More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3789 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_3789  phosphotransferase domain-containing protein  100 
 
 
286 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000806386 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4006  phosphotransferase domain-containing protein  94.41 
 
 
286 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000044787 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1412  phosphotransferase domain-containing protein  93.36 
 
 
286 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0394495  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4500  trpH family protein  93.01 
 
 
286 aa  547  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.655584  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3586  phosphoesterase PHP, N-terminal:PHP, C-terminal  77.54 
 
 
287 aa  461  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.604486  normal  0.45236 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1810  PHP domain protein  77.54 
 
 
287 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1487  PHP-like  76.14 
 
 
287 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0371486  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1834  phosphotransferase domain-containing protein  73.85 
 
 
303 aa  431  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.297742  normal  0.423951 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22820  PHP domain-containing protein  73.84 
 
 
295 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.141448 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1926  hypothetical protein  73.84 
 
 
295 aa  423  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.117831  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15640  Phosphoesterase (PHP family)  67.83 
 
 
287 aa  385  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.3789  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1718  hypothetical protein  42.96 
 
 
278 aa  233  3e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1878  phosphotransferase domain-containing protein  47 
 
 
288 aa  228  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2384  PHP family metal-dependent phosphoesterase  44.69 
 
 
278 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2314  PHP-like  40.93 
 
 
279 aa  207  1e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1877  PHP-like protein  42.91 
 
 
284 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1231  PHP-like  39.29 
 
 
281 aa  199  6e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000070762  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1140  hypothetical protein  40.57 
 
 
286 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3396  phosphotransferase domain-containing protein  41.64 
 
 
283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000330153  normal  0.345304 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1064  PHP-like protein  40.94 
 
 
322 aa  195  8.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0429351  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1078  PHP domain protein  41.79 
 
 
286 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0351695  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2721  phosphotransferase domain-containing protein  39.27 
 
 
302 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1665  PHP domain protein  39.21 
 
 
286 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0193583  hitchhiker  0.000506182 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2800  phosphotransferase domain-containing protein  39.27 
 
 
302 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.660004  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0883  TrpH protein  38.01 
 
 
269 aa  193  3e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.33957  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0150  phosphotransferase domain-containing protein  45.05 
 
 
282 aa  191  1e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0982  PHP domain protein  41.43 
 
 
286 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.727883  normal  0.091006 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2700  phosphotransferase domain-containing protein  38.91 
 
 
302 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1432  phosphotransferase domain-containing protein  39.43 
 
 
277 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2828  PHP-like  38.08 
 
 
288 aa  188  8e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2703  metal-dependent phosphoesterase  40.14 
 
 
276 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2624  putative phosphoesterase  40.14 
 
 
276 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2666  phosphotransferase domain-containing protein  39.86 
 
 
295 aa  187  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000470189 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1683  phosphoesterase, putative  40.14 
 
 
276 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.478385  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2402  phosphotransferase domain-containing protein  38.85 
 
 
286 aa  187  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3132  putative phosphoesterase  40.14 
 
 
276 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322538  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1458  putative phosphoesterase  40.14 
 
 
276 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.525021  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2570  putative phosphoesterase  40.14 
 
 
276 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2185  putative phosphoesterase  40.14 
 
 
276 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1599  hypothetical protein  38.52 
 
 
279 aa  186  3e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2203  phosphotransferase domain-containing protein  39.72 
 
 
298 aa  186  4e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000209881 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3707  phosphotransferase domain-containing protein  39.21 
 
 
287 aa  185  7e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1397  hypothetical protein  37.81 
 
 
279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2553  PHP domain protein  37.99 
 
 
276 aa  183  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000196897  normal  0.153793 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2309  PHP domain protein  37.96 
 
 
290 aa  183  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244375  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3274  phosphotransferase domain-containing protein  38.13 
 
 
287 aa  183  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.156936  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0687  phosphotransferase domain-containing protein  42.75 
 
 
284 aa  182  4.0000000000000006e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.134262  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1155  hypothetical protein  37.01 
 
 
281 aa  182  7e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.405335  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1100  PHP, C-terminal  38.85 
 
 
281 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2462  PHP, C-terminal  38.77 
 
 
295 aa  181  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.735424  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1174  phosphotransferase domain-containing protein  38.71 
 
 
279 aa  180  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806701  decreased coverage  0.000000145397 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1626  phosphotransferase domain-containing protein  39.49 
 
 
303 aa  180  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2763  PHP domain protein  37.94 
 
 
292 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.417679  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3236  PHP-like  40.5 
 
 
319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2756  hypothetical protein  38.41 
 
 
287 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.308411  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3431  phosphotransferase domain-containing protein  37.94 
 
 
292 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1580  hypothetical protein  37.5 
 
 
276 aa  179  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126849  normal  0.792239 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0359  phosphotransferase domain-containing protein  42.03 
 
 
277 aa  177  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.663247  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2582  phosphotransferase domain-containing protein  38.27 
 
 
298 aa  177  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00424426 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2449  PHP-like protein  37.41 
 
 
286 aa  176  3e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1430  phosphotransferase domain-containing protein  36.73 
 
 
286 aa  177  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5411  phosphotransferase domain-containing protein  37.85 
 
 
287 aa  176  5e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.861836 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02287  PHP domain protein  37.86 
 
 
297 aa  175  6e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.624872  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4021  PHP domain protein  37.46 
 
 
285 aa  175  7e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2041  phosphotransferase domain-containing protein  37.89 
 
 
311 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.67494  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1930  phosphotransferase domain-containing protein  37.89 
 
 
299 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2311  phosphotransferase domain-containing protein  37.72 
 
 
310 aa  172  3.9999999999999995e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02756  hypothetical protein  35.48 
 
 
292 aa  172  3.9999999999999995e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0844  phosphotransferase domain-containing protein  35.94 
 
 
282 aa  172  5.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2171  PHP domain protein  38.55 
 
 
290 aa  171  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1528  phosphoesterase PHP  40.5 
 
 
287 aa  170  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0724488 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1463  phosphotransferase domain-containing protein  38.41 
 
 
286 aa  170  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1490  putative phosphoesterase  36.49 
 
 
286 aa  170  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1061  phosphotransferase domain-containing protein  36.82 
 
 
291 aa  171  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.145875  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3017  TrpH family protein  38.41 
 
 
286 aa  170  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5406  PHP-like metal-dependent phosphoesterase  39.06 
 
 
279 aa  170  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.272926  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5977  PHP-like  37.89 
 
 
279 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2250  phosphotransferase domain-containing protein  36.96 
 
 
286 aa  170  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1529  phosphotransferase domain-containing protein  38.41 
 
 
286 aa  169  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.70197  normal  0.0178812 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2100  phosphotransferase domain-containing protein  37.89 
 
 
279 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2008  PHP domain protein  37.59 
 
 
296 aa  170  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.208855  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1931  PHP domain protein  37.59 
 
 
297 aa  169  5e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2118  phosphotransferase domain-containing protein  37.89 
 
 
279 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317755 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1898  putative phosphoesterase  36.52 
 
 
293 aa  168  7e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000460558 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1687  phosphotransferase domain-containing protein  36 
 
 
285 aa  168  8e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1644  phosphotransferase domain-containing protein  34.78 
 
 
292 aa  168  9e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1005  PHP-like  36.69 
 
 
286 aa  168  9e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117289 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1465  putative phosphoesterase  36.49 
 
 
286 aa  167  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.200678  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1901  phosphoesterase, putative  39.92 
 
 
276 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1683  PHP domain protein  38.35 
 
 
301 aa  168  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1521  phosphotransferase domain-containing protein  38.41 
 
 
286 aa  167  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0120017 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2128  PHP-like protein  36.1 
 
 
286 aa  167  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1375  putative phosphoesterase  36.49 
 
 
286 aa  167  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01240  hypothetical protein  36.52 
 
 
293 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2383  PHP domain protein  36.52 
 
 
293 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00108738  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3521  phosphotransferase domain-containing protein  33.33 
 
 
301 aa  167  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2362  phosphotransferase domain-containing protein  36.52 
 
 
293 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000319693 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0707  PHP-like protein  42.09 
 
 
297 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.421553  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01250  hypothetical protein  36.52 
 
 
293 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1867  putative phosphoesterase  36.52 
 
 
293 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000652478 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>