231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1216 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1216  putative lyase/synthase  100 
 
 
356 aa  711    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0144913  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2196  hydrolase, putative  59.77 
 
 
354 aa  431  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.84144  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1385  peptidase M42 family protein  56.86 
 
 
357 aa  429  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2294  peptidase M42  60.29 
 
 
356 aa  426  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.365569  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3125  peptidase M42 family protein  58.82 
 
 
356 aa  427  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.612233  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1943  peptidase M42 family protein  55.74 
 
 
356 aa  409  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0044983  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0763  peptidase M42 family protein  54.75 
 
 
356 aa  402  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776489  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0779  peptidase M42 family protein  55.03 
 
 
356 aa  404  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1966  peptidase M42 family protein  48.18 
 
 
383 aa  333  3e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0048  peptidase M42 family protein  47.19 
 
 
355 aa  322  7e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0058  peptidase M42 family protein  45.51 
 
 
355 aa  310  2e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0349  peptidase M42 family protein  45.63 
 
 
352 aa  310  2e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.326281 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0232  peptidase M42 family protein  44.23 
 
 
352 aa  301  1e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1390  peptidase M42 family protein  42.25 
 
 
354 aa  288  9e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0386243  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1376  peptidase M42 family protein  41.55 
 
 
354 aa  287  2e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376322  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05530  peptidase family protein  40.98 
 
 
411 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.892794  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0999  peptidase M42 family protein  42.94 
 
 
351 aa  286  4e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2744  peptidase M42 family protein  43.71 
 
 
356 aa  283  4.0000000000000003e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.721956  normal  0.0249561 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0738  peptidase M42  43.06 
 
 
353 aa  282  7.000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.511886  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0675  peptidase M42 family protein  43.24 
 
 
359 aa  266  5e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2098  peptidase M42 family protein  42.69 
 
 
353 aa  261  8.999999999999999e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.940358 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0820  peptidase M42 family protein  42.49 
 
 
357 aa  258  8e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1335  peptidase M42 family protein  39.89 
 
 
356 aa  257  2e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.768278  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0712  cellulase  40.34 
 
 
350 aa  250  2e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0214  cellulase  39.77 
 
 
357 aa  246  6e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.880444  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2409  Cellulase  40.23 
 
 
348 aa  245  6.999999999999999e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0368  cellulase  35.31 
 
 
350 aa  240  2e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0158908 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0441  cellulase  34.93 
 
 
350 aa  239  4e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.174946  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2234  peptidase M42 family protein  42.73 
 
 
354 aa  238  9e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.323516 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0934  peptidase M42 family protein  39.88 
 
 
349 aa  238  9e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0468  cellulase  35.59 
 
 
350 aa  238  1e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0307085  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1551  cellulase  35.31 
 
 
350 aa  238  2e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0002  cellulase  38.76 
 
 
365 aa  236  4e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0537  peptidase M42 family protein  38.68 
 
 
359 aa  235  9e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.349139 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2736  peptidase M42 family protein  35.23 
 
 
362 aa  231  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271345  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0354  peptidase M42 family protein  36.55 
 
 
346 aa  231  2e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.326213  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2655  Cellulase  39.09 
 
 
361 aa  230  3e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0709  cellulase  35.98 
 
 
351 aa  230  3e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000744044  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4817  peptidase M42 family protein  36.03 
 
 
356 aa  228  9e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.211256  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1213  peptidase M42 family protein  41.76 
 
 
344 aa  228  1e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0376  peptidase M42 family protein  37.65 
 
 
346 aa  228  2e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0912  peptidase M42  38.82 
 
 
345 aa  227  2e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0608  peptidase M42  38.18 
 
 
349 aa  228  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0364864  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0995  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  37.1 
 
 
349 aa  226  4e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.383048 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1139  peptidase M42 family protein  34.36 
 
 
356 aa  226  6e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.743458 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0313  Cellulase  35.38 
 
 
342 aa  224  1e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0803  Cellulase  39.55 
 
 
362 aa  223  3e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1201  peptidase M42 family protein  39.41 
 
 
345 aa  223  3e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214071  normal  0.0232682 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2768  peptidase M42 family protein  39.54 
 
 
353 aa  222  7e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09738  hydrolase, putative  35.09 
 
 
362 aa  222  8e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0791803  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0558  peptidase, M42 family  37.61 
 
 
361 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000121832  hitchhiker  5.5021500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4402  cellulase  36.54 
 
 
361 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.078585  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4702  M42 family peptidase  37.11 
 
 
361 aa  220  3e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00201284  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4467  M42 family peptidase  36.83 
 
 
361 aa  220  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0619409  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4302  glucanase/ deblocking aminopeptidase  37.11 
 
 
361 aa  220  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000481551  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4815  M42 family peptidase  36.83 
 
 
361 aa  220  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000499602  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4695  peptidase, M42 family  37.11 
 
 
361 aa  220  3e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000157013  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4686  peptidase, M42 family  37.11 
 
 
361 aa  220  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.124679999999999e-51 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4679  peptidase, M42 family  37.32 
 
 
361 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0636  peptidase M42 family protein  34 
 
 
371 aa  219  5e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2346  peptidase M42 family protein  35.76 
 
 
366 aa  219  6e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.917875  normal  0.728573 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1495  Cellulase  35.61 
 
 
353 aa  219  7e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4313  glucanase/ deblocking aminopeptidase  36.83 
 
 
361 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230763  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3257  cellulase  36.26 
 
 
361 aa  216  4e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0950  cellulase  37.78 
 
 
384 aa  215  8e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.374031  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0842  cellulase  40.57 
 
 
362 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1505  cellulase  37.35 
 
 
345 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1676  peptidase M42 family protein  38.66 
 
 
346 aa  212  5.999999999999999e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2043  M42 family peptidase  35.43 
 
 
358 aa  212  9e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0452  cellulase  39.66 
 
 
362 aa  212  1e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.547156  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1432  cellulase  39.11 
 
 
362 aa  211  2e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.26952  normal  0.0787337 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0542  cellulase  39.66 
 
 
362 aa  209  8e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.192278  hitchhiker  0.00117454 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0315  aminopeptidase  33.91 
 
 
359 aa  208  1e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2259  Cellulase  37.61 
 
 
358 aa  206  5e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0943649  unclonable  0.0000000415481 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1994  peptidase M42  36.18 
 
 
354 aa  206  6e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0000914633  normal  0.691904 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4885  glutamyl aminopeptidase  37.11 
 
 
360 aa  205  9e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0252  peptidase M42  38.76 
 
 
350 aa  205  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0378  hypothetical protein  31.27 
 
 
357 aa  204  2e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.978276 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0867  peptidase M42 family protein  36.36 
 
 
382 aa  203  4e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.937418  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1761  peptidase M42 family protein  33.24 
 
 
348 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2482  cellulase  34.75 
 
 
358 aa  201  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000313372  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2531  cellulase  34.75 
 
 
358 aa  201  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000126946  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0378  peptidase M42 family protein  34.02 
 
 
327 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2478  Cellulase  36.29 
 
 
359 aa  199  5e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2766  peptidase M42 family protein  34.74 
 
 
336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0607  peptidase M42  35.59 
 
 
349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.201581  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1045  Glutamyl aminopeptidase  35.8 
 
 
360 aa  196  5.000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0687  Glutamyl aminopeptidase  34.65 
 
 
359 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1324  peptidase M42 family protein  34.21 
 
 
333 aa  194  2e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.229406  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0724  peptidase M42 family protein  36.86 
 
 
350 aa  194  2e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.143036  normal  0.785387 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2745  Glutamyl aminopeptidase  33.81 
 
 
358 aa  192  8e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000840882  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1401  M42 glutamyl aminopeptidase  33.81 
 
 
350 aa  191  1e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.413323  normal  0.234564 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1760  peptidase M42 family protein  34.02 
 
 
328 aa  191  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0609  peptidase M42  38.06 
 
 
325 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.489423  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1677  peptidase M42 family protein  37.68 
 
 
353 aa  189  7e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0546  hypothetical protein  32 
 
 
374 aa  186  4e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1762  peptidase M42 family protein  33.14 
 
 
352 aa  185  8e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.903048  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2767  peptidase M42 family protein  33.43 
 
 
339 aa  185  8e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0590  hypothetical protein  34.29 
 
 
352 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1759  cellulase  34.42 
 
 
339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>