More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1270 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1270  L-aspartate oxidase  100 
 
 
545 aa  1118    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0164  L-aspartate oxidase  46.89 
 
 
528 aa  437  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  43.71 
 
 
532 aa  437  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00630  L-aspartate oxidase  43.57 
 
 
532 aa  421  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  42.54 
 
 
542 aa  414  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2250  L-aspartate oxidase  43.33 
 
 
522 aa  411  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1873  L-aspartate oxidase  43.8 
 
 
529 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0105  L-aspartate oxidase  44.21 
 
 
533 aa  396  1e-109  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  43.19 
 
 
534 aa  395  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0157  L-aspartate oxidase  43.84 
 
 
541 aa  392  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204171  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1164  aspartate oxidase  43.85 
 
 
515 aa  394  1e-108  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000105405  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  44.38 
 
 
533 aa  389  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1193  L-aspartate oxidase  43.65 
 
 
515 aa  391  1e-107  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00735813  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0702  L-aspartate oxidase  42.64 
 
 
531 aa  389  1e-107  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000765394  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2322  L-aspartate oxidase  43.7 
 
 
532 aa  385  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2309  L-aspartate oxidase  44.73 
 
 
507 aa  385  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114896  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2251  L-aspartate oxidase  40.41 
 
 
535 aa  386  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00695711 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1159  L-aspartate oxidase  42.94 
 
 
531 aa  385  1e-105  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1648  L-aspartate oxidase  41.7 
 
 
534 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1213  L-aspartate oxidase  41.73 
 
 
538 aa  385  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0621913  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1082  L-aspartate oxidase  43.3 
 
 
542 aa  379  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0565  L-aspartate oxidase  41.87 
 
 
537 aa  379  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.222565 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3151  L-aspartate oxidase  43.24 
 
 
532 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.401963 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1954  L-aspartate oxidase  43.3 
 
 
531 aa  377  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163414  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1141  L-aspartate oxidase  42.42 
 
 
536 aa  377  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0257897  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0582  L-aspartate oxidase  43.02 
 
 
532 aa  378  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.871756 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0855  L-aspartate oxidase  41.51 
 
 
538 aa  378  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000253959  normal  0.0344943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0999  L-aspartate oxidase  41.51 
 
 
538 aa  378  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000540636  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0815  L-aspartate oxidase  43.05 
 
 
532 aa  378  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0811  L-aspartate oxidase  40.77 
 
 
531 aa  377  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00614841  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3119  L-aspartate oxidase  42.49 
 
 
537 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2233  L-aspartate oxidase  42.86 
 
 
535 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1271  L-aspartate oxidase  42.49 
 
 
537 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2103  L-aspartate oxidase  42.86 
 
 
570 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0708849  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1236  L-aspartate oxidase  42.23 
 
 
536 aa  374  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.305386  hitchhiker  0.0000186096 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1134  L-aspartate oxidase  42.86 
 
 
533 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2751  L-aspartate oxidase  42.4 
 
 
539 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.53736  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9157  Aspartate oxidase-like protein  43.85 
 
 
863 aa  375  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15159  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5836  L-aspartate oxidase  42.86 
 
 
528 aa  373  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2834  L-aspartate oxidase  42.78 
 
 
540 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100997  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0976  L-aspartate oxidase  42.86 
 
 
570 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1238  L-aspartate oxidase  42.49 
 
 
537 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2852  L-aspartate oxidase  42.78 
 
 
540 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.184893  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0858  L-aspartate oxidase  41.35 
 
 
531 aa  374  1e-102  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1024  L-aspartate oxidase  42.86 
 
 
570 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105043  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0980  L-aspartate oxidase  42.86 
 
 
570 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291559  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2855  L-aspartate oxidase  42.5 
 
 
537 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.955955  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2937  L-aspartate oxidase  42.5 
 
 
537 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.320984  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2968  L-aspartate oxidase  42.59 
 
 
540 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1194  L-aspartate oxidase  42.49 
 
 
537 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0634  L-aspartate oxidase  46.2 
 
 
558 aa  374  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2649  L-aspartate oxidase  42.86 
 
 
570 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2856  L-aspartate oxidase  42.97 
 
 
540 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151453  normal  0.187887 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3603  L-aspartate oxidase  41.51 
 
 
533 aa  369  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0843929  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1152  L-aspartate oxidase  43.18 
 
 
537 aa  372  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.172404  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1341  L-aspartate oxidase  42.31 
 
 
537 aa  370  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1490  L-aspartate oxidase  41.06 
 
 
541 aa  371  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000326406  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1128  L-aspartate oxidase  41.51 
 
 
533 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194941  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1322  L-aspartate oxidase  41.44 
 
 
532 aa  369  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0729  L-aspartate oxidase  42.35 
 
 
533 aa  370  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000384944  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2422  L-aspartate oxidase  42.91 
 
 
528 aa  372  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.266314  hitchhiker  0.00145144 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1743  L-aspartate oxidase  41.45 
 
 
534 aa  371  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13650  L-aspartate oxidase  41.08 
 
 
538 aa  372  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1047  L-aspartate oxidase  42.99 
 
 
537 aa  370  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328832  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1181  L-aspartate oxidase  40.99 
 
 
545 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.217249  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1893  L-aspartate oxidase  42.91 
 
 
528 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2551  L-aspartate oxidase  42.91 
 
 
528 aa  372  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2504  L-aspartate oxidase  42.91 
 
 
528 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3033  L-aspartate oxidase  41.94 
 
 
537 aa  370  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.625398  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2529  L-aspartate oxidase  42.91 
 
 
528 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.433648  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0122  L-aspartate oxidase  42.83 
 
 
538 aa  369  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.028832  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1030  L-aspartate oxidase  42 
 
 
536 aa  370  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0868483  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02468  L-aspartate oxidase  41.38 
 
 
540 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.757112  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1827  L-aspartate oxidase  41.94 
 
 
531 aa  366  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400593  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4130  L-aspartate oxidase  40.97 
 
 
532 aa  367  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0478415  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4225  L-aspartate oxidase  40.07 
 
 
538 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2792  L-aspartate oxidase  41.27 
 
 
539 aa  366  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.016617  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2021  L-aspartate oxidase  42.91 
 
 
525 aa  366  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00800394  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2883  L-aspartate oxidase  43.41 
 
 
867 aa  367  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.401949  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2728  L-aspartate oxidase  41.57 
 
 
540 aa  366  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.100043  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1466  L-aspartate oxidase  40.45 
 
 
543 aa  367  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00248368  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0778  L-aspartate oxidase  42.48 
 
 
533 aa  369  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4092  L-aspartate oxidase  42.61 
 
 
523 aa  368  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.757551  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0525  L-aspartate oxidase  42.03 
 
 
531 aa  367  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.191357  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02432  hypothetical protein  41.38 
 
 
540 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.874408  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2872  L-aspartate oxidase  41.57 
 
 
535 aa  366  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.689493  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0791  L-aspartate oxidase  42.91 
 
 
528 aa  369  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357674  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1103  L-aspartate oxidase  41.11 
 
 
540 aa  365  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.369167  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2862  L-aspartate oxidase  41.33 
 
 
540 aa  366  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0820367  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1094  L-aspartate oxidase  41.19 
 
 
540 aa  365  1e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.527185  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2487  L-aspartate oxidase  41.6 
 
 
531 aa  365  1e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000814089  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2096  L-aspartate oxidase  43.24 
 
 
541 aa  365  1e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2730  L-aspartate oxidase  41.19 
 
 
540 aa  365  1e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.624821  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3677  L-aspartate oxidase  41.19 
 
 
545 aa  365  1e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.341127  normal  0.20063 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3061  L-aspartate oxidase  41.03 
 
 
539 aa  364  2e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289617 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4381  L-aspartate oxidase  40.36 
 
 
535 aa  365  2e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.20561 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2445  L-aspartate oxidase  40.83 
 
 
571 aa  364  2e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2936  L-aspartate oxidase  42.18 
 
 
538 aa  364  2e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1812  L-aspartate oxidase  41.54 
 
 
531 aa  365  2e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0392  L-aspartate oxidase  40.22 
 
 
565 aa  364  2e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>