33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2646 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2646  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  355  1.9999999999999998e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.549676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2566  hypothetical protein  33.61 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348776 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2250  hypothetical protein  35.4 
 
 		 219 aa  62  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.599567  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3261  hypothetical protein  35.51 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2950  hypothetical protein  29.46 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.283763 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2748  hypothetical protein  36.13 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2975  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.701427 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1315  hypothetical protein  32.46 
 
 		 185 aa  57  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.215271  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1942  FlaA locus 229 kDa protein  31.9 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1388  hypothetical protein  29.2 
 
 		 266 aa  54.7  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0881994  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3782  hypothetical protein  30.83 
 
 		 259 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4183  hypothetical protein  32.11 
 
 		 205 aa  52  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1511  hypothetical protein  29.33 
 
 		 255 aa  52  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1688  hypothetical protein  27.27 
 
 		 255 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0687483  normal  0.086166 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1126  hypothetical protein  27.56 
 
 		 267 aa  50.4  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.577564  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1436  hypothetical protein  30.95 
 
 		 258 aa  50.4  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16840  hypothetical protein  26.09 
 
 		 176 aa  50.1  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0372  pdp protein  30.1 
 
 		 177 aa  48.9  0.00004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0184343  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5505  hypothetical protein  27.05 
 
 		 256 aa  47.8  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0370  hypothetical protein  31.07 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4418  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  27.91 
 
 		 254 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1100  hypothetical protein  27.45 
 
 		 241 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.370505  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1187  hypothetical protein  25.71 
 
 		 169 aa  45.1  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1394  hypothetical protein  29.25 
 
 		 325 aa  45.4  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2706  hypothetical protein  26.67 
 
 		 208 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.5213  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0058  hypothetical protein  29.91 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202005 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2008  hypothetical protein  30.66 
 
 		 203 aa  43.9  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1331  hypothetical protein  27.27 
 
 		 229 aa  43.5  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0746592  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2838  hypothetical protein  26.79 
 
 		 238 aa  42.7  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2113  hypothetical protein  31.48 
 
 		 207 aa  42  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.517967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0697  hypothetical protein  28.71 
 
 		 439 aa  41.6  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.261572  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3679  hypothetical protein  26.53 
 
 		 177 aa  41.2  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1396  hypothetical protein  33.33 
 
 		 192 aa  41.2  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>