16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1830 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1830  hypothetical protein  100 
 
 		 955 aa  1973    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1272  hypothetical protein  27.35 
 
 		 874 aa  169  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2338  hypothetical protein  27.21 
 
 		 874 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000220057  unclonable  0.000000361106 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0450  SMC domain protein  26.52 
 
 		 877 aa  164  8.000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.292453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3707  SMC domain-containing protein  25.03 
 
 		 881 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5366  hypothetical protein  26.09 
 
 		 892 aa  155  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.786314  normal  0.0115994 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1420  hypothetical protein  27.47 
 
 		 874 aa  154  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.542957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1363  SMC protein-like  25.23 
 
 		 875 aa  150  9e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.922778  normal  0.196985 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3982  hypothetical protein  26.81 
 
 		 881 aa  107  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0815711  hitchhiker  0.00348599 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1161  hypothetical protein  36.71 
 
 		 800 aa  57.8  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1085  DNA repair ATPase-like protein  28.19 
 
 		 741 aa  56.2  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0841172  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  23.16 
 
 		 702 aa  48.5  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5100  SMC domain protein  25.71 
 
 		 676 aa  47  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13432  normal  0.797675 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3801  SMC domain-containing protein  25.99 
 
 		 682 aa  44.7  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0420971  hitchhiker  0.000733932 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2668  hypothetical protein  26.07 
 
 		 695 aa  44.7  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4992  hypothetical protein  34.62 
 
 		 881 aa  44.3  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>