120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1215 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1215  hypothetical protein  100 
 
 
217 aa  428  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000301494  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2353  hypothetical protein  60.87 
 
 
212 aa  254  9e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16801  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1589  hypothetical protein  56.28 
 
 
220 aa  241  7.999999999999999e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.411866  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0584  PHP domain protein  56.81 
 
 
217 aa  240  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.386337  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1192  hypothetical protein  53.37 
 
 
212 aa  231  5e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.13094  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3261  hypothetical protein  55.81 
 
 
215 aa  229  3e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.260936  normal  0.321934 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0812  phosphotransferase domain-containing protein  55.19 
 
 
219 aa  224  7e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1332  hypothetical protein  52.09 
 
 
219 aa  221  6e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.118231 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0472  hypothetical protein  52.94 
 
 
214 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0452288  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1134  hypothetical protein  47.44 
 
 
232 aa  208  5e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1128  hypothetical protein  51.23 
 
 
240 aa  207  1e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2006  hypothetical protein  48.37 
 
 
219 aa  206  3e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.338951 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1549  hypothetical protein  50.5 
 
 
239 aa  206  3e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0859045  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0823  hypothetical protein  50.5 
 
 
239 aa  206  3e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.147938  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0649  phosphotransferase domain-containing protein  47.98 
 
 
217 aa  204  8e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2310  hypothetical protein  51 
 
 
217 aa  201  5e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124143  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1513  hypothetical protein  51 
 
 
214 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.900194 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1415  hypothetical protein  47.94 
 
 
217 aa  194  6e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2482  hypothetical protein  51.53 
 
 
216 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0333  hypothetical protein  48.84 
 
 
218 aa  185  5e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.789522 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2380  hypothetical protein  36.28 
 
 
217 aa  105  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0156206  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1177  phosphotransferase domain-containing protein  24.9 
 
 
243 aa  61.2  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.133886  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3942  PHP domain protein  28.25 
 
 
245 aa  59.7  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000108896  normal  0.54969 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15900  PHP domain protein  26.89 
 
 
246 aa  55.8  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00203207  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1931  PHP domain protein  45.71 
 
 
279 aa  54.7  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.147176  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1085  PHP-like  47.22 
 
 
280 aa  53.5  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000274963  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2251  PHP domain protein  40 
 
 
286 aa  52.8  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.825482  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0818  PHP domain protein  39.24 
 
 
285 aa  51.6  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1922  PHP domain protein  41.67 
 
 
279 aa  50.8  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177162  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2384  PHP family metal-dependent phosphoesterase  40.28 
 
 
278 aa  50.1  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11830  PHP domain protein  42.25 
 
 
270 aa  49.7  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1642  bifunctional DNA polymerase X family protein/ histidinol phosphatase  27.57 
 
 
584 aa  49.3  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0823  hypothetical protein  27.04 
 
 
574 aa  49.3  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1397  hypothetical protein  34.72 
 
 
279 aa  48.9  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2305  phosphotransferase domain-containing protein  40.85 
 
 
288 aa  48.9  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.283665 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0443  phosphoesterase PHP-like  40 
 
 
286 aa  48.5  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.798284  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1599  hypothetical protein  33.33 
 
 
279 aa  48.5  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2311  PHP domain protein  38.89 
 
 
285 aa  48.5  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000176637  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1553  phosphoesterase PHP-like  42.47 
 
 
297 aa  47.8  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.653581  normal  0.211268 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1278  phosphotransferase domain-containing protein  38.89 
 
 
279 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3789  phosphotransferase domain-containing protein  30.23 
 
 
286 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000806386 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1693  PHP domain protein  38.57 
 
 
286 aa  47.8  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1562  PHP domain protein  42.25 
 
 
287 aa  47.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4086  PHP domain protein  36.62 
 
 
264 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0664  phosphotransferase domain-containing protein  37.14 
 
 
286 aa  47.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.770373  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1912  PHP domain protein  36.11 
 
 
293 aa  47  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.657116 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1220  PHP domain protein  42.25 
 
 
280 aa  46.6  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.401834  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2747  PHP-like protein  37.5 
 
 
282 aa  46.2  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000315377  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0722  phosphotransferase domain-containing protein  31.94 
 
 
280 aa  46.6  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2143  phosphotransferase domain-containing protein  38.89 
 
 
235 aa  46.6  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1870  PHP domain protein  35.71 
 
 
286 aa  46.6  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0116618 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1611  DNA polymerase III, alpha subunit  42.11 
 
 
1053 aa  46.2  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3709  putative hydrolase  25.23 
 
 
248 aa  46.2  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000275833  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1326  PHP domain protein  36.11 
 
 
286 aa  46.2  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00676626  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2634  DNA-directed DNA polymerase  28.86 
 
 
583 aa  45.8  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3099  PHP domain protein  60 
 
 
286 aa  45.4  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000891191  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1744  PHP domain protein  47.73 
 
 
286 aa  45.8  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1975  PHP-like  42.47 
 
 
293 aa  45.4  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000544393  normal  0.0436962 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1412  phosphotransferase domain-containing protein  29.35 
 
 
286 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0394495  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22340  PHP domain protein  37.5 
 
 
281 aa  45.4  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2250  phosphotransferase domain-containing protein  54.05 
 
 
286 aa  45.1  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1528  phosphoesterase PHP  53.49 
 
 
287 aa  45.1  0.0009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0724488 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0007  phosphotransferase domain-containing protein  27.86 
 
 
580 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0296814  unclonable  0.000000000565114 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  44.74 
 
 
1165 aa  44.7  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1101  PHP domain protein  41.86 
 
 
286 aa  44.3  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0199  phosphoesterase PHP domain protein  25.29 
 
 
480 aa  44.7  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0987  hypothetical protein  41.86 
 
 
286 aa  44.3  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.561558  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3096  PHP domain protein  38.36 
 
 
275 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.81297  normal  0.0613561 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0756  phosphotransferase domain-containing protein  28.89 
 
 
233 aa  43.9  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.803092  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0735  phosphotransferase domain-containing protein  58.33 
 
 
284 aa  43.5  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.884274  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1644  phosphotransferase domain-containing protein  48.65 
 
 
292 aa  43.9  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1134  DNA-directed DNA polymerase  28.22 
 
 
586 aa  43.9  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.402489  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0958  PHP domain protein  25 
 
 
574 aa  43.5  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0038338  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1448  phosphotransferase domain-containing protein  37.5 
 
 
288 aa  43.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.216828  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2618  phosphotransferase domain-containing protein  47.73 
 
 
291 aa  43.5  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0359  phosphotransferase domain-containing protein  51.35 
 
 
277 aa  43.1  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.663247  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0481  phosphoesterase PHP-like  37.14 
 
 
286 aa  43.1  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.245834  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1973  PHP-like  46.51 
 
 
315 aa  43.1  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.425716  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2986  PHP domain protein  27.96 
 
 
577 aa  43.1  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1061  phosphotransferase domain-containing protein  38.16 
 
 
291 aa  43.1  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.145875  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1420  putative hydrolase  27.19 
 
 
247 aa  43.1  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0157701 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2402  phosphotransferase domain-containing protein  51.35 
 
 
286 aa  43.1  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2721  phosphotransferase domain-containing protein  51.35 
 
 
302 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1436  putative hydrolase  25.89 
 
 
260 aa  43.5  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0681  phosphotransferase domain-containing protein  58.33 
 
 
284 aa  43.5  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255155  normal  0.888291 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2800  phosphotransferase domain-containing protein  51.35 
 
 
302 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.660004  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1064  phosphotransferase domain-containing protein  40 
 
 
270 aa  43.1  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000146557  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1665  PHP domain protein  51.35 
 
 
286 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0193583  hitchhiker  0.000506182 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06590  predicted metal-dependent phosphoesterase, PHP family  39.44 
 
 
295 aa  43.5  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.366833  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1697  PHP family metal-dependent phosphoesterase  46.51 
 
 
293 aa  42.7  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1834  phosphotransferase domain-containing protein  36.11 
 
 
303 aa  42.7  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.297742  normal  0.423951 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3396  phosphotransferase domain-containing protein  36.14 
 
 
283 aa  43.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000330153  normal  0.345304 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1163  PHP domain protein  38.03 
 
 
285 aa  42.7  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.445299  normal  0.321925 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3796  phosphotransferase domain-containing protein  32.88 
 
 
240 aa  42.7  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2382  phosphoesterase domain-containing protein  35.06 
 
 
524 aa  42.7  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02287  PHP domain protein  52.78 
 
 
297 aa  42.7  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.624872  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1266  PHP domain protein  36.62 
 
 
283 aa  42.7  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2957  PHP domain protein  38.57 
 
 
280 aa  42.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05670  DNA polymerase X family protein  21.72 
 
 
573 aa  42.7  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0687  phosphotransferase domain-containing protein  32.39 
 
 
284 aa  42.7  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.134262  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>