26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1409 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1409  general secretion pathway protein  100 
 
 		 187 aa  381  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2864  general secretion pathway protein  78.31 
 
 		 190 aa  285  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.839881  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1468  general secretion pathway protein  42.05 
 
 		 209 aa  143  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1297  general secretion pathway protein  44.55 
 
 		 209 aa  121  7e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2022  putative general secretion pathway protein B  30.85 
 
 		 256 aa  55.1  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000127173  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001612  general secretion pathway protein B  32.35 
 
 		 227 aa  52.4  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.33696  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03090  General secretion pathway protein B  35.94 
 
 		 415 aa  52  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00860  Type II secretory pathway, component ExeA  30.43 
 
 		 240 aa  51.2  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3280  hypothetical protein  30.56 
 
 		 381 aa  50.4  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.539633  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0178  general secretion pathway protein B  31.43 
 
 		 275 aa  47  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.953003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1586  hypothetical protein  29.17 
 
 		 252 aa  46.2  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0836  general secretion pathway protein B  30.43 
 
 		 370 aa  45.8  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.19872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1168  general secretion pathway protein B  32.14 
 
 		 328 aa  45.4  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000621685  hitchhiker  0.00000787826 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2821  general secretion pathway protein B  30.43 
 
 		 420 aa  45.1  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000107284  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2982  general secretion pathway protein B  28.99 
 
 		 369 aa  43.9  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1147  hypothetical protein  31.82 
 
 		 271 aa  43.9  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1201  general secretion pathway protein B  30.3 
 
 		 372 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3156  general secretion pathway protein B  30.3 
 
 		 372 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.997514  normal  0.754225 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1234  general secretion pathway protein B  30.3 
 
 		 372 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0914005  normal  0.846255 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1117  general secretion pathway protein B  29.76 
 
 		 355 aa  43.5  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1157  general secretion pathway protein B  30.3 
 
 		 372 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0472  hypothetical protein  30.3 
 
 		 269 aa  43.5  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4212  putative general secretion pathway protein A  34.52 
 
 		 563 aa  42.7  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1298  general secretion pathway protein B  28.57 
 
 		 368 aa  42.4  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2498  general secretion pathway protein B  29.49 
 
 		 261 aa  42  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000234384 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0973  general secretion pathway protein B  31.88 
 
 		 358 aa  42  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.637256  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>