More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1699 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1699  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 
431 aa  904    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0427621 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1866  acyl-CoA dehydrogenase-like  70.35 
 
 
448 aa  632  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.265676  normal  0.117685 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3515  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  70.16 
 
 
426 aa  626  1e-178  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4745  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  71.09 
 
 
430 aa  624  1e-178  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0335795 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3601  Acyl-CoA dehydrogenase-like  71.06 
 
 
424 aa  627  1e-178  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.86159  normal  0.643653 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1859  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  69.91 
 
 
431 aa  624  1e-177  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.881726 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1963  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  70.82 
 
 
424 aa  623  1e-177  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251732  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2922  putative acyl-CoA dehydrogenase  69.88 
 
 
424 aa  619  1e-176  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0282  acyl-CoA dehydrogenase-like  69.72 
 
 
433 aa  608  1e-173  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0774  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  63.93 
 
 
419 aa  543  1e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1586  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  62.77 
 
 
412 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.775062  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1556  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  62.77 
 
 
412 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707279  normal  0.518626 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1610  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  62.77 
 
 
412 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.181826  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1892  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  62.05 
 
 
412 aa  536  1e-151  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4468  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  62.29 
 
 
412 aa  530  1e-149  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0390971 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4583  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  60.28 
 
 
428 aa  529  1e-149  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03880  conserved hypothetical protein  54.55 
 
 
458 aa  488  1e-137  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2326  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.36 
 
 
398 aa  248  2e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3415  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.03 
 
 
414 aa  244  3e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2439  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.09 
 
 
380 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2355  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.1 
 
 
381 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.774843  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0155  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29.29 
 
 
388 aa  179  7e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000954759  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4293  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.88 
 
 
383 aa  179  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33210  acyl-CoA dehydrogenase  32.48 
 
 
389 aa  177  4e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243663  normal  0.754036 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1999  acyl-CoA dehydrogenase  32.87 
 
 
391 aa  176  9e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0248728  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1843  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.12 
 
 
380 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0736  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  32.78 
 
 
379 aa  174  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.763418 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1804  butyryl-CoA dehydrogenase  30.97 
 
 
386 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1109  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.08 
 
 
388 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1546  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29.62 
 
 
381 aa  173  5.999999999999999e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3775  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.16 
 
 
388 aa  173  5.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0119178  unclonable  0.00000752707 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2511  acyl-CoA dehydrogenase  32.16 
 
 
381 aa  172  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2327  acyl-CoA dehydrogenase  32.16 
 
 
381 aa  172  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2560  acyl-CoA dehydrogenase  32.16 
 
 
381 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.1486499999999994e-20 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2812  acyl-CoA dehydrogenase  32.16 
 
 
381 aa  172  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000163693 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0733  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.25 
 
 
377 aa  172  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2548  acyl-CoA dehydrogenase  32.16 
 
 
381 aa  171  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2369  acyl-CoA dehydrogenase  32.16 
 
 
381 aa  172  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.73982  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2285  acyl-CoA dehydrogenase  32.16 
 
 
381 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769883  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3106  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.81 
 
 
375 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.332334  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2603  acyl-CoA dehydrogenase  32.16 
 
 
381 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.608519  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3108  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.56 
 
 
383 aa  171  3e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0428  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  32.28 
 
 
380 aa  171  3e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.871589  normal  0.2576 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31540  putative acyl-CoA dehydrogenase  33.77 
 
 
375 aa  170  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.430124  hitchhiker  0.000095284 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1569  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.06 
 
 
389 aa  170  5e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.881248  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2901  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.15 
 
 
379 aa  170  5e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2684  putative acyl-CoA dehydrogenase  33.51 
 
 
375 aa  170  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.126402  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1802  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.98 
 
 
381 aa  169  6e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2547  acyl-CoA dehydrogenase  31.92 
 
 
381 aa  170  6e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1375  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.42 
 
 
384 aa  170  6e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1590  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29.85 
 
 
396 aa  169  9e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0232  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.92 
 
 
382 aa  168  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4384  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.36 
 
 
375 aa  169  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17615  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1974  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.52 
 
 
392 aa  167  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.204851  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1359  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29.45 
 
 
381 aa  167  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0903405  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2068  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.9 
 
 
385 aa  168  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1118  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.08 
 
 
391 aa  168  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.549204 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4370  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.33 
 
 
404 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6770  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.42 
 
 
390 aa  166  9e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210456  normal  0.358603 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1881  butyryl-CoA dehydrogenase  28.64 
 
 
379 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.593492  normal  0.222475 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1737  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.25 
 
 
391 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375234  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2382  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.54 
 
 
389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6504  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.2 
 
 
375 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.285028  normal  0.547313 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1756  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  34.25 
 
 
391 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1803  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.25 
 
 
391 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.992024  normal  0.411519 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0447  acyl-CoA dehydrogenase  32.91 
 
 
375 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1707  butyryl-CoA dehydrogenase  33.71 
 
 
388 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00000836039  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0919  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29.77 
 
 
383 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3931  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.02 
 
 
400 aa  164  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.543045 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0391  acyl-CoA dehydrogenase  33.16 
 
 
375 aa  163  4.0000000000000004e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.31925  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5519  acyl-CoA dehydrogenase  31.39 
 
 
379 aa  162  7e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.814074  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4672  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.29 
 
 
409 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1318  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.05 
 
 
384 aa  162  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0793911 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1474  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.42 
 
 
384 aa  162  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5190  acyl-CoA dehydrogenase  31.73 
 
 
379 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0413  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.6 
 
 
382 aa  162  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.204955  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4391  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.34 
 
 
386 aa  162  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5586  acyl-CoA dehydrogenase  31.73 
 
 
379 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5434  acyl-CoA dehydrogenase  31.73 
 
 
379 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000286159 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0249  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.89 
 
 
383 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.538468  normal  0.417839 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3313  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.27 
 
 
384 aa  162  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08210  butyryl-CoA dehydrogenase  28.54 
 
 
394 aa  162  1e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.249284 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5488  acyl-CoA dehydrogenase  30.66 
 
 
379 aa  161  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270181  hitchhiker  1.62736e-22 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4257  butyryl-CoA dehydrogenase  31.98 
 
 
377 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.725306  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0098  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  31.74 
 
 
433 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0088  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.74 
 
 
433 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.403775 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0107  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.74 
 
 
433 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5472  acyl-CoA dehydrogenase  31.14 
 
 
379 aa  161  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5041  acyl-CoA dehydrogenase  31.49 
 
 
379 aa  161  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1777  putative acyl-CoA dehydrogenase  32.01 
 
 
383 aa  161  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0345355  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4184  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.98 
 
 
390 aa  160  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.948009  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5464  acyl-CoA dehydrogenase  30.66 
 
 
379 aa  160  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000608426  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5025  butyryl-CoA dehydrogenase (short-chain acyl-CoA dehydrogenase)  31.14 
 
 
379 aa  160  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2867  Acyl-CoA dehydrogenase-like  31.94 
 
 
375 aa  160  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.967944  normal  0.115681 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0319  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.52 
 
 
383 aa  160  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.339666  normal  0.0442463 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0116  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.61 
 
 
447 aa  160  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1052  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.06 
 
 
386 aa  160  6e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3862  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.17 
 
 
379 aa  159  7e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5139  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.14 
 
 
379 aa  159  7e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3683  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.62 
 
 
384 aa  159  9e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.685138 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>