26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0502 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0502  transcriptional regulator, CopG family  100 
 
 		 96 aa  197  5e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0423  transcriptional regulator, CopG family  95.83 
 
 		 96 aa  187  4e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.416536  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1797  CopG family transcriptional regulator  56.67 
 
 		 94 aa  108  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.50125 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3515  CopG family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 94 aa  106  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1769  CopG family transcriptional regulator  54.44 
 
 		 94 aa  103  7e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3354  CopG family transcriptional regulator  49.44 
 
 		 90 aa  97.8  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.010277  normal  0.252149 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1692  CopG family transcriptional regulator  52.22 
 
 		 94 aa  97.8  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.542112  normal  0.0225811 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1445  CopG family transcriptional regulator  56.63 
 
 		 102 aa  96.3  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2499  hypothetical protein  50.57 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6360  transcriptional regulator, CopG family  50 
 
 		 92 aa  94  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2427  CopG family transcriptional regulator  47.19 
 
 		 100 aa  88.2  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0926  CopG family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 92 aa  87  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4372  CopG family transcriptional regulator  46.59 
 
 		 92 aa  84  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1249  transcriptional regulator-like protein  39.77 
 
 		 121 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000553131  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2575  CopG family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 97 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.888914  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0043  hypothetical protein  37.23 
 
 		 96 aa  73.6  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00427  transcriptional regulator, HTH motif containing  54.1 
 
 		 61 aa  70.9  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0112  hypothetical protein  34.48 
 
 		 89 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0805  hypothetical protein  34.48 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.113601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1216  hypothetical protein  35.63 
 
 		 89 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.676541  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0140  hypothetical protein  32.56 
 
 		 118 aa  57  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0145  hypothetical protein  33.72 
 
 		 89 aa  57  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.399898  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0979  hypothetical protein  38.37 
 
 		 256 aa  50.1  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.346318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2904  CopG family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 94 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000144196  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1962  hypothetical protein  31.46 
 
 		 92 aa  47.8  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1117  transcriptional regulator, CopG family  50 
 
 		 89 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0755433 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>