201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3261 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3261  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  431  1e-120  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.260936  normal  0.321934 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1192  hypothetical protein  67.77 
 
 
212 aa  303  1.0000000000000001e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.13094  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0472  hypothetical protein  56.81 
 
 
214 aa  249  2e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0452288  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0812  phosphotransferase domain-containing protein  60.68 
 
 
219 aa  248  6e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1513  hypothetical protein  52.13 
 
 
214 aa  230  1e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.900194 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2310  hypothetical protein  54.5 
 
 
217 aa  229  3e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124143  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1128  hypothetical protein  53.02 
 
 
240 aa  223  2e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1549  hypothetical protein  52.34 
 
 
239 aa  220  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0859045  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0823  hypothetical protein  51.87 
 
 
239 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.147938  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1134  hypothetical protein  52.61 
 
 
232 aa  217  8.999999999999998e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2353  hypothetical protein  58.29 
 
 
212 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16801  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1415  hypothetical protein  50.93 
 
 
217 aa  214  7e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1215  hypothetical protein  55.81 
 
 
217 aa  210  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000301494  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2482  hypothetical protein  53.57 
 
 
216 aa  209  4e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0649  phosphotransferase domain-containing protein  50.24 
 
 
217 aa  204  6e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0333  hypothetical protein  51.96 
 
 
218 aa  198  5e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.789522 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1589  hypothetical protein  52.02 
 
 
220 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.411866  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0584  PHP domain protein  52.71 
 
 
217 aa  191  6e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.386337  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2006  hypothetical protein  46.73 
 
 
219 aa  169  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.338951 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1332  hypothetical protein  46.23 
 
 
219 aa  168  6e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.118231 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2380  hypothetical protein  33.49 
 
 
217 aa  81.6  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0156206  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4679  hypothetical protein  29.19 
 
 
572 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0956211  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4448  hypothetical protein  29.19 
 
 
572 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4297  hypothetical protein  29.19 
 
 
572 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.558706  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4795  hypothetical protein  29.19 
 
 
572 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.114766  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4679  hypothetical protein  28.23 
 
 
573 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000348289  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4666  hypothetical protein  29.19 
 
 
573 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000070928 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3241  hypothetical protein  28.71 
 
 
572 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4286  hypothetical protein  29.19 
 
 
572 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000879454  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0575  hypothetical protein  28.23 
 
 
573 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000426901  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4663  hypothetical protein  28.71 
 
 
573 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00758489  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4381  hypothetical protein  28.23 
 
 
572 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.150026  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0823  hypothetical protein  29.02 
 
 
574 aa  63.2  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0076  phosphotransferase domain-containing protein  29.85 
 
 
580 aa  62.8  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0741749  normal  0.105314 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2633  hypothetical protein  27.08 
 
 
572 aa  61.6  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000221598  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0007  phosphotransferase domain-containing protein  26.87 
 
 
580 aa  60.1  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0296814  unclonable  0.000000000565114 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0250  PHP domain protein  33.51 
 
 
578 aa  59.3  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00055482 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1060  putative hydrolase  28.33 
 
 
245 aa  58.9  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.464705  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1177  phosphotransferase domain-containing protein  25.32 
 
 
243 aa  57.8  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.133886  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05670  DNA polymerase X family protein  26.2 
 
 
573 aa  57  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1642  bifunctional DNA polymerase X family protein/ histidinol phosphatase  27.49 
 
 
584 aa  57  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1748  PHP-like  30.7 
 
 
650 aa  56.2  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00399585  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0265  PHP domain protein  32.99 
 
 
578 aa  55.5  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2986  PHP domain protein  28 
 
 
577 aa  55.5  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1922  PHP domain protein  43.66 
 
 
279 aa  54.3  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177162  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1315  phosphotransferase domain-containing protein  29.07 
 
 
588 aa  54.7  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4500  trpH family protein  50 
 
 
286 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.655584  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0726  hypothetical protein  25.32 
 
 
569 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1412  phosphotransferase domain-containing protein  50 
 
 
286 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0394495  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0818  PHP domain protein  42.25 
 
 
285 aa  53.1  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1202  hypothetical protein  26.43 
 
 
570 aa  53.5  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1224  hypothetical protein  26.43 
 
 
570 aa  53.5  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4086  PHP domain protein  41.43 
 
 
264 aa  52.8  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1664  phosphotransferase domain-containing protein  29.28 
 
 
577 aa  52.4  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1599  hypothetical protein  38.03 
 
 
279 aa  51.6  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1634  phosphotransferase domain-containing protein  27.36 
 
 
569 aa  51.6  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1931  PHP domain protein  43.48 
 
 
279 aa  51.6  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.147176  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1085  PHP-like  39.13 
 
 
280 aa  50.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000274963  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1834  phosphotransferase domain-containing protein  43.66 
 
 
303 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.297742  normal  0.423951 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3789  phosphotransferase domain-containing protein  47.14 
 
 
286 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000806386 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1101  PHP domain protein  40 
 
 
286 aa  50.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0987  hypothetical protein  40 
 
 
286 aa  50.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.561558  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2747  PHP-like protein  38.03 
 
 
282 aa  50.1  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000315377  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2250  phosphotransferase domain-containing protein  51.11 
 
 
286 aa  50.8  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3606  PHP domain protein  39.44 
 
 
279 aa  50.8  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3099  PHP domain protein  40.58 
 
 
286 aa  49.7  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000891191  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0599  DNA-binding/PHP domain-containing protein  24.53 
 
 
578 aa  49.7  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000111495  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1622  phosphotransferase domain-containing protein  42.03 
 
 
278 aa  50.1  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0489037  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5440  hypothetical protein  24.88 
 
 
334 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.763333  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2292  putative hydrolase  27.54 
 
 
239 aa  50.1  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11830  PHP domain protein  37.14 
 
 
270 aa  49.7  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2171  PHP domain protein  38.36 
 
 
290 aa  49.7  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1586  DNA Polymerase X family  24.53 
 
 
594 aa  49.7  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0273065  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5061  hypothetical protein  24.88 
 
 
334 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5149  hypothetical protein  24.88 
 
 
334 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4006  phosphotransferase domain-containing protein  45.71 
 
 
286 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000044787 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1644  phosphotransferase domain-containing protein  40.85 
 
 
292 aa  49.3  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3436  phosphotransferase domain-containing protein  40 
 
 
287 aa  48.9  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1665  PHP domain protein  39.44 
 
 
286 aa  48.9  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0193583  hitchhiker  0.000506182 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2305  phosphotransferase domain-containing protein  41.43 
 
 
288 aa  49.3  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.283665 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2700  phosphotransferase domain-containing protein  39.44 
 
 
302 aa  49.3  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2800  phosphotransferase domain-containing protein  39.44 
 
 
302 aa  48.9  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.660004  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2251  PHP domain protein  40.58 
 
 
286 aa  48.9  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.825482  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1931  PHP domain protein  39.44 
 
 
297 aa  48.9  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2721  phosphotransferase domain-containing protein  39.44 
 
 
302 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1687  phosphotransferase domain-containing protein  36.62 
 
 
285 aa  48.9  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2501  ribonuclease P protein component 3  25.22 
 
 
239 aa  48.5  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0929909  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2384  PHP family metal-dependent phosphoesterase  59.46 
 
 
278 aa  48.5  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1061  phosphotransferase domain-containing protein  40.85 
 
 
291 aa  48.9  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.145875  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0722  phosphotransferase domain-containing protein  38.03 
 
 
280 aa  48.5  0.00007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1553  phosphoesterase PHP-like  56.76 
 
 
297 aa  48.5  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.653581  normal  0.211268 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1397  hypothetical protein  36.9 
 
 
279 aa  48.1  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2314  PHP-like  40 
 
 
279 aa  47.8  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1326  PHP domain protein  42.25 
 
 
286 aa  48.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00676626  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19240  predicted metal-dependent phosphoesterase, PHP family  38.67 
 
 
283 aa  48.1  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0196602  hitchhiker  0.0091278 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3396  phosphotransferase domain-containing protein  42.86 
 
 
283 aa  48.1  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000330153  normal  0.345304 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0717  PHP domain protein  42.86 
 
 
291 aa  48.1  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0221894  normal  0.740121 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1487  PHP-like  41.43 
 
 
287 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0371486  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22820  PHP domain-containing protein  45.71 
 
 
295 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.141448 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2028  PHP domain protein  28.74 
 
 
238 aa  47.4  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.731698 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>