More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2683 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 361 aa  748    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  46.31 
 
 		 304 aa  271  9e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  44.48 
 
 		 311 aa  262  6e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5349  glycosyl transferase family protein  43.93 
 
 		 314 aa  249  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  43.52 
 
 		 307 aa  243  5e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  41.36 
 
 		 310 aa  227  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  43.08 
 
 		 318 aa  225  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  38.18 
 
 		 306 aa  221  9.999999999999999e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2729  glycosyl transferase family protein  42.41 
 
 		 298 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3624  glycosyl transferase family 2  40.74 
 
 		 319 aa  209  7e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.519026 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3301  glycosyl transferase family protein  39.93 
 
 		 319 aa  204  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  39.91 
 
 		 311 aa  171  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  36.33 
 
 		 310 aa  161  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 		 312 aa  157  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  31.23 
 
 		 298 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  32.61 
 
 		 318 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  32.33 
 
 		 318 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  31.95 
 
 		 318 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  31.95 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  31.99 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  36.74 
 
 		 329 aa  144  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  31.41 
 
 		 324 aa  140  3e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  35.69 
 
 		 313 aa  140  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  31.64 
 
 		 294 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  34.58 
 
 		 324 aa  138  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3226  glycosyl transferase family protein  34.89 
 
 		 317 aa  136  5e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  30.77 
 
 		 652 aa  135  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  33.61 
 
 		 324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  31.31 
 
 		 340 aa  133  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  33.2 
 
 		 334 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  32.86 
 
 		 313 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  32.72 
 
 		 714 aa  127  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  32.05 
 
 		 293 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  32.73 
 
 		 334 aa  126  6e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  31.18 
 
 		 289 aa  126  6e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  32.73 
 
 		 360 aa  125  8.000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  32.38 
 
 		 311 aa  122  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  35.5 
 
 		 282 aa  122  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  33.2 
 
 		 324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  27.88 
 
 		 290 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0817  hypothetical protein  29.15 
 
 		 297 aa  119  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4989  glycosyl transferase family protein  31.76 
 
 		 387 aa  119  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 		 312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  30.18 
 
 		 299 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0842  hypothetical protein  29.49 
 
 		 297 aa  116  6e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  33.59 
 
 		 318 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 		 306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0233  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 		 315 aa  113  5e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.885705  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  30.07 
 
 		 308 aa  113  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0409  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 315 aa  113  5e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.535242  hitchhiker  0.0010651 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.62 
 
 		 379 aa  113  6e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.05 
 
 		 355 aa  112  8.000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  28.33 
 
 		 308 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2593  glycosyl transferase family protein  31.08 
 
 		 333 aa  110  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  30.89 
 
 		 401 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  33.47 
 
 		 327 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  27.94 
 
 		 679 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  30.86 
 
 		 325 aa  106  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  31.51 
 
 		 616 aa  106  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  29.43 
 
 		 299 aa  106  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  29.38 
 
 		 705 aa  104  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  32.89 
 
 		 306 aa  103  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  31.87 
 
 		 2401 aa  103  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4788  glycosyl transferase family protein  33.05 
 
 		 315 aa  103  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  32.35 
 
 		 1162 aa  103  7e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  30.25 
 
 		 324 aa  102  8e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  27.3 
 
 		 624 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  30.12 
 
 		 337 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4256  glycosyl transferase family protein  30.11 
 
 		 336 aa  99.4  8e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.586342  normal  0.139884 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  28.68 
 
 		 305 aa  99.4  9e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1773  glycosyl transferase family protein  31.05 
 
 		 303 aa  99  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.314835  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2362  glycosyl transferase family 2  27.94 
 
 		 335 aa  97.8  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  31.73 
 
 		 314 aa  97.8  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  30.22 
 
 		 841 aa  97.4  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  31.08 
 
 		 310 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  32.62 
 
 		 1340 aa  96.7  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  30.34 
 
 		 274 aa  96.7  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12413  glycosyltransferase  28.35 
 
 		 330 aa  96.3  7e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  27.12 
 
 		 340 aa  96.3  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  27.15 
 
 		 314 aa  95.9  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  27.71 
 
 		 1523 aa  95.5  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  30.8 
 
 		 1523 aa  95.5  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 		 308 aa  95.9  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  29.79 
 
 		 902 aa  95.9  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2849  glycosyl transferase family protein  29.36 
 
 		 824 aa  95.9  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0840  hypothetical protein  27.55 
 
 		 296 aa  94.7  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  29.36 
 
 		 703 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  29.26 
 
 		 282 aa  94.7  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4703  glycosyl transferase family 2  26.54 
 
 		 334 aa  94.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.261222  normal  0.175733 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2884  glycosyl transferase family protein  26.07 
 
 		 305 aa  94.7  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.379417  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  29.34 
 
 		 303 aa  94  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  28.74 
 
 		 336 aa  93.6  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  31.49 
 
 		 683 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  28.1 
 
 		 327 aa  92.8  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0746  glycosyl transferase family 2  31.49 
 
 		 951 aa  92.8  8e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.38831  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  29.04 
 
 		 300 aa  92.8  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4524  glycosyl transferase family protein  29.39 
 
 		 308 aa  92.4  9e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  0.110607 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  29.46 
 
 		 1267 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  28.28 
 
 		 892 aa  92.4  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  30 
 
 		 1739 aa  92  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>