23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1452 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1452  membrane protein-like protein  100 
 
 		 222 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3850  putative lipoprotein  53.3 
 
 		 226 aa  244  8e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4113  lipoprotein, putative  53.3 
 
 		 226 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0777387  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1153  lipoprotein  53.57 
 
 		 224 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0150107 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19590  hypothetical protein  63.16 
 
 		 203 aa  236  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.376572  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1237  putative lipoprotein  54.22 
 
 		 217 aa  234  8e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.933604 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4314  hypothetical protein  54.42 
 
 		 221 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.572847  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50630  hypothetical protein  53.95 
 
 		 221 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0354656 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4281  lipoprotein  52.88 
 
 		 224 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.614524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1170  membrane protein-like protein  51.92 
 
 		 224 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.196222  normal  0.817809 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1135  hypothetical protein  51.71 
 
 		 246 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0564032 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0278  hypothetical protein  31.49 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.274931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0497  membrane protein-like  30.3 
 
 		 135 aa  54.3  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1052  hypothetical protein  37.25 
 
 		 227 aa  53.5  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.710572  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0572  membrane protein-like  32.97 
 
 		 158 aa  51.2  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3920  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  37.36 
 
 		 351 aa  50.8  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0592511  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0401  SH3 type 3 domain-containing protein  28.92 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.175354 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2387  putative lipoprotein  25.13 
 
 		 514 aa  48.5  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1709  hypothetical protein  32.32 
 
 		 224 aa  48.5  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.719716 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4623  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  23.08 
 
 		 257 aa  45.4  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0179388  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3540  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  28.57 
 
 		 325 aa  42.4  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1265  hypothetical protein  31.58 
 
 		 145 aa  42.4  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.802997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2955  putative lipoprotein  22.86 
 
 		 339 aa  42  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>