45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4020 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_4020  protein of unknown function DUF718  100 
 
 		 112 aa  231  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1991  protein of unknown function DUF718  67.89 
 
 		 110 aa  158  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.893292 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5741  protein of unknown function DUF718  63.89 
 
 		 109 aa  151  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0374824 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2046  hypothetical protein  62.39 
 
 		 110 aa  144  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0311  protein of unknown function DUF718  60.75 
 
 		 108 aa  131  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.881314 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6338  hypothetical protein  50 
 
 		 109 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00357939  normal  0.513822 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0643  hypothetical protein  47.27 
 
 		 119 aa  112  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.198224  normal  0.98044 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5323  protein of unknown function DUF718  47.22 
 
 		 109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0822  hypothetical protein  47.32 
 
 		 118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000953829  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5480  protein of unknown function DUF718  46.79 
 
 		 113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.299938  normal  0.858981 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1246  hypothetical protein  44.55 
 
 		 113 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02757  hypothetical protein  49.52 
 
 		 113 aa  103  7e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1219  hypothetical protein  43.64 
 
 		 113 aa  103  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3138  hypothetical protein  45.45 
 
 		 113 aa  101  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.296679  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1601  hypothetical protein  40.37 
 
 		 112 aa  85.5  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0645  hypothetical protein  39.45 
 
 		 112 aa  85.5  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1543  hypothetical protein  40.91 
 
 		 118 aa  84.3  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1781  hypothetical protein  39.45 
 
 		 112 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1086  hypothetical protein  36.54 
 
 		 106 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1163  hypothetical protein  36.54 
 
 		 106 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0819  hypothetical protein  36.54 
 
 		 106 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40891  predicted protein  34.23 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4114  hypothetical protein  31.13 
 
 		 832 aa  67  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0478518  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2427  hypothetical protein  39.13 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2776  hypothetical protein  26.92 
 
 		 838 aa  59.7  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0801  protein of unknown function DUF718  37.38 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.771693 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3314  protein of unknown function DUF718  30 
 
 		 107 aa  48.1  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130115 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3456  hypothetical protein  30.91 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.022732 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5686  L-rhamnose 1-epimerase  22.94 
 
 		 107 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0314  hypothetical protein  30.85 
 
 		 110 aa  45.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2729  hypothetical protein  29.09 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.727532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1027  protein of unknown function DUF718  31.58 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2270  hypothetical protein  26.04 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.767622  normal  0.824523 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3465  hypothetical protein  23.15 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.237628 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3394  hypothetical protein  27.66 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.384678 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3612  protein of unknown function DUF718  26.61 
 
 		 115 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175398  normal  0.641333 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1033  hypothetical protein  23.19 
 
 		 107 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.889586  normal  0.718477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6243  hypothetical protein  37.21 
 
 		 104 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.514773  normal  0.182892 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1067  hypothetical protein  31.58 
 
 		 367 aa  41.6  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0263007  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2457  hypothetical protein  24.55 
 
 		 115 aa  41.2  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4974  hypothetical protein  28.72 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651142  normal  0.112627 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2300  protein of unknown function DUF718  24.07 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.60391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09140  L-rhamnose 1-epimerase  31.67 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.435762  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0240  hypothetical protein  29.47 
 
 		 114 aa  40.8  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2981  L-rhamnose 1-epimerase  27 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0297257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>