106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2006 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2006  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  435  1e-121  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.338951 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1332  hypothetical protein  73.52 
 
 		 219 aa  328  5.0000000000000004e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.118231 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1589  hypothetical protein  61.57 
 
 		 220 aa  256  2e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.411866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0584  PHP domain protein  55.81 
 
 		 217 aa  242  3e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.386337  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1215  hypothetical protein  48.37 
 
 		 217 aa  199  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000301494  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1513  hypothetical protein  47.5 
 
 		 214 aa  184  7e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.900194 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2353  hypothetical protein  43.13 
 
 		 212 aa  181  7e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16801  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0649  phosphotransferase domain-containing protein  43.72 
 
 		 217 aa  178  7e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0812  phosphotransferase domain-containing protein  45.73 
 
 		 219 aa  177  9e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0472  hypothetical protein  46.85 
 
 		 214 aa  176  3e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0452288  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2380  hypothetical protein  48.86 
 
 		 217 aa  169  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0156206  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3261  hypothetical protein  46.73 
 
 		 215 aa  169  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.260936  normal  0.321934 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1128  hypothetical protein  45 
 
 		 240 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1134  hypothetical protein  40.47 
 
 		 232 aa  165  4e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0823  hypothetical protein  43.72 
 
 		 239 aa  166  4e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.147938  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1549  hypothetical protein  42.71 
 
 		 239 aa  161  6e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0859045  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2310  hypothetical protein  43.35 
 
 		 217 aa  160  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1192  hypothetical protein  43 
 
 		 212 aa  158  6e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.13094  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0333  hypothetical protein  47.5 
 
 		 218 aa  156  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.789522 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1415  hypothetical protein  39.69 
 
 		 217 aa  156  3e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2482  hypothetical protein  44.39 
 
 		 216 aa  154  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1634  phosphotransferase domain-containing protein  28.77 
 
 		 569 aa  56.6  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3942  PHP domain protein  25.68 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000108896  normal  0.54969 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05670  DNA polymerase X family protein  24.9 
 
 		 573 aa  54.3  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4412  PHP domain protein  29.22 
 
 		 579 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0823  hypothetical protein  24.37 
 
 		 574 aa  52  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0461  PHP domain protein  27.86 
 
 		 240 aa  51.2  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4679  hypothetical protein  25.51 
 
 		 573 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000348289  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1922  PHP domain protein  59.46 
 
 		 279 aa  51.6  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177162  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4448  hypothetical protein  26.02 
 
 		 572 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4795  hypothetical protein  26.02 
 
 		 572 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.114766  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1177  phosphotransferase domain-containing protein  25.1 
 
 		 243 aa  50.4  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.133886  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0818  PHP domain protein  38.89 
 
 		 285 aa  50.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4679  hypothetical protein  26.02 
 
 		 572 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0956211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4286  hypothetical protein  26.02 
 
 		 572 aa  50.1  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000879454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4297  hypothetical protein  26.02 
 
 		 572 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.558706  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4666  hypothetical protein  26.02 
 
 		 573 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000070928 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2986  PHP domain protein  29.59 
 
 		 577 aa  49.7  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2389  DNA polymerase X family protein  29.36 
 
 		 584 aa  49.3  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.766089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3241  hypothetical protein  26.02 
 
 		 572 aa  49.7  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287288  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0575  hypothetical protein  23.96 
 
 		 573 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000426901  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1730  DNA-directed DNA polymerase  28.51 
 
 		 570 aa  49.3  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0586087  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1503  phosphotransferase domain-containing protein  36.84 
 
 		 294 aa  49.3  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0032645  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4381  hypothetical protein  25.51 
 
 		 572 aa  48.9  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.150026  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1870  PHP domain protein  38.57 
 
 		 286 aa  49.3  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116618 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2633  hypothetical protein  24.35 
 
 		 572 aa  49.3  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000221598  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5838  PHP domain protein  28.9 
 
 		 592 aa  48.5  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2747  PHP-like protein  43.06 
 
 		 282 aa  48.5  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000315377  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0650  phosphotransferase domain-containing protein  25.35 
 
 		 570 aa  48.5  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.694552  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6300  DNA-directed DNA polymerase  27.27 
 
 		 560 aa  48.5  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984431  normal  0.143587 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4663  hypothetical protein  25.51 
 
 		 573 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00758489  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11830  PHP domain protein  38.03 
 
 		 270 aa  48.1  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2501  ribonuclease P protein component 3  28.11 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0929909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1315  phosphotransferase domain-containing protein  26.56 
 
 		 588 aa  48.1  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1693  PHP domain protein  38.57 
 
 		 286 aa  47.8  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1748  PHP-like  25.21 
 
 		 650 aa  47.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00399585  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0724  HisJ family histidinol phosphate phosphatase  29.25 
 
 		 265 aa  46.6  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2251  PHP domain protein  37.14 
 
 		 286 aa  46.6  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.825482  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0486  phosphotransferase domain-containing protein  34.25 
 
 		 570 aa  45.8  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3789  phosphotransferase domain-containing protein  38.03 
 
 		 286 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000806386 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3096  PHP domain protein  39.73 
 
 		 275 aa  45.8  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.81297  normal  0.0613561 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4500  trpH family protein  38.03 
 
 		 286 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.655584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1412  phosphotransferase domain-containing protein  38.03 
 
 		 286 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0394495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1326  PHP domain protein  38.89 
 
 		 286 aa  45.1  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00676626  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2305  phosphotransferase domain-containing protein  42.25 
 
 		 288 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.283665 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0722  phosphotransferase domain-containing protein  37.84 
 
 		 280 aa  45.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1586  DNA Polymerase X family  23.4 
 
 		 594 aa  44.3  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0273065  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0599  DNA-binding/PHP domain-containing protein  23.4 
 
 		 578 aa  44.3  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000111495  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1101  PHP domain protein  48.84 
 
 		 286 aa  44.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1600  PHP domain protein  24.58 
 
 		 580 aa  44.7  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2902  PHP domain protein  29.68 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0987  hypothetical protein  48.84 
 
 		 286 aa  44.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.561558  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0726  hypothetical protein  22.77 
 
 		 569 aa  43.5  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1397  hypothetical protein  30.56 
 
 		 279 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1642  bifunctional DNA polymerase X family protein/ histidinol phosphatase  23.21 
 
 		 584 aa  43.5  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2314  PHP-like  36.62 
 
 		 279 aa  43.9  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1202  hypothetical protein  25.6 
 
 		 570 aa  43.9  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1224  hypothetical protein  25.6 
 
 		 570 aa  43.9  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0681  phosphotransferase domain-containing protein  39.44 
 
 		 284 aa  43.9  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255155  normal  0.888291 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2634  DNA-directed DNA polymerase  28.72 
 
 		 583 aa  43.5  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4006  phosphotransferase domain-containing protein  38.03 
 
 		 286 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000044787 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1119  phosphoesterase PHP-like  27.95 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.299975  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0481  phosphoesterase PHP-like  37.14 
 
 		 286 aa  43.5  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.245834  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0664  phosphotransferase domain-containing protein  34.29 
 
 		 286 aa  43.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.770373  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22340  PHP domain protein  34.29 
 
 		 281 aa  43.1  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1536  PHP domain protein  48.65 
 
 		 274 aa  43.1  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1599  hypothetical protein  30.56 
 
 		 279 aa  42.7  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0735  phosphotransferase domain-containing protein  38.03 
 
 		 284 aa  42.7  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.884274  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6605  DNA-directed DNA polymerase  27.98 
 
 		 586 aa  42.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.403533  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1220  PHP domain protein  39.44 
 
 		 280 aa  42.4  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.401834  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1973  PHP-like  38.03 
 
 		 315 aa  42  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.425716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1697  PHP family metal-dependent phosphoesterase  38.03 
 
 		 293 aa  42  0.007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1231  PHP-like  32.39 
 
 		 281 aa  42  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000070762  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  36.62 
 
 		 1426 aa  42  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1064  phosphotransferase domain-containing protein  57.14 
 
 		 270 aa  42  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000146557  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4577  phosphotransferase domain-containing protein  42.5 
 
 		 387 aa  42  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0604176  normal  0.4279 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0107  putative metal-dependent phosphoesterse  34.29 
 
 		 297 aa  42  0.007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.592258  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0359  phosphotransferase domain-containing protein  51.35 
 
 		 277 aa  42  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.663247  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3835  PHP domain protein  42.19 
 
 		 291 aa  42  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.476897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7822  PHP domain protein  38.89 
 
 		 288 aa  42  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>