More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1859 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_2922  putative acyl-CoA dehydrogenase  75.06 
 
 
424 aa  673    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3601  Acyl-CoA dehydrogenase-like  74.88 
 
 
424 aa  667    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.86159  normal  0.643653 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0282  acyl-CoA dehydrogenase-like  83.41 
 
 
433 aa  750    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1866  acyl-CoA dehydrogenase-like  73.88 
 
 
448 aa  668    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.265676  normal  0.117685 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1963  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  74.35 
 
 
424 aa  663    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251732  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1859  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  100 
 
 
431 aa  901    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.881726 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4745  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  71.13 
 
 
430 aa  645    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0335795 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3515  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  72.68 
 
 
426 aa  627  1e-178  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1699  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  69.91 
 
 
431 aa  624  1e-177  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0427621 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0774  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  67.06 
 
 
419 aa  542  1e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4583  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  63.98 
 
 
428 aa  533  1e-150  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1892  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  64.29 
 
 
412 aa  529  1e-149  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4468  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  64.05 
 
 
412 aa  524  1e-147  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0390971 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1556  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  63.33 
 
 
412 aa  523  1e-147  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707279  normal  0.518626 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1586  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  63.33 
 
 
412 aa  523  1e-147  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.775062  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1610  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  63.33 
 
 
412 aa  523  1e-147  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.181826  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03880  conserved hypothetical protein  58.56 
 
 
458 aa  498  1e-140  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2326  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.23 
 
 
398 aa  243  5e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3415  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.5 
 
 
414 aa  234  3e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4154  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  31.93 
 
 
410 aa  176  8e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328631  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4410  acyl-CoA dehydrogenase  32.32 
 
 
410 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000319161  normal  0.518491 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1118  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.38 
 
 
391 aa  172  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.549204 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33210  acyl-CoA dehydrogenase  29.88 
 
 
389 aa  170  5e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243663  normal  0.754036 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3775  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.42 
 
 
388 aa  168  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0119178  unclonable  0.00000752707 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3108  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29.22 
 
 
383 aa  168  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1109  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.19 
 
 
388 aa  167  4e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0736  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  32.49 
 
 
379 aa  166  8e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.763418 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1999  acyl-CoA dehydrogenase  30.48 
 
 
391 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0248728  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2068  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.59 
 
 
385 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1569  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.52 
 
 
389 aa  161  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.881248  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0155  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29.36 
 
 
388 aa  161  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000954759  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2181  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  29.38 
 
 
386 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.326272  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1590  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.49 
 
 
396 aa  160  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2038  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  29.38 
 
 
386 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2382  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.3 
 
 
389 aa  160  5e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3725  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  29.38 
 
 
386 aa  160  6e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1546  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.74 
 
 
381 aa  159  8e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1804  butyryl-CoA dehydrogenase  32.97 
 
 
386 aa  158  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5712  putative acyl-CoA dehydrogenase  29.55 
 
 
386 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0410  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.06 
 
 
389 aa  157  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2695  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.94 
 
 
382 aa  157  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65820  putative acyl-CoA dehydrogenase  29.31 
 
 
386 aa  157  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1076  acyl-CoA dehydrogenase, short-chain specific  27.45 
 
 
379 aa  156  6e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.228764 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1881  butyryl-CoA dehydrogenase  28.5 
 
 
379 aa  156  6e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.593492  normal  0.222475 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2175  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.7 
 
 
386 aa  156  9e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0919  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.5 
 
 
383 aa  155  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2193  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29.27 
 
 
382 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.918821  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4761  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32 
 
 
386 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0402  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  28.74 
 
 
380 aa  155  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1147  acyl-CoA dehydrogenase  31.57 
 
 
390 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799274  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1647  butyryl-CoA dehydrogenase  30.29 
 
 
379 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2163  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.05 
 
 
389 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.820192  normal  0.287496 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2926  acyl-CoA dehydrogenase  31.57 
 
 
390 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.532316  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2771  acyl-CoA dehydrogenase  31.57 
 
 
390 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0428  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  30.64 
 
 
380 aa  154  2.9999999999999998e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.871589  normal  0.2576 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0734  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.12 
 
 
418 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.998726  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6770  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.01 
 
 
390 aa  154  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210456  normal  0.358603 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2355  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.96 
 
 
381 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.774843  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3365  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.79 
 
 
381 aa  153  5e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.122497 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1664  butyryl-CoA dehydrogenase  31.53 
 
 
387 aa  153  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2282  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.74 
 
 
389 aa  153  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5641  Butyryl-CoA dehydrogenase  36.18 
 
 
379 aa  153  7e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.95 
 
 
379 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3822  acyl-CoA dehydrogenase-like  28.1 
 
 
386 aa  152  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1802  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.87 
 
 
381 aa  151  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2327  acyl-CoA dehydrogenase  31.38 
 
 
381 aa  151  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2299  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.53 
 
 
379 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174362  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1835  butyryl-CoA dehydrogenase  31.28 
 
 
379 aa  151  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.571593  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3863  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.66 
 
 
376 aa  151  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2560  acyl-CoA dehydrogenase  31.38 
 
 
381 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.1486499999999994e-20 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0762  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.14 
 
 
381 aa  151  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal  0.783766 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5941  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  29.94 
 
 
394 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0480348 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0733  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.82 
 
 
377 aa  150  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2511  acyl-CoA dehydrogenase  31.38 
 
 
381 aa  150  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2369  acyl-CoA dehydrogenase  31.38 
 
 
381 aa  151  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.73982  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5487  acyl-CoA dehydrogenase  30.11 
 
 
381 aa  150  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302943  hitchhiker  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2812  acyl-CoA dehydrogenase  31.38 
 
 
381 aa  150  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000163693 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5042  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  31.51 
 
 
376 aa  150  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0232  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29.31 
 
 
382 aa  150  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0837  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.52 
 
 
390 aa  150  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2548  acyl-CoA dehydrogenase  31.09 
 
 
381 aa  150  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5026  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  30.11 
 
 
376 aa  150  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2285  acyl-CoA dehydrogenase  31.09 
 
 
381 aa  150  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769883  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0364  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.67 
 
 
386 aa  150  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2603  acyl-CoA dehydrogenase  31.09 
 
 
381 aa  150  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.608519  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1483  butyryl-CoA dehydrogenase  28.34 
 
 
382 aa  150  5e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5435  acyl-CoA dehydrogenase  30.11 
 
 
376 aa  150  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000529924 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2429  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.11 
 
 
382 aa  150  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.62219  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2863  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29.26 
 
 
380 aa  150  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4384  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.63 
 
 
375 aa  150  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17615  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4293  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  29.69 
 
 
383 aa  150  6e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2132  butyryl-CoA dehydrogenase  33.98 
 
 
388 aa  150  6e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.627987  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3567  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.95 
 
 
382 aa  149  7e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2211  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.29 
 
 
379 aa  149  8e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0439927  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5473  acyl-CoA dehydrogenase  30.11 
 
 
376 aa  149  8e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2547  acyl-CoA dehydrogenase  31.09 
 
 
381 aa  149  8e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5465  acyl-CoA dehydrogenase  30.19 
 
 
381 aa  149  8e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5520  acyl-CoA dehydrogenase  30.11 
 
 
381 aa  149  8e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6335  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.81 
 
 
386 aa  149  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  0.725662 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2494  Butyryl-CoA dehydrogenase  27.36 
 
 
392 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>