38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3157 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3157  hypothetical protein  100 
 
 		 63 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982589  normal  0.105283 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2864  hypothetical protein  84.13 
 
 		 66 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.238501 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2107  hypothetical protein  90.38 
 
 		 66 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2290  hypothetical protein  88.46 
 
 		 66 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.813592 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3626  hypothetical protein  88.46 
 
 		 66 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.200251  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2468  hypothetical protein  66.67 
 
 		 60 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.835928  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2233  hypothetical protein  63.79 
 
 		 60 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.256275  normal  0.539616 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5160  hypothetical protein  67.27 
 
 		 57 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3582  hypothetical protein  35.59 
 
 		 63 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.765416  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1814  hypothetical protein  35.59 
 
 		 100 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1491  hypothetical protein  34.04 
 
 		 63 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.248534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1840  hypothetical protein  34.78 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.327409  normal  0.891126 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2362  hypothetical protein  36.84 
 
 		 64 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0865  hypothetical protein  38.6 
 
 		 64 aa  48.9  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1551  hypothetical protein  40 
 
 		 76 aa  47.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355099  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22880  putative Fe-S protein  33.33 
 
 		 70 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.900753  normal  0.190729 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2184  protein of unknown function DUF1289  40 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.768607  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2045  hypothetical protein  32.79 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0738495  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3459  hypothetical protein  38 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.203383 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1931  putative Fe-S protein  33.33 
 
 		 75 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236199  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1605  hypothetical protein  33.93 
 
 		 73 aa  45.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0647603  normal  0.193551 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5318  protein of unknown function DUF1289  32.08 
 
 		 76 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0857  hypothetical protein  34.48 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2792  hypothetical protein  38.33 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0478  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  38.89 
 
 		 250 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1057  hypothetical protein  31.67 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2528  hypothetical protein  33.96 
 
 		 72 aa  41.6  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2479  hypothetical protein  35.71 
 
 		 60 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00121761  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1997  hypothetical protein  30.51 
 
 		 61 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.205951  normal  0.0114926 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3407  hypothetical protein  36.54 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.29096  normal  0.480404 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1739  hypothetical protein  41.3 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3009  hypothetical protein  30.91 
 
 		 68 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2872  hypothetical protein  30.91 
 
 		 68 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5051  hypothetical protein  30.91 
 
 		 57 aa  40.8  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2957  hypothetical protein  30.91 
 
 		 68 aa  40.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2867  hypothetical protein  37.5 
 
 		 64 aa  40  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.510606  hitchhiker  0.0000394649 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3396  hypothetical protein  36 
 
 		 68 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0264738  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1889  protein of unknown function DUF1289  33.96 
 
 		 68 aa  40  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102819  normal  0.458319 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>