  35.14 
 
 		 477 aa  267  4e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1695  cardiolipin synthetase  34.03 
 
 		 488 aa  265  1e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2328  phospholipase D/transphosphatidylase  33.05 
 
 		 480 aa  265  1e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114921  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0012  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.93 
 
 		 486 aa  265  1e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321981 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1418  cardiolipin synthase  30.11 
 
 		 476 aa  265  1e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.283904  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1683  cardiolipin synthase  30.11 
 
 		 476 aa  264  3e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184727  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1379  phospholipase D/transphosphatidylase  33.4 
 
 		 505 aa  263  4.999999999999999e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1406  phospholipase D/transphosphatidylase  33.4 
 
 		 505 aa  263  4.999999999999999e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.318723  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1097  phospholipase D/transphosphatidylase  32.25 
 
 		 486 aa  257  3e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1387  cardiolipin synthetase 2  33.06 
 
 		 477 aa  257  3e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  31.52 
 
 		 483 aa  256  6e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.63 
 
 		 485 aa  256  8e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2125  phospholipase D/transphosphatidylase  35.97 
 
 		 494 aa  256  9e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000100004  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2163  phospholipase D/transphosphatidylase  35.97 
 
 		 494 aa  256  9e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.44679  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03470  cardiolipin synthetase  37.04 
 
 		 486 aa  255  1.0000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0187  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.32 
 
 		 526 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0582  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.85 
 
 		 486 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  34.61 
 
 		 477 aa  252  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  36.09 
 
 		 484 aa  251  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1793  phospholipase D/transphosphatidylase  30.52 
 
 		 497 aa  250  5e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.734015  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.61 
 
 		 481 aa  246  4.9999999999999997e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0089  cardiolipin synthetase  30.66 
 
 		 470 aa  246  8e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0093  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  32.53 
 
 		 463 aa  245  1.9999999999999999e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325157 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.7 
 
 		 483 aa  243  5e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>