48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4031 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_4031  hypothetical protein  100 
 
 
328 aa  686    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.510364  normal  0.913559 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3812  glycosyltransferase-distantly-related protein  49.24 
 
 
346 aa  345  4e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2062  hypothetical protein  34.04 
 
 
362 aa  176  7e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001652  glycosyltransferase  35.45 
 
 
348 aa  172  7.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3367  hypothetical protein  34.05 
 
 
350 aa  168  9e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3289  hypothetical protein  34.05 
 
 
366 aa  168  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.60491  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4072  hypothetical protein  33.53 
 
 
358 aa  168  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00822  hypothetical protein  33.54 
 
 
348 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0795  hypothetical protein  33.23 
 
 
345 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0695397  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2984  hypothetical protein  35.41 
 
 
354 aa  160  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0533  hypothetical protein  34.39 
 
 
350 aa  159  6e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0454  hypothetical protein  32.48 
 
 
343 aa  158  1e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0675  hypothetical protein  33.65 
 
 
343 aa  158  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.575182  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3787  hypothetical protein  32.12 
 
 
351 aa  156  4e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3546  hypothetical protein  34.15 
 
 
346 aa  155  7e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.279975  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3720  hypothetical protein  34.15 
 
 
346 aa  155  9e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.588173  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2218  hypothetical protein  32.26 
 
 
347 aa  155  9e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0410  hypothetical protein  34.15 
 
 
346 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1681  hypothetical protein  31.95 
 
 
347 aa  152  5.9999999999999996e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4194  hypothetical protein  34.6 
 
 
346 aa  152  7e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00208  glycosyl transferase  34.88 
 
 
349 aa  152  8.999999999999999e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0450  hypothetical protein  34.3 
 
 
346 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0424  hypothetical protein  33.94 
 
 
346 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3890  hypothetical protein  33.94 
 
 
346 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.877982  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0436  hypothetical protein  33.94 
 
 
346 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.574558  hitchhiker  0.00210413 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1656  hypothetical protein  31.37 
 
 
360 aa  149  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00119867  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3197  hypothetical protein  34.83 
 
 
346 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0466  hypothetical protein  33.68 
 
 
351 aa  147  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.297273  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0511  hypothetical protein  33.57 
 
 
346 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0548  hypothetical protein  30.95 
 
 
343 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0480  hypothetical protein  34.41 
 
 
349 aa  144  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1414  hypothetical protein  30.42 
 
 
343 aa  144  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1492  hypothetical protein  34.26 
 
 
347 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.286308  normal  0.0796091 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1851  hypothetical protein  27.42 
 
 
359 aa  94  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.316148  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2719  teichoic acid biosynthesis related protein  24.03 
 
 
388 aa  79.7  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.194172  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0336  teichoic acid biosynthesis related protein  24.84 
 
 
355 aa  77.4  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  normal  0.581509 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0449  Glycosyltransferase 28 domain protein  26.8 
 
 
377 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0377577  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2842  UDP-glucuronosyltransferase-like protein  23.49 
 
 
371 aa  76.3  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2563  UDP- glucuronosyltransferase-like glycosyl transferase  23.58 
 
 
371 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.504516  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1235  teichoic acid biosynthesis related protein  24.92 
 
 
360 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0254  teichoic acid biosynthesis related protein  24.84 
 
 
367 aa  69.7  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0266168  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0232  teichoic acid biosynthesis related protein  24.84 
 
 
367 aa  69.3  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422227  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0243  teichoic acid biosynthesis related protein  24.51 
 
 
367 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0253  teichoic acid biosynthesis related protein  22.88 
 
 
366 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3660  putative glycosyltransferase  22.08 
 
 
373 aa  65.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359283  normal  0.0742075 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2254  teichoic acid biosynthesis related protein  22.22 
 
 
381 aa  61.6  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.060696  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5685  Glycosyl transferase-like protein UDP- glucuronosyltransferase  22.88 
 
 
382 aa  60.1  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.706833  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6653  putative UDP-glucuronosyltransferase  22.26 
 
 
359 aa  59.3  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.873533  normal  0.109077 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>