180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0395 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0395  hypothetical protein  100 
 
 		 339 aa  682    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0614  hypothetical protein  76.32 
 
 		 344 aa  527  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00333574 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4395  hypothetical protein  64.2 
 
 		 337 aa  420  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5440  hypothetical protein  57.94 
 
 		 334 aa  378  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.763333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5061  hypothetical protein  58.28 
 
 		 334 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5149  hypothetical protein  58.28 
 
 		 334 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1064  hypothetical protein  57.52 
 
 		 339 aa  377  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13892  hypothetical protein  59 
 
 		 335 aa  376  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5687  hypothetical protein  56.21 
 
 		 335 aa  374  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0196791 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1121  hypothetical protein  55.19 
 
 		 334 aa  369  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0226  hypothetical protein  55.59 
 
 		 356 aa  366  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.171941  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3374  PHP domain protein  56.97 
 
 		 349 aa  360  2e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4865  hypothetical protein  58.04 
 
 		 332 aa  358  8e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.113999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0198  hypothetical protein  54.55 
 
 		 356 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0448  PHP domain protein  56.34 
 
 		 357 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1522  hypothetical protein  61.01 
 
 		 378 aa  347  2e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.975012  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4036  hypothetical protein  57.18 
 
 		 381 aa  346  4e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06190  hypothetical protein  55.85 
 
 		 360 aa  338  7e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1901  PHP domain protein  52.31 
 
 		 347 aa  302  6.000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0486  PHP-like protein  45.85 
 
 		 574 aa  192  5e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1075  PHP domain protein  42.98 
 
 		 584 aa  192  7e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0823  hypothetical protein  40.68 
 
 		 574 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0250  PHP domain protein  41.7 
 
 		 578 aa  189  4e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00055482 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0265  PHP domain protein  41.18 
 
 		 578 aa  189  7e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1315  phosphotransferase domain-containing protein  40 
 
 		 588 aa  189  9e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1748  PHP-like  43.23 
 
 		 650 aa  188  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00399585  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05670  DNA polymerase X family protein  41.28 
 
 		 573 aa  183  3e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1105  DNA-dependent DNA polymerase family X protein  40.68 
 
 		 557 aa  183  4.0000000000000006e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0282445  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6300  DNA-directed DNA polymerase  41.44 
 
 		 560 aa  183  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984431  normal  0.143587 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2633  hypothetical protein  39.48 
 
 		 572 aa  182  7e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000221598  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3241  hypothetical protein  38.56 
 
 		 572 aa  182  7e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287288  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1814  PHP domain protein  38.72 
 
 		 571 aa  182  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.873874  normal  0.593252 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1586  DNA Polymerase X family  39.06 
 
 		 594 aa  179  4e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0273065  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0599  DNA-binding/PHP domain-containing protein  39.06 
 
 		 578 aa  179  4.999999999999999e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000111495  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1642  bifunctional DNA polymerase X family protein/ histidinol phosphatase  41.2 
 
 		 584 aa  179  9e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4381  hypothetical protein  37.71 
 
 		 572 aa  178  9e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.150026  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4297  hypothetical protein  37.29 
 
 		 572 aa  178  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.558706  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4679  hypothetical protein  37.29 
 
 		 572 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0956211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4286  hypothetical protein  37.29 
 
 		 572 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000879454  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4666  hypothetical protein  37.29 
 
 		 573 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000070928 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1792  DNA-directed DNA polymerase  41.03 
 
 		 576 aa  177  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.197029  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0007  phosphotransferase domain-containing protein  40.83 
 
 		 580 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0296814  unclonable  0.000000000565114 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0575  hypothetical protein  36.86 
 
 		 573 aa  177  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000426901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4663  hypothetical protein  37.29 
 
 		 573 aa  177  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00758489  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4679  hypothetical protein  37.29 
 
 		 573 aa  176  5e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000348289  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0076  phosphotransferase domain-containing protein  40.83 
 
 		 580 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0741749  normal  0.105314 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4448  hypothetical protein  36.86 
 
 		 572 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4795  hypothetical protein  36.86 
 
 		 572 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.114766  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2389  DNA polymerase X family protein  38.37 
 
 		 584 aa  173  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.766089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5838  PHP domain protein  44.74 
 
 		 592 aa  174  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0230  PHP-like protein  42.36 
 
 		 569 aa  172  9e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.4179  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0081  family X DNA polymerase IV  37.39 
 
 		 563 aa  171  1e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.439053  normal  0.0727641 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0486  phosphotransferase domain-containing protein  37.29 
 
 		 570 aa  172  1e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0829  PHP-like  42.92 
 
 		 580 aa  171  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3075  PHP domain protein  39.67 
 
 		 558 aa  170  4e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216052 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1723  PHP domain protein  42.44 
 
 		 560 aa  169  7e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00699818  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1963  phosphotransferase domain-containing protein  42.49 
 
 		 614 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.4254  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1213  hypothetical protein  40.43 
 
 		 574 aa  167  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.224332  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4543  PHP domain protein  44.04 
 
 		 582 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00710379 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1766  phosphotransferase domain-containing protein  44.68 
 
 		 576 aa  167  2e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1634  phosphotransferase domain-containing protein  37.55 
 
 		 569 aa  168  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4410  PHP domain protein  44.04 
 
 		 582 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.969464 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0901  PHP-like  39.91 
 
 		 598 aa  166  4e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3104  DNA polymerase X family protein  42.06 
 
 		 576 aa  166  5e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.533704  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2703  PHP domain protein  42.06 
 
 		 576 aa  166  5e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00677466  hitchhiker  0.00000000129938 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1664  phosphotransferase domain-containing protein  38.56 
 
 		 577 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2044  PHP domain protein  38.53 
 
 		 557 aa  165  9e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0958  PHP domain protein  40.17 
 
 		 574 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0038338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1446  DNA polymerase X  40.95 
 
 		 574 aa  164  3e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654387  normal  0.735552 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2126  DNA-directed DNA polymerase  39.92 
 
 		 562 aa  164  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.403637  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1948  PHP domain protein  38.33 
 
 		 576 aa  164  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.453444  normal  0.722452 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0112  PHP domain protein  41.18 
 
 		 562 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2634  DNA-directed DNA polymerase  39.08 
 
 		 583 aa  162  9e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4013  phosphotransferase domain-containing protein  40.66 
 
 		 578 aa  162  9e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5653  PHP domain protein  39.02 
 
 		 572 aa  160  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4412  PHP domain protein  36.33 
 
 		 579 aa  159  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2830  PHP domain protein  38.82 
 
 		 577 aa  158  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0650  phosphotransferase domain-containing protein  34.89 
 
 		 570 aa  158  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.694552  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1131  PHP domain protein  38.46 
 
 		 532 aa  158  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1600  PHP domain protein  34.21 
 
 		 580 aa  157  3e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2005  DNA polymerase X family/PHP domain-containing protein  40.77 
 
 		 650 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0710  DNA polymerase X family protein  40.77 
 
 		 642 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.963352  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1323  PHP domain protein  35.47 
 
 		 582 aa  155  8e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0726  hypothetical protein  34.65 
 
 		 569 aa  153  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2341  PHP domain-containing protein  38.46 
 
 		 536 aa  150  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0618  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  42.73 
 
 		 740 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.138492  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1786  phosphotransferase domain-containing protein  39.24 
 
 		 543 aa  150  3e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1134  DNA-directed DNA polymerase  36.13 
 
 		 586 aa  150  4e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.402489  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1597  hypothetical protein  36.56 
 
 		 566 aa  149  6e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1389  PHP domain protein  41.56 
 
 		 592 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.460658  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2560  phosphoesterase, PHP-like  41.56 
 
 		 592 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.708367  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1288  PHP domain protein  41.56 
 
 		 592 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0703959  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1154  phosphotransferase domain-containing protein  41.08 
 
 		 578 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000251601  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6605  DNA-directed DNA polymerase  39.57 
 
 		 586 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.403533  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1730  DNA-directed DNA polymerase  37 
 
 		 570 aa  147  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0586087  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1609  PHP-like protein  40.5 
 
 		 572 aa  145  8.000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.379827 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1302  phosphotransferase domain-containing protein  40.09 
 
 		 589 aa  145  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1440  PHP domain protein  34.76 
 
 		 576 aa  144  2e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0200406  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1202  hypothetical protein  31.86 
 
 		 570 aa  144  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1224  hypothetical protein  31.86 
 
 		 570 aa  144  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>