25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1887 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1887  transglutaminase domain protein  100 
 
 		 656 aa  1339    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0428  transglutaminase domain protein  31.3 
 
 		 678 aa  326  1e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1592  transglutaminase domain protein  31.84 
 
 		 667 aa  318  2e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.184226 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3999  hypothetical protein  28.79 
 
 		 672 aa  277  4e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0102362  normal  0.153544 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0510  hypothetical protein  28.42 
 
 		 673 aa  254  4.0000000000000004e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.409186  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06980  hypothetical protein  28.89 
 
 		 677 aa  254  5.000000000000001e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06985  hypothetical protein  27.22 
 
 		 678 aa  245  1.9999999999999999e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.56041  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06975  hypothetical protein  23.78 
 
 		 667 aa  177  5e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0540  hypothetical protein  22.03 
 
 		 655 aa  94.7  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.920015  normal  0.216808 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1228  transglutaminase domain protein  22.16 
 
 		 1257 aa  73.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.435864 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0539  hypothetical protein  19.7 
 
 		 664 aa  72  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.330242  normal  0.22108 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1591  hypothetical protein  21.8 
 
 		 632 aa  62.4  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.241475 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3831  hypothetical protein  27.27 
 
 		 672 aa  54.3  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0857  hypothetical protein  28.32 
 
 		 684 aa  50.8  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.121274 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0727  transglutaminase domain protein  24.16 
 
 		 1225 aa  50.4  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3553  hypothetical protein  24.03 
 
 		 672 aa  50.1  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1886  hypothetical protein  20.48 
 
 		 637 aa  48.9  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2363  hypothetical protein  31.82 
 
 		 1028 aa  48.5  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.429657 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0519  hypothetical protein  27.39 
 
 		 1433 aa  48.1  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0514  transglutaminase domain protein  27.39 
 
 		 1431 aa  47.8  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.227327  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3645  transglutaminase-like enzyme; cysteine protease  22.84 
 
 		 659 aa  47.4  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0486  hypothetical protein  29.37 
 
 		 1433 aa  47.4  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175307  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02460  hypothetical protein  24.14 
 
 		 633 aa  47  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0237  tetratricopeptide protein  20.65 
 
 		 1256 aa  45.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2901  hypothetical protein  23.24 
 
 		 658 aa  44.3  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>