More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2130 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2130  dihydropteroate synthase  100 
 
 		 273 aa  536  9.999999999999999e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.202113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0047  dihydropteroate synthase 2  66.15 
 
 		 271 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0090  dihydropteroate synthase type-2  66.15 
 
 		 271 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009789  EcE24377A_B0005  dihydropteroate synthase  66.15 
 
 		 271 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0127  dihydropteroate synthase type-2  66.15 
 
 		 271 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0060  dihydropteroate synthase  52.14 
 
 		 263 aa  268  8.999999999999999e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.545012 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5341  dihydropteroate synthase  50.37 
 
 		 283 aa  249  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.981899  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1582  dihydropteroate synthase  50.56 
 
 		 279 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0972411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0151  dihydropteroate synthase  50.56 
 
 		 279 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2233  dihydropteroate synthase  43.38 
 
 		 292 aa  192  5e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  39.62 
 
 		 279 aa  183  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2861  dihydropteroate synthase  40.23 
 
 		 299 aa  182  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2633  dihydropteroate synthase  41.2 
 
 		 294 aa  181  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160124  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3026  dihydropteroate synthase  42.91 
 
 		 285 aa  180  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.369504 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2044  dihydropteroate synthase  41.13 
 
 		 285 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1932  dihydropteroate synthase  41.83 
 
 		 392 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.36752  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2638  dihydropteroate synthase  41.15 
 
 		 278 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.578756  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1765  dihydropteroate synthase  40.38 
 
 		 285 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.270074 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1263  dihydropteroate synthase  40 
 
 		 270 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0955  dihydropteroate synthase  38.7 
 
 		 279 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0212772  normal  0.281578 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1596  dihydropteroate synthase  40.77 
 
 		 278 aa  171  9e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1527  7,8-dihydropteroate synthase protein  41.26 
 
 		 291 aa  171  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0945  dihydropteroate synthase  40.15 
 
 		 279 aa  167  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.601088 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3080  dihydropteroate synthase  39.02 
 
 		 290 aa  167  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.642553  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3351  dihydropteroate synthase  38.7 
 
 		 277 aa  167  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0017412  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0880  dihydropteroate synthase  41.6 
 
 		 280 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.0771022 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3533  dihydropteroate synthase  42.97 
 
 		 288 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139072  normal  0.316671 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3735  dihydropteroate synthase  37.04 
 
 		 277 aa  166  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00714217  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0060  dihydropteroate synthase  40.6 
 
 		 298 aa  166  4e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.404361  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3601  dihydropteroate synthase  37.04 
 
 		 277 aa  166  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106991  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1469  dihydropteroate synthase  39.48 
 
 		 298 aa  166  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.400128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3593  dihydropteroate synthase  36.78 
 
 		 282 aa  166  4e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346067  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2833  dihydropteroate synthase  37.74 
 
 		 282 aa  166  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0289164  normal  0.0133795 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0802  dihydropteroate synthase  37.21 
 
 		 277 aa  166  5e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03042  7,8-dihydropteroate synthase  36.4 
 
 		 282 aa  165  8e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000457475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0530  dihydropteroate synthase  36.4 
 
 		 282 aa  165  8e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0023005  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0523  dihydropteroate synthase  36.4 
 
 		 282 aa  165  8e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018335  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3369  dihydropteroate synthase  36.4 
 
 		 282 aa  165  8e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000338476  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3473  dihydropteroate synthase  36.4 
 
 		 282 aa  165  8e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4499  dihydropteroate synthase  36.4 
 
 		 282 aa  165  8e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00232473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3662  dihydropteroate synthase  36.4 
 
 		 282 aa  165  8e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000648754  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02993  hypothetical protein  36.4 
 
 		 282 aa  165  8e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000407498  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0147  dihydropteroate synthase  38.72 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1674  dihydropteroate synthase  41.38 
 
 		 271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.055413 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4713  dihydropteroate synthase  41.77 
 
 		 810 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.464706  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3451  dihydropteroate synthase  35.52 
 
 		 286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2459  dihydropteroate synthase  41.53 
 
 		 283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  37.98 
 
 		 279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3986  dihydropteroate synthase  37.04 
 
 		 277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000550562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1971  dihydropteroate synthase  39.63 
 
 		 289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.305951 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2371  dihydropteroate synthase  41.53 
 
 		 283 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4972  dihydropteroate synthase  37.5 
 
 		 300 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450509  normal  0.898132 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2187  dihydropteroate synthase  39.69 
 
 		 289 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.999142  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  34.96 
 
 		 397 aa  162  6e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1122  dihydropteroate synthase  35.96 
 
 		 284 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000916741  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2028  dihydropteroate synthase  41.02 
 
 		 265 aa  161  9e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2354  dihydropteroate synthase  36.5 
 
 		 279 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0072  dihydropteroate synthase  40.23 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2169  dihydropteroate synthase  40 
 
 		 316 aa  160  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2404  dihydropteroate synthase  36.5 
 
 		 279 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1925  dihydropteroate synthase  37.21 
 
 		 291 aa  161  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00000353988  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1883  dihydropteroate synthase  37.59 
 
 		 394 aa  160  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02040  dihydropteroate synthase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  36.29 
 
 		 437 aa  160  1e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.439643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3245  dihydropteroate synthase  35.96 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3423  dihydropteroate synthase  36.33 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000169878  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1616  dihydropteroate synthase  39.63 
 
 		 296 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.282934  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1889  dihydropteroate synthase  36.7 
 
 		 290 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000220218  hitchhiker  0.00000000634632 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1496  dihydropteroate synthase  44 
 
 		 283 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1483  dihydropteroate synthase  39.63 
 
 		 296 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1720  dihydropteroate synthase  39.39 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.270791  normal  0.815616 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0567  dihydropteroate synthase  36.05 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.194721  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0572  dihydropteroate synthase  39.26 
 
 		 296 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0453394  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0579  dihydropteroate synthase  39.26 
 
 		 296 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.601672  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0778  dihydropteroate synthase  39.26 
 
 		 296 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1134  dihydropteroate synthase  41.95 
 
 		 281 aa  160  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1289  dihydropteroate synthase  39.26 
 
 		 296 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2568  dihydropteroate synthase  34.73 
 
 		 286 aa  159  4e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.032898  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0167  dihydropteroate synthase  34.73 
 
 		 278 aa  159  4e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000848147  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00157  dihydropteroate synthase  38.89 
 
 		 307 aa  159  4e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3653  dihydropteroate synthase  35.25 
 
 		 282 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0472359  normal  0.97325 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1513  dihydropteroate synthase  39.26 
 
 		 296 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0313731  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3611  dihydropteroate synthase  35.63 
 
 		 282 aa  159  6e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00230251  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3591  dihydropteroate synthase  35.25 
 
 		 282 aa  158  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0668157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3484  dihydropteroate synthase  35.25 
 
 		 282 aa  158  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0132953  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3554  dihydropteroate synthase  35.25 
 
 		 282 aa  158  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  34.17 
 
 		 280 aa  158  9e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1974  dihydropteroate synthase  42.47 
 
 		 298 aa  158  9e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490177 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2840  dihydropteroate synthase  34.85 
 
 		 277 aa  158  9e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000230549  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3286  dihydropteroate synthase  35.58 
 
 		 277 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000166046  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2581  dihydropteroate synthase  35.16 
 
 		 393 aa  158  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3470  dihydropteroate synthase  37.98 
 
 		 277 aa  157  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.194075  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  38.01 
 
 		 400 aa  157  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2183  dihydropteroate synthase  40.22 
 
 		 289 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0156937 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0984  dihydropteroate synthase  36.54 
 
 		 287 aa  157  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000265095  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1786  dihydropteroate synthase  38.75 
 
 		 286 aa  156  3e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.190802 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1769  dihydropteroate synthase  40.55 
 
 		 286 aa  155  7e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0633  dihydropteroate synthase  38.19 
 
 		 258 aa  155  8e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3485  dihydropteroate synthase  34.87 
 
 		 282 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0097  dihydropteroate synthase  35.98 
 
 		 412 aa  154  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2022  dihydropteroate synthase  38.99 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>