178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4031 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4031  potassium-transporting ATPase subunit C  100 
 
 
181 aa  354  5e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.134737  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2244  potassium-transporting ATPase, C subunit  74.03 
 
 
190 aa  265  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.081737  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4159  potassium-transporting ATPase subunit C  75.14 
 
 
185 aa  263  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.411007  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2049  potassium-transporting ATPase subunit C  72.93 
 
 
204 aa  263  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0553231  normal  0.333592 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3484  potassium-transporting ATPase subunit C  73.48 
 
 
183 aa  263  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.744488  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1709  potassium-transporting ATPase subunit C  75.14 
 
 
185 aa  263  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272988  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3731  potassium-transporting ATPase subunit C  72.93 
 
 
183 aa  236  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0724088  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43370  potassium-transporting ATPase subunit C  67.96 
 
 
183 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0320886  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3638  potassium-transporting ATPase subunit C  67.98 
 
 
183 aa  226  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3778  potassium-transporting ATPase, C subunit  46.52 
 
 
190 aa  159  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.962819  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0235  potassium-transporting ATPase subunit C  48 
 
 
201 aa  156  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.738564  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3237  potassium-transporting ATPase subunit C  46.97 
 
 
201 aa  155  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.433479  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2824  potassium-transporting ATPase subunit C  46.73 
 
 
200 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0196  potassium-transporting ATPase subunit C  46.73 
 
 
201 aa  152  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.054482  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0206  potassium-transporting ATPase subunit C  46.73 
 
 
201 aa  151  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156803  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0180  potassium-transporting ATPase subunit C  47 
 
 
201 aa  150  8e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.258059  normal  0.923955 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4240  potassium-transporting ATPase, C subunit  48.65 
 
 
196 aa  150  8.999999999999999e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3411  potassium-transporting ATPase subunit C  45.18 
 
 
201 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6750  potassium-transporting ATPase, C subunit  46.49 
 
 
189 aa  149  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.726202  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2992  potassium-transporting ATPase subunit C  44.78 
 
 
205 aa  149  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.575111  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1246  potassium-transporting ATPase subunit C  46.28 
 
 
189 aa  149  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.13301  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0357  potassium-transporting ATPase, C subunit  50.27 
 
 
220 aa  149  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.029609 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2278  potassium-transporting ATPase, C subunit  47.37 
 
 
193 aa  148  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1085  potassium-transporting ATPase subunit C  48.95 
 
 
191 aa  147  7e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0951803  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0743  potassium-transporting ATPase subunit C  46.77 
 
 
190 aa  147  9e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0718  potassium-transporting ATPase subunit C  46.77 
 
 
190 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.818737 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2940  potassium-transporting ATPase, C subunit  46.77 
 
 
190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1128  potassium-transporting ATPase, C subunit  45.95 
 
 
191 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2960  potassium-transporting ATPase subunit C  46.77 
 
 
190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0789  potassium-transporting ATPase subunit C  46.24 
 
 
190 aa  144  6e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2482  potassium-transporting ATPase, C subunit  44.02 
 
 
189 aa  143  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0722  potassium-transporting ATPase subunit C  45.7 
 
 
190 aa  143  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00653  potassium-transporting ATPase subunit C  45.7 
 
 
190 aa  142  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5838  potassium-transporting ATPase, C subunit  45.41 
 
 
189 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.217383  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00644  hypothetical protein  45.7 
 
 
190 aa  142  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0040  potassium-transporting ATPase subunit C  45.45 
 
 
203 aa  141  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1310  potassium-transporting ATPase subunit C  43.16 
 
 
192 aa  140  9e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.116474 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3384  potassium-transporting ATPase subunit C  46.11 
 
 
204 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0512  potassium-transporting ATPase, C subunit  43.78 
 
 
193 aa  137  8.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00499959  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0664  potassium-transporting ATPase subunit C  46.19 
 
 
201 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1157  potassium-transporting ATPase  50.53 
 
 
193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4647  potassium-transporting ATPase subunit C  43 
 
 
206 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3580  potassium-transporting ATPase subunit C  49.2 
 
 
228 aa  135  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1157  potassium-transporting ATPase subunit C  48.94 
 
 
216 aa  134  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.484246  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3846  potassium-transporting ATPase subunit C  42.16 
 
 
202 aa  134  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04385  potassium-transporting ATPase subunit C  48.37 
 
 
220 aa  134  6.0000000000000005e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.748158  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0812  potassium-transporting ATPase subunit C  43.55 
 
 
194 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112771  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2309  potassium-transporting ATPase subunit C  46.28 
 
 
193 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1104  potassium-transporting ATPase subunit C  49.2 
 
 
200 aa  134  7.000000000000001e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.58934  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0951  potassium-transporting ATPase subunit C  44.72 
 
 
201 aa  134  8e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0752  potassium-transporting ATPase subunit C  43.55 
 
 
194 aa  134  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.369229  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0826  potassium-transporting ATPase subunit C  43.55 
 
 
194 aa  134  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0159409 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0765  potassium-transporting ATPase subunit C  43.55 
 
 
194 aa  134  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0862  potassium-transporting ATPase subunit C  43.55 
 
 
194 aa  134  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2291  K+ transporting ATPase, KdpC subunit  47.85 
 
 
206 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0738481  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5613  potassium-transporting ATPase subunit C  44.68 
 
 
193 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0011063  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4993  potassium-transporting ATPase, C subunit  47.87 
 
 
193 aa  133  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3250  potassium-transporting ATPase subunit C  42.11 
 
 
192 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119209  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11049  potassium-transporting ATPase subunit C  40.53 
 
 
189 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2234  K+-transporting ATPase, C subunit  46.2 
 
 
206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0949721  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1887  potassium-transporting ATPase, C subunit  46.2 
 
 
206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.682911  normal  0.201201 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0832  potassium-transporting ATPase, C subunit  41.67 
 
 
191 aa  133  1.9999999999999998e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2606  potassium-transporting ATPase, C subunit  40.98 
 
 
190 aa  132  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1208  potassium-transporting ATPase subunit C  42.47 
 
 
191 aa  132  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.962371  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0289  potassium-transporting ATPase, C subunit  45.9 
 
 
216 aa  132  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.238341 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0992  potassium-transporting ATPase subunit C  44.15 
 
 
193 aa  131  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2929  potassium-transporting ATPase, C subunit  47.09 
 
 
191 aa  131  6e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.531992  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0065  potassium-transporting ATPase, C subunit  41.05 
 
 
202 aa  130  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1023  potassium-transporting ATPase subunit C  43.09 
 
 
193 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2435  K+ transporting ATPase, KdpC subunit  39.13 
 
 
189 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.324583  normal  0.873018 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1098  potassium-transporting ATPase, C subunit  43.09 
 
 
197 aa  130  7.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1674  potassium-transporting ATPase subunit C  45.21 
 
 
193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2324  potassium-transporting ATPase subunit C  44.15 
 
 
193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2286  potassium-transporting ATPase subunit C  45.21 
 
 
193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.104465  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1668  potassium-transporting ATPase subunit C  40.96 
 
 
189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1225  potassium-transporting ATPase, C subunit  39.67 
 
 
189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3591  potassium-transporting ATPase subunit C  43.68 
 
 
207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.018979  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3269  potassium-transporting ATPase subunit C  43.85 
 
 
207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.24892  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3602  potassium-transporting ATPase, C subunit  49.74 
 
 
196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.810162  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1466  potassium-transporting ATPase, C subunit  45.6 
 
 
196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101256  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0656  potassium-transporting ATPase subunit C  39.04 
 
 
193 aa  129  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2055  potassium-transporting ATPase subunit C  41.8 
 
 
193 aa  127  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.792846 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3493  hypothetical protein  44 
 
 
180 aa  127  7.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1481  potassium-transporting ATPase, C subunit  44.38 
 
 
205 aa  127  7.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2089  potassium-transporting ATPase, C subunit  44.63 
 
 
195 aa  127  8.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0896  potassium-transporting ATPase subunit C  37.23 
 
 
193 aa  127  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.217239  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0811  potassium-transporting ATPase subunit C  37.23 
 
 
193 aa  127  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.700672  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2575  potassium-transporting ATPase, C subunit  42.63 
 
 
197 aa  127  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1873  potassium-transporting ATPase, C subunit  43.09 
 
 
191 aa  127  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0817  potassium-transporting ATPase subunit C  36.7 
 
 
193 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.75663e-53 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0705  potassium-transporting ATPase subunit C  36.7 
 
 
193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0649  potassium-transporting ATPase subunit C  37.89 
 
 
193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0204  potassium-transporting ATPase subunit C  38.12 
 
 
214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0741  potassium-transporting ATPase subunit C  36.7 
 
 
193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.367102  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0055  potassium-transporting ATPase, C subunit  43.55 
 
 
185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6336  potassium-transporting ATPase subunit C  41.58 
 
 
201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  0.0440126 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0648  potassium-transporting ATPase subunit C  36.17 
 
 
193 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.109219  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3971  potassium-transporting ATPase subunit C  40.66 
 
 
199 aa  125  4.0000000000000003e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0485598  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2100  potassium-transporting ATPase, C subunit  44.07 
 
 
207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1960  potassium-transporting ATPase subunit C  40.74 
 
 
191 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0898679  normal  0.449884 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>