31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2082 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2082  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  259  6.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0584139 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2834  hypothetical protein  88.98 
 
 		 127 aa  237  4e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1950  putative phage-related protein  48.03 
 
 		 133 aa  134  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3775  putative phage-related protein  29.66 
 
 		 140 aa  70.1  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.111218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1936  putative phage-related protein  29.66 
 
 		 140 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.46577  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0897  LacI family regulatory protein  28.57 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.238169  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  30.58 
 
 		 489 aa  65.5  0.0000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1942  putative bacteriophage-related protein  33.61 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  28.93 
 
 		 500 aa  65.1  0.0000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2778  hypothetical protein  30.08 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0796  resolvase-like protein  30.36 
 
 		 506 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196824  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3173  putative bacteriophage-related protein  33.33 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2927  hypothetical protein  28.46 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.30294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2763  hypothetical protein  27.87 
 
 		 172 aa  50.8  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000498341 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2618  hypothetical protein  22.58 
 
 		 137 aa  50.4  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000782229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2669  hypothetical protein  22.58 
 
 		 137 aa  50.4  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1124  hypothetical protein  25.98 
 
 		 138 aa  50.1  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1226  putative bacteriophage-related protein  26.27 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.856752  normal  0.216639 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2273  hypothetical protein  35.96 
 
 		 158 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.647833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2858  hypothetical protein  23.39 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.817778  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0892  putative phage-related protein  25.41 
 
 		 158 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2088  hypothetical protein  24.6 
 
 		 137 aa  47.8  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.217793  normal  0.0481295 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2274  hypothetical protein  26.89 
 
 		 123 aa  47.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.429487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3231  hypothetical protein  24.35 
 
 		 154 aa  47.4  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.251225  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2632  hypothetical protein  31.15 
 
 		 154 aa  47  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1422  LacI family regulatory protein  27.34 
 
 		 145 aa  46.2  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1399  putative bacteriophage-related protein  35.62 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3248  putative bacteriophage-related protein  32.43 
 
 		 124 aa  43.9  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.767846 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2633  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein, truncation  31.58 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3172  putative bacteriophage-related protein  32.43 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4118  hypothetical protein  26.8 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>