57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0054 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0054  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 106 aa  209  1e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.905154  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0581  DNA-binding protein BpH2  56.44 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1603  DNA-binding protein  56.44 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.53335  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0251  DNA-binding protein  54.55 
 
 		 149 aa  103  8e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000057612  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1943  DNA-binding protein BpH2  53.54 
 
 		 149 aa  100  8e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000773845  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2924  histone family protein DNA-binding protein  57.29 
 
 		 118 aa  97.8  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0908189  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0911  DNA-binding protein HU, putative  50 
 
 		 135 aa  87  9e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000732094  decreased coverage  0.000000096145 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4034  DNA-binding protein HU  48.98 
 
 		 100 aa  80.1  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.235716 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3750  histone-like DNA-binding protein  45.92 
 
 		 99 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0653422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01988  DNA-binding protein  44.44 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.864367  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5992  histone-like DNA-binding protein  43.43 
 
 		 202 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1029  histone-like protein  44.44 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.221489  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1007  histone family protein DNA-binding protein  43.43 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.402804 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0905  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2126  histone family protein DNA-binding protein  45.45 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.598787  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1452  histone-like DNA-binding protein  43.88 
 
 		 99 aa  70.1  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.14886  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1203  histone-like DNA-binding protein  43.88 
 
 		 99 aa  70.1  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6191  histone-like DNA-binding protein  40.4 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0442446  hitchhiker  0.00020029 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5558  histone-like DNA-binding protein  41.41 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1589  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.647783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6090  histone-like bacterial DNA-binding protein (Bph2)  41.41 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000417993  normal  0.832292 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5164  histone family protein DNA-binding protein  40.4 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.771962 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1500  histone family protein DNA-binding protein  40.4 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0444762  normal  0.010023 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3872  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4602  histone family protein DNA-binding protein  43.43 
 
 		 147 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.670627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4510  histone family protein DNA-binding protein  42.42 
 
 		 155 aa  63.5  0.0000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.43063  normal  0.701023 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5068  histone family protein DNA-binding protein  39.39 
 
 		 135 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.703119 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3550  histone family protein DNA-binding protein  43.43 
 
 		 149 aa  62  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4388  histone-like DNA-binding protein  43.43 
 
 		 149 aa  62  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.294948  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0701  DNA-binding protein BpH2  42.71 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2106  histone-like DNA-binding protein  43.43 
 
 		 149 aa  62  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4509  histone family protein DNA-binding protein  42.42 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0180118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0762  Bph2  42.71 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0912566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0746  DNA-binding protein BpH2  41.41 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.73636  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1700  DNA-binding protein BpH2  41.41 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.791918  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0551  histone H1  41.67 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2281  putative histone H1  41.67 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2419  putative histone H1  41.67 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1880  DNA-binding protein BpH2  41.67 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1671  DNA-binding protein BpH2  41.67 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.412961  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4742  histone-like DNA-binding protein  39.39 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.039459  normal  0.060583 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4442  histone family protein DNA-binding protein  42.71 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4051  histone-like DNA-binding protein  38.54 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3889  histone family protein DNA-binding protein  42.42 
 
 		 139 aa  51.2  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.933734 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3162  histone family protein DNA-binding protein  42.42 
 
 		 139 aa  51.2  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2662  histone-like protein  42.42 
 
 		 157 aa  50.4  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.128126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7384  histone family protein DNA-binding protein  40.4 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.283987 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4352  histone family protein DNA-binding protein  35.05 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614172 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26150  nucleoid DNA-binding protein  37.89 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3288  DNA-binding protein HU  35.51 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.36981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2801  histone-like DNA-binding protein  34 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.821949 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4358  histone family protein DNA-binding protein  31.96 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.847271  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4335  histone family protein DNA-binding protein  31.96 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4203  histone-like DNA-binding protein  31.96 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1584  DNA-binding protein HU family protein  28.57 
 
 		 91 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000100307  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1172  histone-like DNA-binding protein  32.65 
 
 		 90 aa  40  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.856335  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1294  histone family protein DNA-binding protein  28.57 
 
 		 91 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000000180262  unclonable  0.000000000020236 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>