197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0814 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0814  peptidase M42 family protein  100 
 
 
371 aa  761    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0829922  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0140  hydrolase, peptidase M42 family  60.93 
 
 
399 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.138245  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2678  peptidase M42 family hydrolase  61.2 
 
 
394 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.899426 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0220  peptidase M42 family protein  60.17 
 
 
363 aa  440  9.999999999999999e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0112  hydrolase, peptidase M42 family  57.02 
 
 
372 aa  426  1e-118  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.294228  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3665  peptidase M42 family protein  55.71 
 
 
392 aa  410  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161837 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1987  peptidase M42  57.75 
 
 
387 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2956  peptidase M42 family protein  57.34 
 
 
387 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.730035  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4102  peptidase M42  55.31 
 
 
396 aa  386  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34980  Glutamyl aminopeptidase familiy M42  56.45 
 
 
405 aa  385  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2957  peptidase M42 family protein  54.24 
 
 
399 aa  383  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.705814  normal  0.012913 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1666  hypothetical protein  56.16 
 
 
398 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.669233  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19350  hypothetical protein  56.16 
 
 
398 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0348157  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1631  hypothetical protein  53.87 
 
 
398 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3749  peptidase M42  53.87 
 
 
398 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0267864 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1340  peptidase M42 family hydrolase  54.99 
 
 
394 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1298  peptidase M42 family hydrolase  55.87 
 
 
394 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1748  hypothetical protein  54.7 
 
 
394 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3966  peptidase M42 family protein  54.99 
 
 
394 aa  354  1e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.123914 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0858  peptidase M42 family protein  49.59 
 
 
397 aa  328  9e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.967973  normal  0.0317113 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3392  peptidase M42 family protein  49.59 
 
 
402 aa  323  3e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13042  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0915  peptidase M42 family protein  49.05 
 
 
397 aa  321  9.999999999999999e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1943  hypothetical protein  35.5 
 
 
345 aa  239  4e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.643032  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0723  peptidase M42 family protein  35.71 
 
 
349 aa  233  3e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000063382  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1427  peptidase M42 family protein  38.11 
 
 
343 aa  232  6e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1456  peptidase M42 family protein  38.11 
 
 
343 aa  232  6e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1078  Peptidase, family M20/M25/M40 protein  35.1 
 
 
349 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0754256  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0850  M20/M25/M40 family peptidase  35.1 
 
 
349 aa  231  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0795  glucanase; deblocking aminopeptidase  35.42 
 
 
349 aa  231  1e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0139828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0799  glucanase; deblocking aminopeptidase  35.1 
 
 
349 aa  231  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.650698  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0897  M20/M25/M40 family peptidase  35.1 
 
 
349 aa  231  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0985  Peptidase, family M20/M25/M40 protein  35.1 
 
 
349 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14885e-38 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0983  M20/M25/M40 family peptidase  34.81 
 
 
349 aa  230  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0064567  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0939  deblocking aminopeptidase  35.42 
 
 
349 aa  231  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018694  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4392  deblocking aminopeptidase  35.42 
 
 
349 aa  230  3e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000145821  hitchhiker  1.52043e-22 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0790  peptidase M42 family protein  35.42 
 
 
349 aa  230  4e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0298  peptidase M42  35.76 
 
 
357 aa  215  9e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1785  peptidase M42 family protein  34.11 
 
 
343 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1100  peptidase M42 family protein  35.21 
 
 
340 aa  211  2e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0109  peptidase M42 family protein  36.09 
 
 
340 aa  207  3e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000430902  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1252  aminopeptidase  32.66 
 
 
344 aa  202  6e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0654379  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0017  hypothetical protein  33.72 
 
 
342 aa  196  8.000000000000001e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000301485  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2439  hypothetical protein  32.95 
 
 
363 aa  188  2e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0671697  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0952  peptidase M42 family protein  28.29 
 
 
353 aa  148  2.0000000000000003e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00111271  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0950  cellulase  24.29 
 
 
384 aa  80.1  0.00000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.374031  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0313  Cellulase  22.25 
 
 
342 aa  78.6  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2478  Cellulase  27.74 
 
 
359 aa  76.6  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1087  peptidase M42  25.29 
 
 
349 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4428  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  28.9 
 
 
356 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1495  Cellulase  25.5 
 
 
353 aa  71.2  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2270  glucanase  26.78 
 
 
344 aa  70.5  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0738  peptidase M42  25.79 
 
 
353 aa  70.5  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.511886  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2999  peptidase M42 family protein  23.3 
 
 
351 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0934  peptidase M42 family protein  24.52 
 
 
349 aa  69.7  0.00000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0349  peptidase M42 family protein  25.57 
 
 
352 aa  69.7  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.326281 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0712  cellulase  25.08 
 
 
350 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0995  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  25.76 
 
 
349 aa  69.3  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.383048 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0590  hypothetical protein  24.75 
 
 
352 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4288  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  27.98 
 
 
356 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.427406 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03783  predicted endo-1,4-beta-glucanase  27.98 
 
 
356 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4086  Cellulase  27.98 
 
 
356 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4126  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  27.98 
 
 
356 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0214  cellulase  25.1 
 
 
357 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.880444  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3182  peptidases M20 and M42  24.79 
 
 
346 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0675112 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03732  hypothetical protein  27.98 
 
 
356 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0452  cellulase  25.89 
 
 
362 aa  68.6  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.547156  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4119  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  27.98 
 
 
356 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0208  peptidase M42 family protein  24.36 
 
 
334 aa  67.4  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.53357  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0895  Cellulase  24.69 
 
 
355 aa  66.2  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0354  peptidase M42 family protein  24.56 
 
 
346 aa  66.2  0.0000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.326213  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0441  cellulase  26.18 
 
 
350 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.174946  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0232  peptidase M42 family protein  25.35 
 
 
352 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5349  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  27.52 
 
 
356 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1432  cellulase  25.45 
 
 
362 aa  65.1  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.26952  normal  0.0787337 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1505  cellulase  26.85 
 
 
345 aa  65.1  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0724  peptidase M42 family protein  24.92 
 
 
350 aa  65.1  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.143036  normal  0.785387 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0542  cellulase  25.78 
 
 
362 aa  64.7  0.000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.192278  hitchhiker  0.00117454 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2294  peptidase M42  26.21 
 
 
356 aa  64.7  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.365569  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0842  cellulase  25.68 
 
 
362 aa  64.7  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0002  cellulase  22.92 
 
 
365 aa  63.5  0.000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1103  Glutamyl aminopeptidase  27.31 
 
 
359 aa  63.2  0.000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.24305 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0687  Glutamyl aminopeptidase  25.23 
 
 
359 aa  63.2  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2196  hydrolase, putative  25.86 
 
 
354 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.84144  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1761  peptidase M42 family protein  30.49 
 
 
348 aa  62.4  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0779  peptidase M42 family protein  26.4 
 
 
356 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0763  peptidase M42 family protein  26.4 
 
 
356 aa  61.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776489  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1966  peptidase M42 family protein  27.27 
 
 
383 aa  62  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0501  Glutamyl aminopeptidase  24.42 
 
 
355 aa  61.2  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00911075  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1702  peptidase M42 family protein  22.93 
 
 
341 aa  61.2  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3125  peptidase M42 family protein  26.56 
 
 
356 aa  61.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.612233  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1385  peptidase M42 family protein  25.93 
 
 
357 aa  60.8  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0718  peptidase M42 family protein  22.38 
 
 
363 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2745  Glutamyl aminopeptidase  24.77 
 
 
358 aa  60.8  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000840882  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1376  peptidase M42 family protein  23.92 
 
 
354 aa  60.1  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376322  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0278  endo-1,4-beta-glucanase  22 
 
 
363 aa  60.1  0.00000006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0912  peptidase M42  23.01 
 
 
345 aa  59.7  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1064  peptidase, putative, truncation  30.86 
 
 
86 aa  59.3  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.357611  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1213  peptidase M42 family protein  23.19 
 
 
344 aa  59.3  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0522  hypothetical protein  25.21 
 
 
374 aa  58.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36500  hypothetical protein  23.91 
 
 
358 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0413589  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>