179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2028 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2028  PHP domain protein  100 
 
 
238 aa  488  1e-137  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.731698 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1060  putative hydrolase  52.3 
 
 
245 aa  270  1e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.464705  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4253  putative hydrolase  52.36 
 
 
237 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2491  putative hydrolase  52.52 
 
 
248 aa  252  4.0000000000000004e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.130978 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0111  putative hydrolase  49.78 
 
 
241 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2292  putative hydrolase  44.3 
 
 
239 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1950  putative hydrolase  47.21 
 
 
244 aa  224  6e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3933  putative hydrolase  47.44 
 
 
238 aa  217  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00241921  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4017  putative hydrolase  47.66 
 
 
238 aa  217  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.59903e-24 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2586  putative hydrolase  45.06 
 
 
240 aa  214  8e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0073149  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2686  putative hydrolase  42.86 
 
 
252 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.796861  unclonable  0.000044786 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1369  putative hydrolase  43.22 
 
 
251 aa  206  3e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.979942  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0620  putative hydrolase  40.76 
 
 
240 aa  205  4e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000619827  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2880  putative hydrolase  42.86 
 
 
254 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014614 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1503  putative hydrolase  42.86 
 
 
254 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1467  putative hydrolase  42.44 
 
 
254 aa  204  8e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1472  putative hydrolase  42.44 
 
 
254 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.855662  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19230  biotin (acetyl-CoA carboxylase) synthetase  45.19 
 
 
239 aa  203  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0261596  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2233  putative hydrolase  43.1 
 
 
251 aa  202  5e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1652  putative hydrolase  41.18 
 
 
252 aa  196  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2619  putative hydrolase  42.44 
 
 
252 aa  196  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000339322 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1706  putative hydrolase  41.18 
 
 
249 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.946189 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2939  putative hydrolase  42.86 
 
 
246 aa  194  7e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2794  putative hydrolase  42.02 
 
 
252 aa  194  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.165673 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2280  putative hydrolase  40.52 
 
 
245 aa  192  5e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1420  putative hydrolase  39.92 
 
 
247 aa  190  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0157701 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0627  phosphotransferase domain-containing protein  40.59 
 
 
242 aa  189  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000135059  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001417  histidinol phosphatase  41.18 
 
 
248 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3779  PHP domain protein  39.5 
 
 
243 aa  186  3e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.262487  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3709  putative hydrolase  40.34 
 
 
248 aa  186  4e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000275833  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2075  putative hydrolase  40.69 
 
 
245 aa  185  5e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.674909  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1798  putative hydrolase  40.26 
 
 
245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00489097  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3868  putative hydrolase  41.6 
 
 
250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0341145  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2185  putative hydrolase  38.79 
 
 
245 aa  181  8.000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2053  putative hydrolase  38.79 
 
 
245 aa  180  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1436  putative hydrolase  41.95 
 
 
260 aa  180  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2446  putative hydrolase  38.79 
 
 
245 aa  179  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2165  putative hydrolase  38.79 
 
 
245 aa  180  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.213486  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2054  putative hydrolase  40.26 
 
 
245 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0675001  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1232  putative hydrolase  40.26 
 
 
245 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1550  putative hydrolase  39.83 
 
 
245 aa  176  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.115806  normal  0.103219 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2237  putative hydrolase  40.26 
 
 
245 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.616812 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1202  putative hydrolase  40.26 
 
 
245 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.499056  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1247  putative hydrolase  40.26 
 
 
245 aa  174  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.428207 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001195  histidinol phosphatase  35.56 
 
 
251 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04983  putative hydrolase  36.4 
 
 
251 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1934  putative hydrolase  39.22 
 
 
245 aa  174  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000352911  hitchhiker  0.00478063 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0316  putative hydrolase  37.93 
 
 
244 aa  173  1.9999999999999998e-42  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2611  PHP domain protein  38.96 
 
 
245 aa  169  3e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000586023  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0344  putative hydrolase  37.6 
 
 
250 aa  169  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00676194  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0887  putative hydrolase  37.97 
 
 
247 aa  168  7e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214006  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01031  hypothetical protein  38.96 
 
 
245 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01038  hypothetical protein  38.96 
 
 
245 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1412  putative hydrolase  38.96 
 
 
245 aa  167  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0615585 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1152  putative hydrolase  38.96 
 
 
245 aa  167  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0656771  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1153  putative hydrolase  38.96 
 
 
245 aa  167  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2565  putative hydrolase  38.96 
 
 
245 aa  167  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.155213 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2099  putative hydrolase  38.96 
 
 
245 aa  167  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.95835 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2295  putative hydrolase  38.96 
 
 
245 aa  167  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.31426  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0657  PHP domain protein  36.64 
 
 
235 aa  162  3e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0063  phosphotransferase domain-containing protein  33.62 
 
 
236 aa  154  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1177  phosphotransferase domain-containing protein  31.35 
 
 
243 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.133886  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0109  PHP domain protein  27.99 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.165533 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0958  PHP domain protein  26.83 
 
 
574 aa  97.8  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0038338  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15900  PHP domain protein  29.02 
 
 
246 aa  92.4  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00203207  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3942  PHP domain protein  29.57 
 
 
245 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000108896  normal  0.54969 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0486  PHP-like protein  27.35 
 
 
574 aa  88.6  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5838  PHP domain protein  27.54 
 
 
592 aa  86.7  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05670  DNA polymerase X family protein  24.89 
 
 
573 aa  85.1  9e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1730  DNA-directed DNA polymerase  29.06 
 
 
570 aa  85.1  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0586087  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1586  DNA Polymerase X family  25 
 
 
594 aa  81.3  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0273065  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0599  DNA-binding/PHP domain-containing protein  25 
 
 
578 aa  80.9  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000111495  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1963  phosphotransferase domain-containing protein  26.4 
 
 
614 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.4254  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1600  PHP domain protein  25.86 
 
 
580 aa  80.1  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1664  phosphotransferase domain-containing protein  26.25 
 
 
577 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4412  PHP domain protein  28.4 
 
 
579 aa  79.3  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103593  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0901  PHP-like  28.09 
 
 
598 aa  78.6  0.00000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2025  PHP domain protein  26.57 
 
 
275 aa  78.2  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2005  DNA polymerase X family/PHP domain-containing protein  26.1 
 
 
650 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0710  DNA polymerase X family protein  26.1 
 
 
642 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.963352  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0250  PHP domain protein  26.83 
 
 
578 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00055482 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0265  PHP domain protein  26.34 
 
 
578 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0007  phosphotransferase domain-containing protein  28.35 
 
 
580 aa  73.6  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0296814  unclonable  0.000000000565114 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1642  bifunctional DNA polymerase X family protein/ histidinol phosphatase  26.81 
 
 
584 aa  72  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1446  DNA polymerase X  25.32 
 
 
574 aa  70.9  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654387  normal  0.735552 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1213  hypothetical protein  24.15 
 
 
574 aa  69.7  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.224332  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2389  DNA polymerase X family protein  24.69 
 
 
584 aa  69.7  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.766089  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1440  PHP domain protein  27.22 
 
 
576 aa  69.3  0.00000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0200406  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0076  phosphotransferase domain-containing protein  27.89 
 
 
580 aa  69.3  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0741749  normal  0.105314 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2341  PHP domain-containing protein  25.83 
 
 
536 aa  68.9  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0823  hypothetical protein  23.6 
 
 
574 aa  68.9  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1792  DNA-directed DNA polymerase  26.61 
 
 
576 aa  67.4  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.197029  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0575  hypothetical protein  24.05 
 
 
573 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000426901  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0459  phosphotransferase domain-containing protein  32.54 
 
 
586 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4448  hypothetical protein  24.05 
 
 
572 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4795  hypothetical protein  24.05 
 
 
572 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.114766  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4381  hypothetical protein  24.05 
 
 
572 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.150026  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4679  hypothetical protein  24.05 
 
 
572 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0956211  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4666  hypothetical protein  24.05 
 
 
573 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000070928 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1154  phosphotransferase domain-containing protein  24.46 
 
 
578 aa  66.2  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000251601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>