178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2310 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2310  hypothetical protein  100 
 
 
217 aa  438  9.999999999999999e-123  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124143  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0472  hypothetical protein  65.57 
 
 
214 aa  285  5e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0452288  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0333  hypothetical protein  66.98 
 
 
218 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.789522 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2482  hypothetical protein  63.08 
 
 
216 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1513  hypothetical protein  54.67 
 
 
214 aa  248  5e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.900194 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1192  hypothetical protein  50.94 
 
 
212 aa  229  2e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.13094  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3261  hypothetical protein  54.5 
 
 
215 aa  229  3e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.260936  normal  0.321934 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0812  phosphotransferase domain-containing protein  53.92 
 
 
219 aa  222  3e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0649  phosphotransferase domain-containing protein  49.53 
 
 
217 aa  215  2.9999999999999998e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1128  hypothetical protein  49.04 
 
 
240 aa  207  1e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1134  hypothetical protein  46.01 
 
 
232 aa  205  5e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1549  hypothetical protein  47.62 
 
 
239 aa  202  3e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0859045  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0823  hypothetical protein  49.01 
 
 
239 aa  202  3e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.147938  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1589  hypothetical protein  53.43 
 
 
220 aa  201  7e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.411866  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1415  hypothetical protein  49.23 
 
 
217 aa  201  9e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1215  hypothetical protein  51 
 
 
217 aa  191  7e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000301494  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2353  hypothetical protein  46.57 
 
 
212 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16801  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0584  PHP domain protein  49 
 
 
217 aa  182  3e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.386337  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1332  hypothetical protein  44 
 
 
219 aa  159  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.118231 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2006  hypothetical protein  43.35 
 
 
219 aa  160  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.338951 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2380  hypothetical protein  32.35 
 
 
217 aa  81.6  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0156206  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1177  phosphotransferase domain-containing protein  26.81 
 
 
243 aa  68.2  0.00000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.133886  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3374  PHP domain protein  27.96 
 
 
349 aa  59.3  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2986  PHP domain protein  28.43 
 
 
577 aa  58.5  0.00000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1748  PHP-like  26.63 
 
 
650 aa  53.9  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00399585  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0076  phosphotransferase domain-containing protein  27.8 
 
 
580 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0741749  normal  0.105314 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2171  PHP domain protein  43.84 
 
 
290 aa  53.1  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2501  ribonuclease P protein component 3  26.46 
 
 
239 aa  52.4  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0929909  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6300  DNA-directed DNA polymerase  28.21 
 
 
560 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984431  normal  0.143587 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0395  hypothetical protein  28.22 
 
 
339 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0442  PHP domain protein  40 
 
 
321 aa  51.2  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000416884 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2384  PHP family metal-dependent phosphoesterase  40.85 
 
 
278 aa  50.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0687  phosphotransferase domain-containing protein  41.89 
 
 
284 aa  50.4  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.134262  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0818  PHP domain protein  40.54 
 
 
285 aa  50.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13892  hypothetical protein  26.37 
 
 
335 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3942  PHP domain protein  28.12 
 
 
245 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000108896  normal  0.54969 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2311  phosphotransferase domain-containing protein  42.25 
 
 
310 aa  50.1  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1718  hypothetical protein  35.14 
 
 
278 aa  49.7  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4086  PHP domain protein  36.11 
 
 
264 aa  49.7  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2041  phosphotransferase domain-containing protein  42.25 
 
 
311 aa  49.7  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.67494  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5440  hypothetical protein  24.66 
 
 
334 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.763333  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1121  hypothetical protein  25.46 
 
 
334 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1930  phosphotransferase domain-containing protein  42.25 
 
 
299 aa  50.1  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4865  hypothetical protein  28.45 
 
 
332 aa  49.3  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.113999  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3017  TrpH family protein  30 
 
 
286 aa  48.9  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05670  DNA polymerase X family protein  25.46 
 
 
573 aa  48.9  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1931  PHP domain protein  42.47 
 
 
297 aa  48.5  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19240  predicted metal-dependent phosphoesterase, PHP family  39.13 
 
 
283 aa  48.5  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0196602  hitchhiker  0.0091278 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5061  hypothetical protein  24.66 
 
 
334 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5149  hypothetical protein  24.66 
 
 
334 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2126  DNA-directed DNA polymerase  32.32 
 
 
562 aa  48.5  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.403637  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0735  phosphotransferase domain-containing protein  40.54 
 
 
284 aa  48.5  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.884274  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1432  phosphotransferase domain-containing protein  37.68 
 
 
277 aa  48.5  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2389  DNA polymerase X family protein  26.67 
 
 
584 aa  48.1  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.766089  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0250  PHP domain protein  27.55 
 
 
578 aa  47.8  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00055482 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2203  phosphotransferase domain-containing protein  41.89 
 
 
298 aa  47.8  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000209881 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1867  putative phosphoesterase  41.1 
 
 
293 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000652478 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1687  phosphotransferase domain-containing protein  39.73 
 
 
285 aa  47.8  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1642  bifunctional DNA polymerase X family protein/ histidinol phosphatase  23.35 
 
 
584 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1922  PHP domain protein  40.58 
 
 
279 aa  47  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177162  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1463  phosphotransferase domain-containing protein  40.85 
 
 
286 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1529  phosphotransferase domain-containing protein  40.85 
 
 
286 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.70197  normal  0.0178812 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5687  hypothetical protein  24.58 
 
 
335 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0196791 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2402  phosphotransferase domain-containing protein  39.44 
 
 
286 aa  47  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1586  DNA Polymerase X family  23.62 
 
 
594 aa  47  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0273065  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2666  phosphotransferase domain-containing protein  36.62 
 
 
295 aa  47  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000470189 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0599  DNA-binding/PHP domain-containing protein  23.62 
 
 
578 aa  47  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000111495  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2397  Ribonuclease P  25.76 
 
 
230 aa  46.6  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.9766  normal  0.743062 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0823  hypothetical protein  24.87 
 
 
574 aa  46.6  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1425  putative phosphoesterase  40.54 
 
 
282 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.769482  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1911  putative phosphoesterase  40.54 
 
 
282 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000200072 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2309  PHP domain protein  39.44 
 
 
290 aa  46.2  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244375  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1061  phosphotransferase domain-containing protein  38.03 
 
 
291 aa  46.2  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.145875  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0958  PHP domain protein  26 
 
 
574 aa  46.2  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0038338  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0987  hypothetical protein  37.68 
 
 
286 aa  45.8  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.561558  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1848  putative phosphoesterase  40.54 
 
 
282 aa  45.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0559727  hitchhiker  0.000620806 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1521  phosphotransferase domain-containing protein  39.44 
 
 
286 aa  45.8  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0120017 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1101  PHP domain protein  37.68 
 
 
286 aa  45.8  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2747  PHP-like protein  36.49 
 
 
282 aa  45.8  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000315377  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1914  phosphotransferase domain-containing protein  37.68 
 
 
275 aa  45.8  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.629211  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3096  PHP domain protein  38.03 
 
 
275 aa  45.8  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.81297  normal  0.0613561 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1375  putative phosphoesterase  39.73 
 
 
286 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1853  putative phosphoesterase  39.73 
 
 
282 aa  45.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.25144 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1607  putative phosphoesterase  39.73 
 
 
282 aa  45.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000728178 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01240  hypothetical protein  39.73 
 
 
293 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2383  PHP domain protein  39.73 
 
 
293 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00108738  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1898  putative phosphoesterase  39.73 
 
 
293 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000460558 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2362  phosphotransferase domain-containing protein  39.73 
 
 
293 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000319693 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1490  putative phosphoesterase  39.73 
 
 
286 aa  45.4  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1931  PHP domain protein  40.58 
 
 
279 aa  45.4  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.147176  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01250  hypothetical protein  39.73 
 
 
293 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1465  putative phosphoesterase  39.73 
 
 
286 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.200678  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1730  DNA-directed DNA polymerase  26.22 
 
 
570 aa  45.4  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0586087  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0681  phosphotransferase domain-containing protein  37.84 
 
 
284 aa  45.4  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255155  normal  0.888291 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1860  PHP domain protein  33.33 
 
 
219 aa  45.4  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.942057  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0359  phosphotransferase domain-containing protein  54.05 
 
 
277 aa  45.4  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.663247  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3099  PHP domain protein  39.13 
 
 
286 aa  45.1  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000891191  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1085  PHP-like  37.68 
 
 
280 aa  45.4  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000274963  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1315  phosphotransferase domain-containing protein  26.4 
 
 
588 aa  45.4  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15900  PHP domain protein  24.37 
 
 
246 aa  45.1  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00203207  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>