106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1332 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1332  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  432  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.118231 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2006  hypothetical protein  73.52 
 
 		 219 aa  328  5.0000000000000004e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.338951 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1589  hypothetical protein  62.84 
 
 		 220 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.411866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0584  PHP domain protein  56.34 
 
 		 217 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.386337  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1215  hypothetical protein  52.09 
 
 		 217 aa  208  4e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000301494  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2353  hypothetical protein  46.6 
 
 		 212 aa  191  9e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16801  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0812  phosphotransferase domain-containing protein  45.23 
 
 		 219 aa  180  2e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0472  hypothetical protein  50.5 
 
 		 214 aa  178  7e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0452288  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2380  hypothetical protein  49.77 
 
 		 217 aa  177  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0156206  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1513  hypothetical protein  45.05 
 
 		 214 aa  176  2e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.900194 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3261  hypothetical protein  46.23 
 
 		 215 aa  168  6e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.260936  normal  0.321934 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0649  phosphotransferase domain-containing protein  40.38 
 
 		 217 aa  165  5e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1192  hypothetical protein  41.78 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.13094  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1549  hypothetical protein  40.78 
 
 		 239 aa  162  3e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0859045  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0823  hypothetical protein  39.72 
 
 		 239 aa  162  3e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.147938  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1128  hypothetical protein  41.06 
 
 		 240 aa  161  6e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2310  hypothetical protein  44 
 
 		 217 aa  159  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1134  hypothetical protein  38.14 
 
 		 232 aa  159  3e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2482  hypothetical protein  43.37 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0333  hypothetical protein  45.62 
 
 		 218 aa  150  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.789522 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1415  hypothetical protein  36.92 
 
 		 217 aa  145  6e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0823  hypothetical protein  29.08 
 
 		 574 aa  62  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1634  phosphotransferase domain-containing protein  29.46 
 
 		 569 aa  61.6  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05670  DNA polymerase X family protein  26.9 
 
 		 573 aa  60.8  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4448  hypothetical protein  26.56 
 
 		 572 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4795  hypothetical protein  26.56 
 
 		 572 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.114766  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3241  hypothetical protein  27.05 
 
 		 572 aa  57  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287288  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4679  hypothetical protein  26.56 
 
 		 572 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0956211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4286  hypothetical protein  26.56 
 
 		 572 aa  56.6  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000879454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4297  hypothetical protein  26.56 
 
 		 572 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.558706  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4679  hypothetical protein  26.56 
 
 		 573 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000348289  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0575  hypothetical protein  26.04 
 
 		 573 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000426901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4666  hypothetical protein  26.56 
 
 		 573 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000070928 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4381  hypothetical protein  26.04 
 
 		 572 aa  55.8  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.150026  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2633  hypothetical protein  28.06 
 
 		 572 aa  55.5  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000221598  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4663  hypothetical protein  26.04 
 
 		 573 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00758489  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1642  bifunctional DNA polymerase X family protein/ histidinol phosphatase  25.25 
 
 		 584 aa  54.3  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1586  DNA Polymerase X family  27.18 
 
 		 594 aa  54.3  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0273065  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0599  DNA-binding/PHP domain-containing protein  27.18 
 
 		 578 aa  54.3  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000111495  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2986  PHP domain protein  30.3 
 
 		 577 aa  53.1  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0650  phosphotransferase domain-containing protein  26.64 
 
 		 570 aa  52.8  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.694552  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1922  PHP domain protein  38.89 
 
 		 279 aa  52.8  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177162  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3942  PHP domain protein  26.13 
 
 		 245 aa  52.4  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000108896  normal  0.54969 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0818  PHP domain protein  41.89 
 
 		 285 aa  50.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0486  phosphotransferase domain-containing protein  25 
 
 		 570 aa  50.1  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1315  phosphotransferase domain-containing protein  27.15 
 
 		 588 aa  49.3  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0486  PHP-like protein  27.69 
 
 		 574 aa  48.9  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1693  PHP domain protein  40 
 
 		 286 aa  48.9  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0726  hypothetical protein  25.91 
 
 		 569 aa  48.5  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2747  PHP-like protein  40.54 
 
 		 282 aa  48.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000315377  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1202  hypothetical protein  26.77 
 
 		 570 aa  48.1  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1224  hypothetical protein  26.77 
 
 		 570 aa  48.1  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0461  PHP domain protein  28.92 
 
 		 240 aa  47  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5838  PHP domain protein  29.41 
 
 		 592 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1748  PHP-like  25.55 
 
 		 650 aa  47.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00399585  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1766  phosphotransferase domain-containing protein  28.29 
 
 		 576 aa  47.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1870  PHP domain protein  37.14 
 
 		 286 aa  47.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116618 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2634  DNA-directed DNA polymerase  32.65 
 
 		 583 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1141  PHP-like  38.57 
 
 		 291 aa  46.6  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000994847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1963  phosphotransferase domain-containing protein  29.35 
 
 		 614 aa  46.2  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.4254  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2251  PHP domain protein  38.57 
 
 		 286 aa  46.6  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.825482  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1730  DNA-directed DNA polymerase  29.41 
 
 		 570 aa  46.6  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0586087  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11830  PHP domain protein  31 
 
 		 270 aa  46.2  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7822  PHP domain protein  40.28 
 
 		 288 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1134  DNA-directed DNA polymerase  31.63 
 
 		 586 aa  45.8  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.402489  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2389  DNA polymerase X family protein  29.41 
 
 		 584 aa  45.8  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.766089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2305  phosphotransferase domain-containing protein  43.66 
 
 		 288 aa  45.8  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.283665 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1064  phosphotransferase domain-containing protein  40 
 
 		 270 aa  45.8  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000146557  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3796  phosphotransferase domain-containing protein  36.99 
 
 		 240 aa  45.4  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1177  phosphotransferase domain-containing protein  24.68 
 
 		 243 aa  45.1  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.133886  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22340  PHP domain protein  35.71 
 
 		 281 aa  45.4  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1326  PHP domain protein  38.89 
 
 		 286 aa  45.1  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00676626  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1397  hypothetical protein  32.43 
 
 		 279 aa  45.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2501  ribonuclease P protein component 3  31.06 
 
 		 239 aa  45.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0929909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1085  PHP-like  40 
 
 		 280 aa  44.7  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000274963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0007  phosphotransferase domain-containing protein  28.22 
 
 		 580 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0296814  unclonable  0.000000000565114 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1503  phosphotransferase domain-containing protein  34.21 
 
 		 294 aa  44.3  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0032645  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0265  PHP domain protein  26.86 
 
 		 578 aa  44.3  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1536  PHP domain protein  48.65 
 
 		 274 aa  44.7  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1213  hypothetical protein  28.36 
 
 		 574 aa  43.9  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.224332  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2382  phosphoesterase domain-containing protein  32.1 
 
 		 524 aa  44.3  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1101  PHP domain protein  46.51 
 
 		 286 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3865  DNA polymerase III PolC  34.17 
 
 		 1433 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00985865  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0987  hypothetical protein  46.51 
 
 		 286 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.561558  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0717  PHP domain protein  40.85 
 
 		 291 aa  44.3  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0221894  normal  0.740121 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1931  PHP domain protein  43.06 
 
 		 279 aa  43.5  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.147176  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3859  DNA polymerase III, alpha subunit  33.33 
 
 		 970 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0710  DNA polymerase X family protein  28.86 
 
 		 642 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.963352  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3640  DNA polymerase III PolC  32.5 
 
 		 1433 aa  43.1  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3916  DNA polymerase III PolC  33.33 
 
 		 1433 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111889  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0250  PHP domain protein  26.36 
 
 		 578 aa  43.1  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00055482 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3096  PHP domain protein  36.99 
 
 		 275 aa  43.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.81297  normal  0.0613561 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4500  trpH family protein  38.03 
 
 		 286 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.655584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2005  DNA polymerase X family/PHP domain-containing protein  28.86 
 
 		 650 aa  42.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1412  phosphotransferase domain-containing protein  38.03 
 
 		 286 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0394495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0076  phosphotransferase domain-containing protein  27.09 
 
 		 580 aa  43.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0741749  normal  0.105314 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3789  phosphotransferase domain-containing protein  38.03 
 
 		 286 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000806386 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1328  DNA polymerase III PolC  33.33 
 
 		 1433 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0462488  hitchhiker  0.0000648048 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2412  PHP-like protein  27.52 
 
 		 223 aa  42.4  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.177718  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1600  PHP domain protein  26.15 
 
 		 580 aa  42.4  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>