72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1948 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1948  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 		 232 aa  478  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2405  glutathione S-transferase-like  47.09 
 
 		 279 aa  197  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1652  hypothetical protein  42.2 
 
 		 237 aa  184  7e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887044  normal  0.0204387 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4820  Glutathione S-transferase domain  43.61 
 
 		 231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.651391  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4143  glutathione S-transferase-like protein  42.29 
 
 		 231 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.595769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0774  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.81 
 
 		 229 aa  176  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4134  glutathione S-transferase-like  40.35 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2357  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.78 
 
 		 238 aa  172  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.396368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4017  glutathione S-transferase-like  40.43 
 
 		 232 aa  172  3.9999999999999995e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.678212 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1788  putative glutathione S-transferase (GST)  41.33 
 
 		 229 aa  170  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3099  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.44 
 
 		 232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.937068  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2618  glutathione S-transferase domain protein  40.71 
 
 		 236 aa  157  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2685  glutathione S-transferase-like protein  38.5 
 
 		 236 aa  156  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.702474  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7062  Glutathione S-transferase domain protein  39.74 
 
 		 229 aa  145  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00932246  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1550  lignin degradation protein  39.07 
 
 		 226 aa  145  7.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.355245  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1078  Glutathione S-transferase domain  36.73 
 
 		 229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000010734 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1223  Glutathione S-transferase domain protein  36.73 
 
 		 229 aa  139  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000515515 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6243  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.12 
 
 		 229 aa  136  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.247558 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1599  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.49 
 
 		 226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0946501 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2863  putative lignin beta-etherase  34.55 
 
 		 222 aa  121  9e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.300835  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05770  Glutathione S-transferase-like protein  37.14 
 
 		 230 aa  112  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.765948  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00480  expressed protein  25.23 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0881  glutathione S-transferase domain protein  26.7 
 
 		 263 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0898679  normal  0.46136 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0854  Glutathione S-transferase domain protein  26.7 
 
 		 263 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1907  glutathione S-transferase-like protein  25.13 
 
 		 263 aa  52.8  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464392  normal  0.0635336 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26121  putative glutathione S-transferase  27.03 
 
 		 241 aa  52.8  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.551591 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2348  putative glutathione S-transferase  27.32 
 
 		 246 aa  51.2  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5366  Glutathione S-transferase domain protein  35.09 
 
 		 207 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.230494  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5058  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.37 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000892035 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0022  glutathione S-transferase-like protein  25.41 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.428941  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0788  glutathione S-transferase  26.34 
 
 		 264 aa  50.4  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.200068 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01261  putative glutathione S-transferase  26.78 
 
 		 241 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.991625  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1478  glutathione S-transferase domain-containing protein  25 
 
 		 263 aa  49.3  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.204587  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4039  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.23 
 
 		 230 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1688  Glutathione S-transferase domain protein  28.72 
 
 		 243 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.423888 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01271  putative glutathione S-transferase  25.14 
 
 		 241 aa  48.5  0.00009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.867718  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01231  putative glutathione S-transferase  25.5 
 
 		 241 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.168526  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1848  putative glutathione S-transferase-related protein  23.79 
 
 		 315 aa  48.1  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.417859 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3483  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.1 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541048  normal  0.515016 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01251  putative glutathione S-transferase  26.11 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.621374 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0500  Glutathione S-transferase domain  25.82 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0342057 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03487  conserved hypothetical protein  27.37 
 
 		 341 aa  47  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.67628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2922  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.43 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.894063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4581  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.88 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2890  glutathione S-transferase-like  26.67 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3542  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.77 
 
 		 245 aa  46.6  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.709402  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2090  maleylacetoacetate isomerase  31.78 
 
 		 213 aa  46.2  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0275  glutathione S-transferase-like  26.86 
 
 		 221 aa  45.8  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0888177 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2289  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.18 
 
 		 252 aa  45.8  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.497964  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2915  putative glutathione S-transferase-related protein  27.66 
 
 		 312 aa  45.4  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4733  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.48 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3824  glutathione S-transferase-like  29.56 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.136134  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0523  Glutathione S-transferase domain protein  36.26 
 
 		 228 aa  44.3  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0507  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.26 
 
 		 228 aa  43.9  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.911631  normal  0.0384549 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3957  glutathione S-transferase-like  28.79 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0113  putative glutathione S-transferase  25.5 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27580  putative glutathione S-transferase  28.95 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.08808  decreased coverage  0.00115097 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1843  Glutathione S-transferase domain protein  32.14 
 
 		 217 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779491 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4962  Glutathione S-transferase domain protein  31.13 
 
 		 219 aa  43.1  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3634  glutathione S-transferase domain protein  33.64 
 
 		 219 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3436  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.64 
 
 		 215 aa  43.5  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.226272  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0108  stringent starvation protein A  30.11 
 
 		 211 aa  42.7  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0236194  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2570  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.4 
 
 		 228 aa  42.7  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00976958 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0071  maleylacetoacetate isomerase  30.53 
 
 		 217 aa  42.4  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0886  glutaredoxin  39.53 
 
 		 87 aa  42.4  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2490  putative glutathione S-transferase-related protein  25.28 
 
 		 313 aa  42.4  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4347  stringent starvation protein A  29.03 
 
 		 213 aa  42.4  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000258123  hitchhiker  0.00803988 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1132  glutathione S-transferase family protein  23.08 
 
 		 224 aa  42.4  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1977  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.38 
 
 		 222 aa  42  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290176  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0981  hypothetical protein  24.12 
 
 		 311 aa  42.4  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2474  Glutathione S-transferase domain protein  32.71 
 
 		 219 aa  41.6  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0885  glutathione S-transferase  23.08 
 
 		 224 aa  41.6  0.01  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0233753  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>